Molecular characterization of progenies of bacurizeiro (Platonia insignis) from Marajó Island, northeastern Amazon.
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2017 |
Outros Autores: | , , , , , |
Tipo de documento: | Artigo |
Idioma: | eng |
Título da fonte: | Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) |
Texto Completo: | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1078387 http://dx.doi.org/10.1590/1809-4392201701302 |
Resumo: | O bacurizeiro (Platonia insignis Mart.) é uma espécie frutífera nativa da Amazônia muito utilizada na cultura alimentar nas regiões Norte e Nordeste do Brasil. Devido a seu grande potencial econômico regional, a espécie vem sendo conservada em bancos ativos de germoplasma (BAG) para apoiar programas de melhoramento genético. Dessa forma, o objetivo deste trabalho foi caracterizar molecularmente acessos de P. insignis pertencentes ao BAG da Embrapa Amazônia Oriental por meio de marcadores ISSR (Inter Simple Sequence Repeat). Foram coletados 78 acessos de P. insignis pertencentes a 16 progênies coletadas em dois locais diferentes na Ilha de Marajó, PA. Das 16 progênies, sete foram coletadas em Soure e nove em Salvaterra. Os 78 acessos foram genotipados com 23 primers ISSR pré-selecionados. Obteve-se 121 produtos amplificados, dos quais 54 foram polimórficos. Os primers mais polimórficos foram UBC 834, UBC 899 e UBC 900. Já os primers UBC810 e UBC884 não apresentaram bandas polimórficas. Das 54 marcas, 49 foram selecionadas para as análises genéticas. A AMOVA entre e dentro de progênies identificou baixa diferenciação genética (ΦPT = 0,064, P<0,001) com maior diversidade dentro de progênies (96%), bem como baixa diferenciação genética entre os locais de coleta (ΦPT = 0,025, P<0,013), com maior diversidade dentro (98%) do que entre locais. O agrupamento pelo método UPGMA, com base nas similaridades de Jaccard entre os acessos, não separou as amostras por progênie ou local de coleta. Recomenda-se que novas coletas de germoplasma considerem maior esforço de coleta em cada local amostrado. |
id |
EMBR_f43e158a69ba8be6df913a759bb8d59c |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:www.alice.cnptia.embrapa.br:doc/1078387 |
network_acronym_str |
EMBR |
network_name_str |
Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) |
repository_id_str |
2154 |
spelling |
Molecular characterization of progenies of bacurizeiro (Platonia insignis) from Marajó Island, northeastern Amazon.Platonia insignis MartDiversidade genéticaBacuriBanco de GermoplasmaClusiaceaeO bacurizeiro (Platonia insignis Mart.) é uma espécie frutífera nativa da Amazônia muito utilizada na cultura alimentar nas regiões Norte e Nordeste do Brasil. Devido a seu grande potencial econômico regional, a espécie vem sendo conservada em bancos ativos de germoplasma (BAG) para apoiar programas de melhoramento genético. Dessa forma, o objetivo deste trabalho foi caracterizar molecularmente acessos de P. insignis pertencentes ao BAG da Embrapa Amazônia Oriental por meio de marcadores ISSR (Inter Simple Sequence Repeat). Foram coletados 78 acessos de P. insignis pertencentes a 16 progênies coletadas em dois locais diferentes na Ilha de Marajó, PA. Das 16 progênies, sete foram coletadas em Soure e nove em Salvaterra. Os 78 acessos foram genotipados com 23 primers ISSR pré-selecionados. Obteve-se 121 produtos amplificados, dos quais 54 foram polimórficos. Os primers mais polimórficos foram UBC 834, UBC 899 e UBC 900. Já os primers UBC810 e UBC884 não apresentaram bandas polimórficas. Das 54 marcas, 49 foram selecionadas para as análises genéticas. A AMOVA entre e dentro de progênies identificou baixa diferenciação genética (ΦPT = 0,064, P<0,001) com maior diversidade dentro de progênies (96%), bem como baixa diferenciação genética entre os locais de coleta (ΦPT = 0,025, P<0,013), com maior diversidade dentro (98%) do que entre locais. O agrupamento pelo método UPGMA, com base nas similaridades de Jaccard entre os acessos, não separou as amostras por progênie ou local de coleta. Recomenda-se que novas coletas de germoplasma considerem maior esforço de coleta em cada local amostrado.Lígia Cristine Gonçalves PONTES, UFPAELISA FERREIRA MOURA CUNHA, CPATUMônika Fecury MOURA, Bolsista de pós-doutorado CPATUSIMONE DE MIRANDA RODRIGUES, CPATUMARIA DO SOCORRO P DE OLIVEIRA, CPATUJOSE EDMAR URANO DE CARVALHO, CPATUJosette THERRIER, UFRA.PONTES, L. C. G.CUNHA, E. F. M.MOURA, M. F.RODRIGUES, S. de M.OLIVEIRA, M. do S. P. deCARVALHO, J. E. U. deTHERRIER, J.2017-11-01T23:16:42Z2017-11-01T23:16:42Z2017-10-3020172019-01-16T11:11:11Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleActa Amazonica, Manaus, v. 47, n. 4, p. 293-300, 2017.http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1078387http://dx.doi.org/10.1590/1809-4392201701302enginfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)instacron:EMBRAPA2017-11-01T23:16:49Zoai:www.alice.cnptia.embrapa.br:doc/1078387Repositório InstitucionalPUBhttps://www.alice.cnptia.embrapa.br/oai/requestopendoar:21542017-11-01T23:16:49falseRepositório InstitucionalPUBhttps://www.alice.cnptia.embrapa.br/oai/requestcg-riaa@embrapa.bropendoar:21542017-11-01T23:16:49Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)false |
