Clusterização aplicada na análise genômica
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2015 |
Tipo de documento: | Trabalho de conclusão de curso |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UCS |
Texto Completo: | https://repositorio.ucs.br/handle/11338/1461 |
Resumo: | A necessidade pelo desenvolvimento de metodologias computacionais que auxiliem na análise dos dados de origem biológica cresce constantemente. A bioinformática é área de conhecimento onde ferramentas dos campos da computação e matemática são aplicadas na geração e manipulação de informações biológicas. Um esforço muito grande vem sendo realizado nesta área, especialmente na análise genômica, desde a década de 90, quando grandes projetos foram iniciados com o objetivo de sequenciar o DNA dos organismos vivos conhecidos. Neste trabalho são analisadas sequências do DNA da bactéria E.coli. Os dados são obtidos de uma base de dados pública e são submetidos a aplicação de uma técnica de mineração de dados, a clusterização. O foco está na etapa de seleção e extração de atributos, onde diferentes abordagens são aplicadas a fim de reduzir a quantidade de ruídos e informações irrelevantes contidas nas amostras e aprimorar a análise da região promotora da expressão gênica, bem como a identificação de padrões expressos na mesma (sic). |
id |
UCS_5c3880567f1b1888548130869abc2ef8 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.ucs.br:11338/1461 |
network_acronym_str |
UCS |
network_name_str |
Repositório Institucional da UCS |
repository_id_str |
|
spelling |
Basso, Thiago ÂngeloNotari, Daniel LuísSilva, Scheila de Avila eFaccin, Daniel Antônio2017-01-27T18:33:50Z2017-01-27T18:33:50Z2015-07-01https://repositorio.ucs.br/handle/11338/1461A necessidade pelo desenvolvimento de metodologias computacionais que auxiliem na análise dos dados de origem biológica cresce constantemente. A bioinformática é área de conhecimento onde ferramentas dos campos da computação e matemática são aplicadas na geração e manipulação de informações biológicas. Um esforço muito grande vem sendo realizado nesta área, especialmente na análise genômica, desde a década de 90, quando grandes projetos foram iniciados com o objetivo de sequenciar o DNA dos organismos vivos conhecidos. Neste trabalho são analisadas sequências do DNA da bactéria E.coli. Os dados são obtidos de uma base de dados pública e são submetidos a aplicação de uma técnica de mineração de dados, a clusterização. O foco está na etapa de seleção e extração de atributos, onde diferentes abordagens são aplicadas a fim de reduzir a quantidade de ruídos e informações irrelevantes contidas nas amostras e aprimorar a análise da região promotora da expressão gênica, bem como a identificação de padrões expressos na mesma (sic).Universidade de Caxias do SulBioinformáticaClusterização aplicada na análise genômicainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisporreponame:Repositório Institucional da UCSinstname:Universidade de Caxias do Sul (UCS)instacron:UCSinfo:eu-repo/semantics/openAccessUniversidade de Caxias do SulBacharelado em Ciências ContábeisTEXTTCC Thiago Angelo Basso.pdf.txtTCC Thiago Angelo Basso.pdf.txtExtracted texttext/plain149385https://repositorio.ucs.br/xmlui/bitstream/11338/1461/3/TCC%20Thiago%20Angelo%20Basso.pdf.txt0df02c24bcc3dc2cd0a5d74d49c9e4d8MD53THUMBNAILTCC Thiago Angelo Basso.pdf.jpgTCC Thiago Angelo Basso.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1142https://repositorio.ucs.br/xmlui/bitstream/11338/1461/4/TCC%20Thiago%20Angelo%20Basso.pdf.jpg42ab258d5601300470c7d25f61151f3aMD54ORIGINALTCC Thiago Angelo Basso.pdfTCC Thiago Angelo Basso.pdfapplication/pdf2018543https://repositorio.ucs.br/xmlui/bitstream/11338/1461/1/TCC%20Thiago%20Angelo%20Basso.pdf6dc7219bf8d763901b6b992665796d75MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://repositorio.ucs.br/xmlui/bitstream/11338/1461/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD5211338/14612018-08-17 06:31:58.0oai:repositorio.ucs.br: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Repositório de Publicaçõeshttp://repositorio.ucs.br/oai/requestopendoar:2018-08-17T06:31:58Repositório Institucional da UCS - Universidade de Caxias do Sul (UCS)false |
