Análise de sintenia dos genes glicolato oxidase (gox) e indutor apoptotico de condensação da cromatina (ACIN1) em Vigna unguilata [L.] Walp

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Aguiar, Alex Martins de
Data de Publicação: 2022
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC)
Texto Completo: http://www.repositorio.ufc.br/handle/riufc/69954
Resumo: Trabalho teve como objetivo realizar analises de sintenia em genes que são diferencialmente expressos em Feijão-Caupi durante a infecção do vírus do mosaico severo do caupi
id UFC-7_a414b9b6400ead66d521a4e5a7b9b2f3
oai_identifier_str oai:repositorio.ufc.br:riufc/69954
network_acronym_str UFC-7
network_name_str Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC)
repository_id_str
spelling Análise de sintenia dos genes glicolato oxidase (gox) e indutor apoptotico de condensação da cromatina (ACIN1) em Vigna unguilata [L.] WalpSyntheny analysis of the glycolate oxidase (gox) and apoptotic inductor of chromatin condensation (ACIN1) genes in Vigna unguilata [L.] WalpGenômicaSinteniaFeijão-caupiTrabalho teve como objetivo realizar analises de sintenia em genes que são diferencialmente expressos em Feijão-Caupi durante a infecção do vírus do mosaico severo do caupiBioinformatics provided the advancement of analyses associating technological methods that allowed the process, collection and analysis of biological data that, previously, were performed directly in vivo, could be previously evaluated from in silico analyses and tests. Such advances occurred through computational tools capable of analyzing biological data. The accumulation of this information in the form of data provides great potential for genomic, proteomic, transcriptomic, among other omics analysis. Accompanying the development of these technologies of biological data analysis, the use of software to analyze this information has become essential. Thus, bioinformatics tools have become relevant for experiments in the area. The analysis of synteny allows to verification the collinearity between genes from different species and allows the identification of events of structural change in the genome that may reflect the evolutionary process of the organisms being analyzed. To perform a genomic characterization of genes in Vigna unguiculata [L.] Walp, the present work used the comparative genomics software (TBtools) to analyze the co-localization of the gene Glycolate oxidase (GOX) and the Apoptotic Inducer of Chromatin Condensation in the Nucleus (ACIN1) among species of Fabaceae and in the case of GOX, Poaceae. In the synteny analysis of the GOX gene, collinearities were found between S. bicolor and G. Max and between S. bicolor and O. sativa. However, no colinearity was observed between S. bicolor and V. unguiculata. There is an evolutionary distance between GOX genes, however, there is a suggested functional divergence between some orthologues. On the other hand, ACIN1 was present in all analyzed species, with colinearity among the few gene copies found. These results allow the analysis of the evolution of genes among the studied species and help future comparative genomics studies involving these speciesA bioinformática proporcionou o avanço de análises associando métodos tecnológicos que permitiram o processo, a coleta e a análise dos dados biológicos que, anteriormente, eram realizados diretamente in vivo, puderam ser avaliados previamente a partir de análises e testes in silico. Tais avanços ocorreram através de ferramentas computacionais capazes de analisar dados biológicos. O acúmulo dessas informações na forma de dados fornece grande potencial para análises genômicas, proteômicas, transcriptômicas, dentre outras ômicas. Acompanhando o desenvolvimento dessas tecnologias de análises de dados biológicos, o uso de softwares para análises dessas informações tornou-se imprescindíveis. Dessa forma, ferramentas de bioinformática tornaram-se relevantes para experimentos na área. A análise de sintenia permite verificar a colinearidade entre genes de espécies distintas e permite a identificação de eventos de alteração estrutural do genoma que podem refletir o processo evolutivo dos organismos que estão sendo analisados. Com o objetivo de realizar uma caracterização genômica de genes em Vigna unguiculata [L.] Walp, o presente trabalho utilizou o