dc.title.none.fl_str_mv |
Molecular characterization of progenies of bacurizeiro (Platonia insignis) from Marajó Island, northeastern Amazon. |
title |
Molecular characterization of progenies of bacurizeiro (Platonia insignis) from Marajó Island, northeastern Amazon. |
spellingShingle |
Molecular characterization of progenies of bacurizeiro (Platonia insignis) from Marajó Island, northeastern Amazon. PONTES, L. C. G. Platonia insignis Mart Diversidade genética Bacuri Banco de Germoplasma Clusiaceae |
title_short |
Molecular characterization of progenies of bacurizeiro (Platonia insignis) from Marajó Island, northeastern Amazon. |
title_full |
Molecular characterization of progenies of bacurizeiro (Platonia insignis) from Marajó Island, northeastern Amazon. |
title_fullStr |
Molecular characterization of progenies of bacurizeiro (Platonia insignis) from Marajó Island, northeastern Amazon. |
title_full_unstemmed |
Molecular characterization of progenies of bacurizeiro (Platonia insignis) from Marajó Island, northeastern Amazon. |
title_sort |
Molecular characterization of progenies of bacurizeiro (Platonia insignis) from Marajó Island, northeastern Amazon. |
author |
PONTES, L. C. G. |
author_facet |
PONTES, L. C. G. CUNHA, E. F. M. MOURA, M. F. RODRIGUES, S. de M. OLIVEIRA, M. do S. P. de CARVALHO, J. E. U. de THERRIER, J. |
author_role |
author |
author2 |
CUNHA, E. F. M. MOURA, M. F. RODRIGUES, S. de M. OLIVEIRA, M. do S. P. de CARVALHO, J. E. U. de THERRIER, J. |
author2_role |
author author author author author author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
Lígia Cristine Gonçalves PONTES, UFPA ELISA FERREIRA MOURA CUNHA, CPATU Mônika Fecury MOURA, Bolsista de pós-doutorado CPATU SIMONE DE MIRANDA RODRIGUES, CPATU MARIA DO SOCORRO P DE OLIVEIRA, CPATU JOSE EDMAR URANO DE CARVALHO, CPATU Josette THERRIER, UFRA. |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
PONTES, L. C. G. CUNHA, E. F. M. MOURA, M. F. RODRIGUES, S. de M. OLIVEIRA, M. do S. P. de CARVALHO, J. E. U. de THERRIER, J. |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Platonia insignis Mart Diversidade genética Bacuri Banco de Germoplasma Clusiaceae |
topic |
Platonia insignis Mart Diversidade genética Bacuri Banco de Germoplasma Clusiaceae |
description |
O bacurizeiro (Platonia insignis Mart.) é uma espécie frutífera nativa da Amazônia muito utilizada na cultura alimentar nas regiões Norte e Nordeste do Brasil. Devido a seu grande potencial econômico regional, a espécie vem sendo conservada em bancos ativos de germoplasma (BAG) para apoiar programas de melhoramento genético. Dessa forma, o objetivo deste trabalho foi caracterizar molecularmente acessos de P. insignis pertencentes ao BAG da Embrapa Amazônia Oriental por meio de marcadores ISSR (Inter Simple Sequence Repeat). Foram coletados 78 acessos de P. insignis pertencentes a 16 progênies coletadas em dois locais diferentes na Ilha de Marajó, PA. Das 16 progênies, sete foram coletadas em Soure e nove em Salvaterra. Os 78 acessos foram genotipados com 23 primers ISSR pré-selecionados. Obteve-se 121 produtos amplificados, dos quais 54 foram polimórficos. Os primers mais polimórficos foram UBC 834, UBC 899 e UBC 900. Já os primers UBC810 e UBC884 não apresentaram bandas polimórficas. Das 54 marcas, 49 foram selecionadas para as análises genéticas. A AMOVA entre e dentro de progênies identificou baixa diferenciação genética (ΦPT = 0,064, P<0,001) com maior diversidade dentro de progênies (96%), bem como baixa diferenciação genética entre os locais de coleta (ΦPT = 0,025, P<0,013), com maior diversidade dentro (98%) do que entre locais. O agrupamento pelo método UPGMA, com base nas similaridades de Jaccard entre os acessos, não separou as amostras por progênie ou local de coleta. Recomenda-se que novas coletas de germoplasma considerem maior esforço de coleta em cada local amostrado. |
publishDate |
2017 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2017-11-01T23:16:42Z 2017-11-01T23:16:42Z 2017-10-30 2017 2019-01-16T11:11:11Z |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion info:eu-repo/semantics/article |
format |
article |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
Acta Amazonica, Manaus, v. 47, n. 4, p. 293-300, 2017. http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1078387 http://dx.doi.org/10.1590/1809-4392201701302 |
identifier_str_mv |
Acta Amazonica, Manaus, v. 47, n. 4, p. 293-300, 2017. |
url |
http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1078387 http://dx.doi.org/10.1590/1809-4392201701302 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
eng |
language |
eng |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) instacron:EMBRAPA |
instname_str |
Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) |
instacron_str |
EMBRAPA |
institution |
EMBRAPA |
reponame_str |
Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) |
collection |
Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) |
repository.mail.fl_str_mv |
cg-riaa@embrapa.br |
_version_ |
1794503443660931072 |