Detection and mapping of a lethal locus in a eucalyptus hybrid population

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Rosado, Tatiana Barbosa
Data de Publicação: 2011
Outros Autores: Tomaz, Rafael Simões, Rocha, Rodrigo Barros, Rosado, Antônio Marcos, Alves, Alexandre Alonso, de Araújo, Elza Fernandes, Alfenas, Acelino Couto, Cruz, Cosme Damião
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
Texto Completo: https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/9960
Resumo: The objective of this work was to verify the existence of a lethal locus in a eucalyptus hybrid population, and to quantify the segregation distortion in the linkage group 3 of the Eucalyptus genome. A E. grandis x E. urophylla hybrid population, which segregates for rust resistance, was genotyped with 19 microsatellite markers belonging to linkage group 3 of the Eucalyptus genome. To quantify the segregation distortion, maximum likelihood (ML) models, specific to outbreeding populations, were used. These models consider the observed marker genotypes and the lethal locus viability as parameters. The ML solutions were obtained using the expectation‑maximization algorithm. A lethal locus in the linkage group 3 was verified and mapped, with high confidence, between the microssatellites EMBRA 189 e EMBRA 122. This lethal locus causes an intense gametic selection from the male side. Its map position is 25 cM from the locus which controls the rust resistance in this population.
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spelling Detection and mapping of a lethal locus in a eucalyptus hybrid populationDetecção e mapeamento de loco letal em população híbrida de eucaliptoEucalyptus; gametic selection; genetic mapping; QTL; rust resistance; segregation distortionEucalyptus; seleção gamética; mapeamento genético; QTL; resistência à ferrugem; distorção de segregaçãoThe objective of this work was to verify the existence of a lethal locus in a eucalyptus hybrid population, and to quantify the segregation distortion in the linkage group 3 of the Eucalyptus genome. A E. grandis x E. urophylla hybrid population, which segregates for rust resistance, was genotyped with 19 microsatellite markers belonging to linkage group 3 of the Eucalyptus genome. To quantify the segregation distortion, maximum likelihood (ML) models, specific to outbreeding populations, were used. These models consider the observed marker genotypes and the lethal locus viability as parameters. The ML solutions were obtained using the expectation‑maximization algorithm. A lethal locus in the linkage group 3 was verified and mapped, with high confidence, between the microssatellites EMBRA 189 e EMBRA 122. This lethal locus causes an intense gametic selection from the male side. Its map position is 25 cM from the locus which controls the rust resistance in this population.O objetivo deste trabalho foi verificar a existência de loco letal, em uma população hibrída de eucalipto, e quantificar a distorção de segregação no grupo de ligação 3 do genoma de Eucalyptus. Uma população híbrida de E. grandis x E. urophylla, que segrega quanto à resistência à ferrugem, foi genotipada com 19 marcadores microssatélites do grupo de ligação 3 do genoma de Eucalyptus. Para quantificar a distorção de segregação, modelos de máxima verossimilhança (ML), específicos para população exogâmica, foram utilizados. Esses modelos consideram os genótipos dos marcadores observados e o loco letal como parâmetros. As soluções ML foram obtidas por meio do algoritmo de esperança e maximização. Um loco letal, no grupo de ligação 3, foi verificado e mapeado com alta confiabilidade entre os microssatélites EMBRA 189 e EMBRA 122. Este loco letal causa intensa seleção gamética no genitor masculino. Nessa população, sua posição é de 25 cM de distância do loco que controla a resistência à ferrugem.Pesquisa Agropecuaria BrasileiraPesquisa Agropecuária BrasileiraCNPq FAPEMIGRosado, Tatiana BarbosaTomaz, Rafael SimõesRocha, Rodrigo BarrosRosado, Antônio MarcosAlves, Alexandre Alonsode Araújo, Elza FernandesAlfenas, Acelino CoutoCruz, Cosme Damião2011-12-12info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttps://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/9960Pesquisa Agropecuaria Brasileira; v.46, n.9, set. 2011; 1021-1028Pesquisa Agropecuária Brasileira; v.46, n.9, set. 2011; 1021-10281678-39210100-104xreponame:Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)instacron:EMBRAPAenghttps://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/9960/6560https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/downloadSuppFile/9960/5257info:eu-repo/semantics/openAccess2014-06-10T18:20:09Zoai:ojs.seer.sct.embrapa.br:article/9960Revistahttp://seer.sct.embrapa.br/index.php/pabPRIhttps://old.scielo.br/oai/scielo-oai.phppab@sct.embrapa.br || sct.pab@embrapa.br1678-39210100-204Xopendoar:2014-06-10T18:20:09Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)false
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