dc.title.pt_BR.fl_str_mv |
Clusterização aplicada na análise genômica |
title |
Clusterização aplicada na análise genômica |
spellingShingle |
Clusterização aplicada na análise genômica Basso, Thiago Ângelo Bioinformática |
title_short |
Clusterização aplicada na análise genômica |
title_full |
Clusterização aplicada na análise genômica |
title_fullStr |
Clusterização aplicada na análise genômica |
title_full_unstemmed |
Clusterização aplicada na análise genômica |
title_sort |
Clusterização aplicada na análise genômica |
author |
Basso, Thiago Ângelo |
author_facet |
Basso, Thiago Ângelo |
author_role |
author |
dc.contributor.other.none.fl_str_mv |
Notari, Daniel Luís Silva, Scheila de Avila e |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Basso, Thiago Ângelo |
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Faccin, Daniel Antônio |
contributor_str_mv |
Faccin, Daniel Antônio |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Bioinformática |
topic |
Bioinformática |
description |
A necessidade pelo desenvolvimento de metodologias computacionais que auxiliem na análise dos dados de origem biológica cresce constantemente. A bioinformática é área de conhecimento onde ferramentas dos campos da computação e matemática são aplicadas na geração e manipulação de informações biológicas. Um esforço muito grande vem sendo realizado nesta área, especialmente na análise genômica, desde a década de 90, quando grandes projetos foram iniciados com o objetivo de sequenciar o DNA dos organismos vivos conhecidos. Neste trabalho são analisadas sequências do DNA da bactéria E.coli. Os dados são obtidos de uma base de dados pública e são submetidos a aplicação de uma técnica de mineração de dados, a clusterização. O foco está na etapa de seleção e extração de atributos, onde diferentes abordagens são aplicadas a fim de reduzir a quantidade de ruídos e informações irrelevantes contidas nas amostras e aprimorar a análise da região promotora da expressão gênica, bem como a identificação de padrões expressos na mesma (sic). |
publishDate |
2015 |
dc.date.submitted.none.fl_str_mv |
2015-07-01 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2017-01-27T18:33:50Z |
dc.date.available.fl_str_mv |
2017-01-27T18:33:50Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/bachelorThesis |
format |
bachelorThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://repositorio.ucs.br/handle/11338/1461 |
url |
https://repositorio.ucs.br/handle/11338/1461 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UCS instname:Universidade de Caxias do Sul (UCS) instacron:UCS |
instname_str |
Universidade de Caxias do Sul (UCS) |
instacron_str |
UCS |
institution |
UCS |
reponame_str |
Repositório Institucional da UCS |
collection |
Repositório Institucional da UCS |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.ucs.br/xmlui/bitstream/11338/1461/3/TCC%20Thiago%20Angelo%20Basso.pdf.txt https://repositorio.ucs.br/xmlui/bitstream/11338/1461/4/TCC%20Thiago%20Angelo%20Basso.pdf.jpg https://repositorio.ucs.br/xmlui/bitstream/11338/1461/1/TCC%20Thiago%20Angelo%20Basso.pdf https://repositorio.ucs.br/xmlui/bitstream/11338/1461/2/license.txt |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
0df02c24bcc3dc2cd0a5d74d49c9e4d8 42ab258d5601300470c7d25f61151f3a 6dc7219bf8d763901b6b992665796d75 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UCS - Universidade de Caxias do Sul (UCS) |
repository.mail.fl_str_mv |
|
_version_ |
1798308913424105472 |