Estudo quantitativo da relacao estrutura-atividade de um conjunto de inibidores do receptor TGF-¿ tipo 1 (ALK5) empregando tecnicas de QSAR 3D

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Almeida, Michell de Oliveira
Data de Publicação: 2014
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFABC
Texto Completo: http://biblioteca.ufabc.edu.br/index.php?codigo_sophia=76582
Resumo: Orientadora: Profa. Dra. Káthia Maria Honório
id UFBC_06fa8bcf4d39d4c779d0fa14b8b5f8e9
oai_identifier_str oai:BDTD:76582
network_acronym_str UFBC
network_name_str Repositório Institucional da UFABC
repository_id_str
spelling Estudo quantitativo da relacao estrutura-atividade de um conjunto de inibidores do receptor TGF-¿ tipo 1 (ALK5) empregando tecnicas de QSAR 3DONCOLOGIAALK5ACOPLAMENTO MOLECULARMOLECULAR DOCKINGPROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM CIÊNCIA E TECNOLOGIA/QUÍMICA - UFABCOrientadora: Profa. Dra. Káthia Maria HonórioDissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Ciência & Tecnologia - Química, 2014.Este trabalho propoe o uso de tecnicas de modelagem molecular para entender os principais fatores relacionados com a interacao entre um conjunto de ligantes bioativos e o receptor TGF-¿À tipo 1 (ALK5), alvo biologico envolvido no desenvolvimento de doencas como cancer e fibrose. Para entender essas interacoes, foram utilizadas tecnicas computacionais de modelagem molecular que sao utilizadas para quantificar essas interacoes. Dentre as metodologias utilizadas neste trabalho, foram empregadas tecnicas de acoplamento molecular e analises das relacoes quantitativas tridimensionais entre estrutura quimica e atividade biologica (QSAR 3D). Dessa forma, foi estudado um conjunto de dados contendo 70 moleculas empregando tecnicas de QSAR 3D (CoMFA e CoMSIA). Os modelos CoMFA obtidos apresentaram significativos valores de validacao interna (r2 = 0,979 e q2LOO = 0,882) e externa (conjunto de predicao - r2pred = 0,998 e potencial preditivo externo . r2m= 0,998) e os modelos obtidos da analise CoMSIA tambem apresentaram valores significativos de validacao interna (r2 = 0,913 e q2LOO = 0,822) e validacao externa (conjunto de predicao - r2pred = 0,975 e potencial preditivo externo . r2m = 0,975. A analise dos mapas de contribuicoes estereoquimicas e eletrostaticas (CoMFA) e dos mapas de contribuicoes eletrostaticas e dos grupos doadores de ligacao de hidrogenio (CoMSIA) para o composto mais ativo e menos ativo foi capaz de indicar caracteristicas importantes para a inibicao do alvo biologico em estudo. Portanto, o emprego de metodologias computacionais foi de fundamental importancia para o entendimento sobre os principais fatores envolvidos na interacao entre os ligantes estudados e o receptor ALK5.This study proposes the use of molecular modeling techniques to understand the main factors related to the interaction between a set of ligands and bioactive TGF-â receptor type 1 (ALK5), biological target involved in the development of diseases such as cancer and fibrosis. To understand these interactions, computational molecular modeling techniques were used, which are used to quantify these interactions. Among the methodologies used in this study, techniques of molecular docking and analyses of three-dimensional quantitative relations between chemical structure and biological activity (3D QSAR) were performed with the goal of understanding the main physico-chemical features related to the biological activity. Thus, we studied a data set containing 70 molecules and 3D QSAR analyses (CoMFA and CoMSIA) were carried out. The CoMFA models have good statistical parameters (r2 =0.979 and q2LOO =0.882) and a significant predictive power (r2pred=0.998 and r2m = 0.998). The CoMSIA models also showed significant values for the internal validation (r2=0.913 and q2LOO =0.822) and the external validation (r2pred=0.975 and r2m=0.975). The analysis of the steric and electrostatic contributions (CoMFA), as well as the electrostatic contributions and donor groups for hydrogen bonding (CoMSIA) for the most active and least active compounds was able to indicate important characteristics of inhibiting the biological target under study. Therefore, the use