Regiões Ortólogas em Múltiplos Genomas
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2004 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFMS |
Texto Completo: | https://repositorio.ufms.br/handle/123456789/477 |
Resumo: | Este trabalho apresenta uma metodologia para encontrar regiões contíguas de genes entre vários genomas, que evolutivamente conservam a ordem e o conteúdo gênico. Tais regiões, por terem se preservado ao longo da evolução, são descritas como potenciais detentoras de funcionalidades em organismos procariotos evolutivamente próximos. A principal contribuição do trabalho consiste num algoritmo baseado na abordagem do problema de cliques maximais em grafos para a determinação de regiões de genes conservados entre múltiplos genomas. Um sistema via web foi desenvolvido para permitir ao usuário realizar as comparações entre múltiplos genomas e visualizar graficamente os resultados obtidos. |
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2011-09-08T18:33:51Z2021-09-30T19:57:56Z2004https://repositorio.ufms.br/handle/123456789/477Este trabalho apresenta uma metodologia para encontrar regiões contíguas de genes entre vários genomas, que evolutivamente conservam a ordem e o conteúdo gênico. Tais regiões, por terem se preservado ao longo da evolução, são descritas como potenciais detentoras de funcionalidades em organismos procariotos evolutivamente próximos. A principal contribuição do trabalho consiste num algoritmo baseado na abordagem do problema de cliques maximais em grafos para a determinação de regiões de genes conservados entre múltiplos genomas. Um sistema via web foi desenvolvido para permitir ao usuário realizar as comparações entre múltiplos genomas e visualizar graficamente os resultados obtidos.This work presents a methodology for finding contiguous gene regions of several genomes with conserved gene order and content. Because of their conservation through evolution, such regions are putative functional in closely related procaryote organisms. The main contribution of this work is an algorithm based on a maximal clique problem approach to find the regions, from regions found in pairwise genome comparison, besides a web system where the user can choose some organisms to be compared.porGenomasBioinformáticaAlgorítmos GenéticosRegiões Ortólogas em Múltiplos Genomasinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisAlmeida Junior, Nalvo Franco deMontera, Lucianainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFMSinstname:Universidade Federal de Mato Grosso do Sul (UFMS)instacron:UFMSTHUMBNAILLuciana Montera.pdf.jpgLuciana Montera.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1286https://repositorio.ufms.br/bitstream/123456789/477/4/Luciana%20Montera.pdf.jpg2d1a3919141ff973813f4773a3fed054MD54TEXTLuciana Montera.pdf.txtLuciana Montera.pdf.txtExtracted texttext/plain92754https://repositorio.ufms.br/bitstream/123456789/477/3/Luciana%20Montera.pdf.txtc226232a41133e62ee1b45041d9a3e3eMD53ORIGINALLuciana Montera.pdfLuciana Montera.pdfapplication/pdf440700https://repositorio.ufms.br/bitstream/123456789/477/1/Luciana%20Montera.pdf5b61c5b662ebb324229da085564bdaa0MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://repositorio.ufms.br/bitstream/123456789/477/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52123456789/4772021-09-30 15:57:56.19oai:repositorio.ufms.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufms.br/oai/requestri.prograd@ufms.bropendoar:21242021-09-30T19:57:56Repositório Institucional da UFMS - Universidade Federal de Mato Grosso do Sul (UFMS)false |
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