Perfis transcricionais associados à imunização com a vacina BCG e modulação do gene RAB11A na tuberculose
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Data de Publicação: | 2022 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
Texto Completo: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/57512 |
Resumo: | INTRODUÇÃO: A tuberculose (TB) é uma doença de difícil controle e os mecanismos envolvidos na progressão da doença não são totalmente estabelecidos. Transcriptomas vem sendo estudados com o objetivo de identificar potenciais alvos que auxiliem no entendimento dos processos envolvidos na TB e no desenvolvimento de estratégias para o combate da doença. Não há dados na literatura sobre como a vacinação com a BCG, apontada com a capacidade de modular a resposta do hospedeiro, pode impactar nestes estudos. OBJETIVO: Identificar os perfis transcricionais associados à imunização com a vacina BCG e à tuberculose e o possível papel do gene RAB11A na doença. MATERIAL E MÉTODOS: Duas metanálises utilizando dados de transcriptoma de sangue total obtidos nos repositórios GEO e SRA NCBI foram conduzidos para identificação de genes diferencialmente expressos dentro do grupo de indivíduos vacinados e não vacinados com a BCG que possuíam as formas ativa e latente da TB e controles não infectados. Validação experimental e avaliações in vitro foram conduzidas para avaliação em especial do gene RAB11A. RESULTADOS: Na metanálise do GEO, ao comparar os grupos dos controles, dos indivíduos com TB ativa e latente que não foram vacinados, observou-se 100 genes (92 modulados negativamente e 8 modulados positivamente), associados principalmente com vias e funções ligadas ao metabolismo. Já entre os indivíduos vacinados, comparando-se os mesmos grupos, foram observados 53 genes, sendo 18 superexpressos e 35 subexpressos, associados principalmente aos processos de imunidade. Para a metanálise pelo SRA, verifica-se também perfis gênicos distintos ligados à vacina, com 5 genes subexpressos identificados para os vacinados e 2 genes (1 super e 1 subexpresso) para os não vacinados. Um dos genes apontados na metanálise como superexpresso em indivíduos com a TB ativa e não vacinados com a BCG, quando comparados àqueles vacinados, o RAB11A, também foi apontado com valores médios de expressão maiores em indivíduos com o mesmo perfil, em amostras de sangue total de uma coorte de pacientes da nossa população, corroborando com os dados da metanálise. Valores de expressão deste gene também foram menores em células THP-1 infectadas com a cepa vacinal BCG em comparação com as não infectadas. CONCLUSÃO: A imunização prévia com a vacina BCG interfere na modulação de genes específicos do hospedeiro, em especial para o gene RAB11A, um alvo que merece ser melhor estudado na tuberculose |
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Mota, Scarlet Torres MoraesBessa, Theolis Costa Barbosa2023-03-23T12:47:01Z2023-03-23T12:47:01Z2022MOTA, Scarlet Torres Moraes. Perfis transcricionais associados à imunização com a vacina BCG e modulação do gene RAB11A na tuberculose. 2022. 96 f. Tese (Doutorado em Patologia Humana e Experimental)-Instituto Gonçalo Moniz, Fundação Oswaldo Cruz, Salvador, 2022.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/57512INTRODUÇÃO: A tuberculose (TB) é uma doença de difícil controle e os mecanismos envolvidos na progressão da doença não são totalmente estabelecidos. Transcriptomas vem sendo estudados com o objetivo de identificar potenciais alvos que auxiliem no entendimento dos processos envolvidos na TB e no desenvolvimento de estratégias para o combate da doença. Não há dados na literatura sobre como a vacinação com a BCG, apontada com a capacidade de modular a resposta do hospedeiro, pode impactar nestes estudos. OBJETIVO: Identificar os perfis transcricionais associados à imunização com a vacina BCG e à tuberculose e o possível papel do gene RAB11A na doença. MATERIAL E MÉTODOS: Duas metanálises utilizando dados de transcriptoma de sangue total obtidos nos repositórios GEO e SRA NCBI foram conduzidos para identificação de genes diferencialmente expressos dentro do grupo de indivíduos vacinados e não vacinados com a BCG que possuíam as formas ativa e latente da TB e controles não infectados. Validação experimental e avaliações in vitro foram conduzidas para avaliação em especial do gene RAB11A. RESULTADOS: Na metanálise do GEO, ao comparar os grupos dos controles, dos indivíduos com TB ativa e latente que não foram vacinados, observou-se 100 genes (92 modulados negativamente e 8 modulados positivamente), associados principalmente com vias e funções ligadas ao metabolismo. Já