of computational methodologies was of fundamental importance to understand the main factors involved in the interaction between the studied ligands and the ALK5 receptor.Honório, Káthia MariaBraz, Antônio Sérgio KimusComar Júnior, MoacyrCordeiro, Rodrigo MaghdissianTrossini, Gustavo Henrique GoulartAlmeida, Michell de Oliveira2014info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdf95 f. : il.http://biblioteca.ufabc.edu.br/index.php?codigo_sophia=76582http://biblioteca.ufabc.edu.br/index.php?codigo_sophia=76582&midiaext=69717http://biblioteca.ufabc.edu.br/index.php?codigo_sophia=76582&midiaext=69718Cover: http://biblioteca.ufabc.edu.br/php/capa.php?obra=76582porreponame:Repositório Institucional da UFABCinstname:Universidade Federal do ABC (UFABC)instacron:UFABCinfo:eu-repo/semantics/openAccess2016-03-14T17:48:45Zoai:BDTD:76582Repositório InstitucionalPUBhttp://www.biblioteca.ufabc.edu.br/oai/oai.phpopendoar:2016-03-14T17:48:45Repositório Institucional da UFABC - Universidade Federal do ABC (UFABC)false
dc.title.none.fl_str_mv Estudo quantitativo da relacao estrutura-atividade de um conjunto de inibidores do receptor TGF-¿ tipo 1 (ALK5) empregando tecnicas de QSAR 3D
title Estudo quantitativo da relacao estrutura-atividade de um conjunto de inibidores do receptor TGF-¿ tipo 1 (ALK5) empregando tecnicas de QSAR 3D
spellingShingle Estudo quantitativo da relacao estrutura-atividade de um conjunto de inibidores do receptor TGF-¿ tipo 1 (ALK5) empregando tecnicas de QSAR 3D
Almeida, Michell de Oliveira
ONCOLOGIA
ALK5
ACOPLAMENTO MOLECULAR
MOLECULAR DOCKING
PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM CIÊNCIA E TECNOLOGIA/QUÍMICA - UFABC
title_short Estudo quantitativo da relacao estrutura-atividade de um conjunto de inibidores do receptor TGF-¿ tipo 1 (ALK5) empregando tecnicas de QSAR 3D
title_full Estudo quantitativo da relacao estrutura-atividade de um conjunto de inibidores do receptor TGF-¿ tipo 1 (ALK5) empregando tecnicas de QSAR 3D
title_fullStr Estudo quantitativo da relacao estrutura-atividade de um conjunto de inibidores do receptor TGF-¿ tipo 1 (ALK5) empregando tecnicas de QSAR 3D
title_full_unstemmed Estudo quantitativo da relacao estrutura-atividade de um conjunto de inibidores do receptor TGF-¿ tipo 1 (ALK5) empregando tecnicas de QSAR 3D
title_sort Estudo quantitativo da relacao estrutura-atividade de um conjunto de inibidores do receptor TGF-¿ tipo 1 (ALK5) empregando tecnicas de QSAR 3D
author Almeida, Michell de Oliveira
author_facet Almeida, Michell de Oliveira
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Honório, Káthia Maria
Braz, Antônio Sérgio Kimus
Comar Júnior, Moacyr
Cordeiro, Rodrigo Maghdissian
Trossini, Gustavo Henrique Goulart
dc.contributor.author.fl_str_mv Almeida, Michell de Oliveira
dc.subject.por.fl_str_mv ONCOLOGIA
ALK5
ACOPLAMENTO MOLECULAR
MOLECULAR DOCKING
PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM CIÊNCIA E TECNOLOGIA/QUÍMICA - UFABC
topic ONCOLOGIA
ALK5
ACOPLAMENTO MOLECULAR
MOLECULAR DOCKING
PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM CIÊNCIA E TECNOLOGIA/QUÍMICA - UFABC
description Orientadora: Profa. Dra. Káthia Maria Honório
publishDate 2014
dc.date.none.fl_str_mv 2014
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://biblioteca.ufabc.edu.br/index.php?codigo_sophia=76582
url http://biblioteca.ufabc.edu.br/index.php?codigo_sophia=76582
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv http://biblioteca.ufabc.edu.br/index.php?codigo_sophia=76582&midiaext=69717
http://biblioteca.ufabc.edu.br/index.php?codigo_sophia=76582&midiaext=69718
Cover: http://biblioteca.ufabc.edu.br/php/capa.php?obra=76582
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
95 f. : il.
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFABC
instname:Universidade Federal do ABC (UFABC)
instacron:UFABC
instname_str Universidade Federal do ABC (UFABC)
instacron_str UFABC
institution UFABC
reponame_str Repositório Institucional da UFABC
collection Repositório Institucional da UFABC
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFABC - Universidade Federal do ABC (UFABC)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1801502094748811264

Registros relacionados