software de genômica comparativa. (TBtools) Para análise de co-localização do gene Glicolato oxidase (GOX) e o Indutor Apoptótico de Condensação de Cromatina no Núcleo (ACIN1) entre espécies de Fabaceae e no caso da GOX, Poaceae. Na análise de sintenia do gene GOX, foi encontrado colinearidades entre as espécies S. bicolor e G. Max e entre S. bicolor e O. sativa. No entanto, não foi observada colinearidade entre S. bicolor e V. unguiculata. Há distância evolutiva entre os genes GOX, porém existe uma divergência funcional sugerida entre alguns ortólogos. Por outro lado, ACIN1 esteve presente em todas as espécies analisadas, havendo colinearidade entre as poucas cópias gênicas encontradas. Esses resultados permitem analisar a evolução dos genes entres as espécies estudadas e auxiliar futuros estudos de genômica comparativa envolvendo essas espécies.Alves, Murilo SiqueiraAguiar, Alex Martins de2023-01-03T11:47:14Z2023-01-03T11:47:14Z2022info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisapplication/pdfAGUIAR, A.M d. (2022)http://www.repositorio.ufc.br/handle/riufc/69954porreponame:Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC)instname:Universidade Federal do Ceará (UFC)instacron:UFCinfo:eu-repo/semantics/openAccess2023-01-03T11:52:57Zoai:repositorio.ufc.br:riufc/69954Repositório InstitucionalPUBhttp://www.repositorio.ufc.br/ri-oai/requestbu@ufc.br || repositorio@ufc.bropendoar:2023-01-03T11:52:57Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC) - Universidade Federal do Ceará (UFC)false
dc.title.none.fl_str_mv Análise de sintenia dos genes glicolato oxidase (gox) e indutor apoptotico de condensação da cromatina (ACIN1) em Vigna unguilata [L.] Walp
Syntheny analysis of the glycolate oxidase (gox) and apoptotic inductor of chromatin condensation (ACIN1) genes in Vigna unguilata [L.] Walp
title Análise de sintenia dos genes glicolato oxidase (gox) e indutor apoptotico de condensação da cromatina (ACIN1) em Vigna unguilata [L.] Walp
spellingShingle Análise de sintenia dos genes glicolato oxidase (gox) e indutor apoptotico de condensação da cromatina (ACIN1) em Vigna unguilata [L.] Walp
Aguiar, Alex Martins de
Genômica
Sintenia
Feijão-caupi
title_short Análise de sintenia dos genes glicolato oxidase (gox) e indutor apoptotico de condensação da cromatina (ACIN1) em Vigna unguilata [L.] Walp
title_full Análise de sintenia dos genes glicolato oxidase (gox) e indutor apoptotico de condensação da cromatina (ACIN1) em Vigna unguilata [L.] Walp
title_fullStr Análise de sintenia dos genes glicolato oxidase (gox) e indutor apoptotico de condensação da cromatina (ACIN1) em Vigna unguilata [L.] Walp
title_full_unstemmed Análise de sintenia dos genes glicolato oxidase (gox) e indutor apoptotico de condensação da cromatina (ACIN1) em Vigna unguilata [L.] Walp
title_sort Análise de sintenia dos genes glicolato oxidase (gox) e indutor apoptotico de condensação da cromatina (ACIN1) em Vigna unguilata [L.] Walp
author Aguiar, Alex Martins de
author_facet Aguiar, Alex Martins de
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Alves, Murilo Siqueira
dc.contributor.author.fl_str_mv Aguiar, Alex Martins de
dc.subject.por.fl_str_mv Genômica
Sintenia
Feijão-caupi
topic Genômica
Sintenia
Feijão-caupi
description Trabalho teve como objetivo realizar analises de sintenia em genes que são diferencialmente expressos em Feijão-Caupi durante a infecção do vírus do mosaico severo do caupi
publishDate 2022
dc.date.none.fl_str_mv 2022
2023-01-03T11:47:14Z
2023-01-03T11:47:14Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
format bachelorThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv AGUIAR, A.M d. (2022)
http://www.repositorio.ufc.br/handle/riufc/69954
identifier_str_mv AGUIAR, A.M d. (2022)
url http://www.repositorio.ufc.br/handle/riufc/69954
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC)
instname:Universidade Federal do Ceará (UFC)
instacron:UFC
instname_str Universidade Federal do Ceará (UFC)
instacron_str UFC
institution UFC
reponame_str Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC)
collection Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC)
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC) - Universidade Federal do Ceará (UFC)
repository.mail.fl_str_mv bu@ufc.br || repositorio@ufc.br
_version_ 1809935791506325504

Registros relacionados