entre os indivíduos vacinados, comparando-se os mesmos grupos, foram observados 53 genes, sendo 18 superexpressos e 35 subexpressos, associados principalmente aos processos de imunidade. Para a metanálise pelo SRA, verifica-se também perfis gênicos distintos ligados à vacina, com 5 genes subexpressos identificados para os vacinados e 2 genes (1 super e 1 subexpresso) para os não vacinados. Um dos genes apontados na metanálise como superexpresso em indivíduos com a TB ativa e não vacinados com a BCG, quando comparados àqueles vacinados, o RAB11A, também foi apontado com valores médios de expressão maiores em indivíduos com o mesmo perfil, em amostras de sangue total de uma coorte de pacientes da nossa população, corroborando com os dados da metanálise. Valores de expressão deste gene também foram menores em células THP-1 infectadas com a cepa vacinal BCG em comparação com as não infectadas. CONCLUSÃO: A imunização prévia com a vacina BCG interfere na modulação de genes específicos do hospedeiro, em especial para o gene RAB11A, um alvo que merece ser melhor estudado na tuberculoseINTRODUCTION: Tuberculosis (TB) is a disease difficult to manage and the mechanisms involved in disease progression are not fully established. Transcriptomes have been studied with the objective of identifying potential targets that help in the understanding of the processes involved in TB and in the development of strategies against disease. There is no data in the literature on how BCG vaccination, which has been shown to have the ability to modulate the host response, may impact these studies. AIM: To identify the transcriptional profiles associated with immunization BCG and tuberculosis and the possible role of the RAB11A gene in the disease. MATERIAL AND METHODS: Two meta-analyses using whole blood transcriptome data obtained from the GEO and SRA NCBI repositories were conducted to identify differentially expressed genes within the group of BCG vaccinated and unvaccinated individuals who had active and latent forms of TB and non-infected controls. Experimental validation and in vitro evaluations were conducted to evaluate of the RAB11A gene. RESULTS: In the GEO meta-analyses, when comparing the groups of controls, individuals with active and latent TB that were unvaccinated, 100 genes were observed (92 down-regulated and 8 up-regulated), mainly associated with pathways and functions linked to metabolism. Among vaccinated individuals, comparing the same groups, 53 genes were observed, being 18 overexpressed and 35 underexpressed, mainly linked to immunity processes. For the SRA meta-analysis, distinct vaccine-linked gene profiles were also verified, with 5 underexpressed genes identified for the vaccinated and 2 genes (1 over and 1 underexpressed) for the unvaccinated. One of the genes identified in the meta-analysis as overexpressed in individuals with active TB and unvaccinated with BCG, when compared to those vaccinated, RAB11A, was also identified with higher mean expression values in individuals with the same profile, in whole blood samples from a cohort of patients in our population, corroborating the meta-analysis data. Expression values of this gene were also lower in THP-1 cells infected with the BCG vaccine strain compared to non-infected ones. CONCLUSION: Prior immunization with the BCG vaccine interferes with the modulation of specific host genes, especially for the RAB11A gene, a target that deserves to be better studied in tuberculosisCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Brasil (CAPES). Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia (FAPESB).Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil.porTuberculoseBCGExpressão gênicaRAB11TuberculosisBCGGene expressionRAB11TuberculoseBcgExpressão GênicaPerfis transcricionais associados à imunização com a vacina BCG e modulação do gene RAB11A na tuberculoseTranscriptional profiles associated with immunization BCG and RAB11A modulation in tuberculosisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis2022Instituto Gonçalo MonizSalvadorPrograma de Pós-Graduação em Patologia Humana e Experimentalinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/57512/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALscarlet_mota_fioba_dout_2022.pdfapplication/pdf2002588https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/57512/2/scarlet_mota_fioba_dout_2022.pdf091888fa82482f0fac60869823657fedMD52icict/575122023-03-23 09:47:02.554oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352023-03-23T12:47:02Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false |
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