Avaliação da microbiota intestinal em pacientes pediátricos submetidos a transplante de células-tronco hematopoiéticas

• Autor(a) principal: Morkis, Iuri Vicente Camargo
• Data de Publicação: 2019
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/196654
• topic: Transplante de células-tronco hematopoéticas; Microbioma gastrointestinal; Criança; Adolescente; Gut microbiota; GVHD; Bacterial diversity; Hematopoietic stem cell transplantation

Introdução: A microbiota intestinal exerce papel importante na regulação do sistema imune e metabolismo do TGI. No TCTH, é afetada por múltiplos fatores, como condicionamento, antibióticos e nutrição. O estudo teve como objetivo caracterizar a microbiota intestinal em pacientes pediátricos submetidos a TCTH. Metodologia: Pacientes entre 4 a 17 anos submetidos ao TCTH foram incluídos na pesquisa. O critério de exclusão foi não possuir uma amostra adequada de fezes pré-transplante. Duas amostras fecais foram coletadas; uma antes do TCTH, assim que o paciente internou, e a outra no D28 pós transplante. As amostras foram congeladas a -80ºC, para posterior extração de DNA bacteriano e amplificação da região hipervariável V4 do gene 16S rRNA bacteriano. Os produtos de PCR foram sequenciados no equipamento Ion Torrent Personal Genome Machine (PGM) System (Life Technologies, Carlsbad, CA, USA. Os dados de sequenciamento foram processados utilizando o software QIIME, de acordo com as recomendações do Brazilian Microbiome Project (BMP). A determinação taxonômica das OTUs foi realizada com o classificador RDP, com índice de confiança de 0,8. Resultados: Treze pacientes foram avaliados. Os filos predominantes foram Bacteroidetes, Firmicutes e Proteobacteria. Houve dominação intestinal por Enterobacteriaceae em dois pacientes (que foram a óbito) e Lactobacillales em um paciente (DECHa de TGI). O índice de alfa diversidade foi mais baixo nos pacientes com pior desfecho clínico, com exceção do paciente com predomínio de Bifidobacterium. A análise de diversidade beta demonstrou grandes mudanças na composição bacteriana nos momentos pré e pós TCTH. Discussão: A dominação intestinal por bactérias de Enterobacteriaceae e Lactobacillales antes do TCTH foi observada nos pacientes com piores desfechos (DECHa e óbito), bem como depleção de espécies protetoras do filo Firmicutes. Estudos posteriores que definam a relação causal entre disbiose e desfecho clínico no TCTH são necessários para adoção de intervenções terapêuticas.