Implantação da técnica de PCR em tempo real (Sistema TaqMan) para dengue tipo 3 (DENV-3) e vigilância virológica na estado do Rio de Janeiro nos anos 2004-2005
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Data de Publicação: | 2006 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
Texto Completo: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/35891 |
Resumo: | Neste estudo são apresentados a implantação da técnica de PCR em tempo real (Sistema TaqMan\2122) para o vírus dengue tipo 3 (DENV-3), a qual constitui uma nova abordagem no diagnóstico de dengue no país. Esta técnica foi aplicada a 30 amostras de fígado provenientes de 28 casos fatais ocorridos durante a epidemia de dengue de 2002 no estado do Rio de Janeiro, sendo o vírus DENV-3 o único sorotipo identificado e admitido como o agente etiológico daquela casuística. A positividade dos casos por esta nova metodologia 64,2% (18/28), foi superior quando comparados a outras metodologias como o PCR convencional (RT-PCR) que confirmou 29,6% (8/27) e o isolamento viral 7,6% (2/26). Na mesma população a imunohistoquímica confirmou 63,6% (14/22) dos casos. Esses dados demonstram a importância do PCR em tempo real em tecidos na confirmação de casos fatais suspeitos de dengue e confirmou seis casos os quais resultaram negativos por outros métodos A Vigilância Virológica no período 2004-2005 envolveu 839 casos suspeitos de dengue sendo confirmados 4% (34/839) considerando-se o isolamento viral e/ou RT-PCR. Considerando-se cada metodologia, o isolamento viral confirmou 0,4% (3/723) e o RT-PCR 3,8% (31/815). O DENV-3 foi o único sorotipo identificado no período 2004-2005. Entretanto, a maior circulação do vírus ocorreu em 2005 com dois surtos, um deles no município de Campos dos Goytacazes (Região Norte Fluminense) e o outro no município do Rio de Janeiro, com dois óbitos confirmados. A caracterização genética das amostras confirmou o genótipo III, o mesmo circulante até o momento no estado do Rio de Janeiro. |
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Araújo, Josélio Maria Galvão deNogueira, Maria RibeiroFilippis, Ana Maria Bispo de2019-09-25T18:45:02Z2019-09-25T18:45:02Z2006ARAÚJO, Josélio Maria Galvão de. Implantação da técnica de PCR em tempo real (Sistema TaqMan) para dengue tipo 3 (DENV-3) e vigilância virológica na estado do Rio de Janeiro nos anos 2004-2005. 2006. 112 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular)-Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2006.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/35891Neste estudo são apresentados a implantação da técnica de PCR em tempo real (Sistema TaqMan\2122) para o vírus dengue tipo 3 (DENV-3), a qual constitui uma nova abordagem no diagnóstico de dengue no país. Esta técnica foi aplicada a 30 amostras de fígado provenientes de 28 casos fatais ocorridos durante a epidemia de dengue de 2002 no estado do Rio de Janeiro, sendo o vírus DENV-3 o único sorotipo identificado e admitido como o agente etiológico daquela casuística. A positividade dos casos por esta nova metodologia 64,2% (18/28), foi superior quando comparados a outras metodologias como o PCR convencional (RT-PCR) que confirmou 29,6% (8/27) e o isolamento viral 7,6% (2/26). Na mesma população a imunohistoquímica confirmou 63,6% (14/22) dos casos. Esses dados demonstram a importância do PCR em tempo real em tecidos na confirmação de casos fatais suspeitos de dengue e confirmou seis casos os quais resultaram negativos por outros métodos A Vigilância Virológica no período 2004-2005 envolveu 839 casos suspeitos de dengue sendo confirmados 4% (34/839) considerando-se o isolamento viral e/ou RT-PCR. Considerando-se cada metodologia, o isolamento viral confirmou 0,4% (3/723) e o RT-PCR 3,8% (31/815). O DENV-3 foi o único sorotipo identificado no período 2004-2005. Entretanto, a maior circulação do vírus ocorreu em 2005 com dois surtos, um deles no município de Campos dos Goytacazes (Região Norte Fluminense) e o outro no município do Rio de Janeiro, com dois óbitos confirmados. A caracterização genética das amostras confirmou o genótipo III, o mesmo circulante até o momento no estado do Rio de Janeiro.In this study, the implantation of Real Time PCR (TaqMan™ System) for dengue virus type 3 (DENV-3) is presented, which constitutes a new approach to dengue diagnosis in Brazil. This technique was applied to 30 liver samples originating from 28 fatal cases occurring during the dengue epidemic of 2002 due to DENV-3 in Rio de Janeiro State. DENV-3 was the only serotype identified as the etiological agent of this casuistic. Positivity in 64.2% (18/28) of cases by this new methodology was higher when compared to other methodologies like conventional PCR (RT-PCR), which confirmed 29.6% (8/27), and viral isolation, 7.6% (2/26). In the same population, immunohistochemistry verified DENV-3 in 63.6% (14/22) of cases. These data demonstrate the importance of Real Time PCR on tissues in the confirmation of dengue fatal cases and confirmed six cases that showed negative results by the other methods. Virological Surveillance involved 839 suspected dengue cases in the period 2004-2005, with 4% (34/839) confirmed considering viral isolation and/or RT-PCR. When considering each methodology, viral isolation confirmed 0.4% (3/723) and RT-PCR 3.8% (31/815). DENV-3 was the only serotype identified in the period 2004-2005. However, greater circulation of the virus occurred in 2005 with two outbreaks, one in the municipality of Campos dos Goytacazes (Northern Fluminense Region) and the other in the City of Rio de Janeiro, with two confirmed death. Genetic characterization of the samples showed genotype III, the same which is in circulation at present in Rio de Janeiro State.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porDengueVigilância epidemiológicaReação em cadeia da PolimeraseImplantação da técnica de PCR em tempo real (Sistema TaqMan) para dengue tipo 3 (DENV-3) e vigilância virológica na estado do Rio de Janeiro nos anos 2004-2005info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2006Instituto Oswaldo CruzFundação Oswaldo CruzRio de JaneiroPrograma de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecularinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35891/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALjoselio_araujo_ioc_mest_2006.pdfapplication/pdf2431240https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35891/2/joselio_araujo_ioc_mest_2006.pdf139a9e849cbd8a88088d1c36292eff12MD52TEXTjoselio_araujo_ioc_mest_2006.pdf.txtjoselio_araujo_ioc_mest_2006.pdf.txtExtracted texttext/plain192842https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35891/3/joselio_araujo_ioc_mest_2006.pdf.txtba782da52a8a1ce4dcbe9641c94a58c0MD53icict/358912019-09-26 02:02:17.39oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352019-09-26T05:02:17Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false |
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