Detecção e distribuição temporal de espécies de peixes em lagos de várzea na Amazônia central utilizando dna ambiental (DNAa)
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2020 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do INPA |
Texto Completo: | https://repositorio.inpa.gov.br/handle/1/19797 http://lattes.cnpq.br/4102952736351817 |
Resumo: | Estudou-se a comunidade de peixes em quatro lagos de várzea localizados na ilha da Paciência, Iranduba, no estado do Amazonas, quanto a sua detecção e distribuição temporal utilizando o método pioneiro na Amazônia, chamado DNA ambiental (DNAa) – Environmental DNA (DNAe). Foi desenvolvido a metodologia de pré-amplificação testando diluições de DNag, em seguida foi desenhado e sintetizado primers e sondas espécie-específicos para duas espécies alvos: Prochilodus nigricans e Potamorhina altamazonica, e primers para Triportheus angulatus e Psectrogaster rutiloides. Todos os primers foram testados in silico, in vitro e in situ e validados, com isso foi detectada a presença ou ausência das espécies alvos e com a abordagem de metabarcode foi detectado a presença de outras espécies de peixes, além de outros organismos, presentes nos lagos nos período de seca e cheia. |
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Bevilaqua, DannielBatista, JacquelineFreitas, Carlos2020-06-16T12:34:04Z2020-06-16T12:34:04Z2020-06-15https://repositorio.inpa.gov.br/handle/1/19797http://lattes.cnpq.br/4102952736351817Estudou-se a comunidade de peixes em quatro lagos de várzea localizados na ilha da Paciência, Iranduba, no estado do Amazonas, quanto a sua detecção e distribuição temporal utilizando o método pioneiro na Amazônia, chamado DNA ambiental (DNAa) – Environmental DNA (DNAe). Foi desenvolvido a metodologia de pré-amplificação testando diluições de DNag, em seguida foi desenhado e sintetizado primers e sondas espécie-específicos para duas espécies alvos: Prochilodus nigricans e Potamorhina altamazonica, e primers para Triportheus angulatus e Psectrogaster rutiloides. Todos os primers foram testados in silico, in vitro e in situ e validados, com isso foi detectada a presença ou ausência das espécies alvos e com a abordagem de metabarcode foi detectado a presença de outras espécies de peixes, além de outros organismos, presentes nos lagos nos período de seca e cheia.The fish community in four floodplain lakes located on the island of Paciência, Iranduba, in the state of Amazonas, was studied for its detection and temporal distribution using the pioneer method in the Amazon, called environmental DNA (DNAe). The pre-amplification methodology was developed by testing dilutions of DNag, then primers and species-specific probes were designed and synthesized for two target species: Prochilodus nigricans and Potamorhina altamazonica, and primers for Triportheus angulatus and Psectrogaster rutiloides. All primers were tested in silico, in vitro and in situ and validated, with this the presence or absence of the target species was detected and with the metabarcode approach the presence of other fish species, in addition to other organisms, present in the lakes in the dry and flood periods.porInstituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPABiologia de Água Doce e Pesca Interior - BADPICC0 1.0 Universalhttp://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDNA ambientalictiofaunaDetecção e distribuição temporal de espécies de peixes em lagos de várzea na Amazônia central utilizando dna ambiental (DNAa)info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do INPAinstname:Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA)instacron:INPAORIGINALBEVILAQUA.pdfBEVILAQUA.pdfTese de doutorado do BADPIapplication/pdf1555305https://repositorio.inpa.gov.br/bitstream/1/19797/1/BEVILAQUA.pdfb3951091167ae50e16ad76e457aa8517MD51CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8701https://repositorio.inpa.gov.br/bitstream/1/19797/2/license_rdf42fd4ad1e89814f5e4a476b409eb708cMD521/197972020-06-16 08:34:04.308oai:repositorio:1/19797Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://bdtd.inpa.gov.br/PUBhttps://repositorio.inpa.gov.br/oai/requestrepositorio@inpa.gov.br||repositorio@inpa.gov.bropendoar:2020-06-16T12:34:04Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do INPA - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA)false |
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Estudou-se a comunidade de peixes em quatro lagos de várzea localizados na ilha da Paciência, Iranduba, no estado do Amazonas, quanto a sua detecção e distribuição temporal utilizando o método pioneiro na Amazônia, chamado DNA ambiental (DNAa) – Environmental DNA (DNAe). Foi desenvolvido a metodologia de pré-amplificação testando diluições de DNag, em seguida foi desenhado e sintetizado primers e sondas espécie-específicos para duas espécies alvos: Prochilodus nigricans e Potamorhina altamazonica, e primers para Triportheus angulatus e Psectrogaster rutiloides. Todos os primers foram testados in silico, in vitro e in situ e validados, com isso foi detectada a presença ou ausência das espécies alvos e com a abordagem de metabarcode foi detectado a presença de outras espécies de peixes, além de outros organismos, presentes nos lagos nos período de seca e cheia. |
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