Efeito da imputação de genótipos sobre a predição de característicasquantitativas de ratos utilizando marcadores genéticos

• Autor(a) principal: Vivian Paula Silva Felipe
• Data de Publicação: 2013
• Tipo de documento: Tese
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFMG
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/1843/BUBD-ACHH6W
• topic: Regressão; Seleção genômica; Efeito de substituição; Imputação; Rato como animal de laboratório; Genótipo; Genética animal

Objetivou-se neste primeiro capítulo, definir conceitos básicos em genética quantitatica e molecular e revisar metodologias aplicadas para seleção genômica. Primeiramente modelos utilizados para a predição de efeitos de marcadores são descritos dentre eles regressões Bayesianas (BayesA, BayesB, Bayesian LASSO, entre outros), regressões semi-paramétricas (Reproducing Kernel Hilbert Spaces) e métodos não paramétricos (Redes Neurais com Regularização Bayesiana). Quanto aos métodos semi e nãoparamétricos,eles têm sido propostos para seleção genômica com a vantagem de capturar efeitos não-lineares entre marcadores, o que seria impossível ajustando modelos lineares. Outra ferramenta também descrita é a imputação de genótipos, utilizada para preencher dados faltantes, unir bancos de dados prevenientes de diferentes painéis de marcadores ou mesmo aumentar a quantidade de SNPs contidos nos painéis.