Estudos de modelagem molecular dos mecanismos de afinidade relativa para quatro galantamínicos com potencial anti-Alzheimer

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Rafael Eduardo Oliveira Rocha
Data de Publicação: 2017
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFMG
Texto Completo: http://hdl.handle.net/1843/BUOS-B43MLZ
Resumo: A doença de Alzheimer é atualmente um sério problema de saúde pública e econômico oriundo do aumento da expectativa de vida da população mundial, que resulta em complicados sintomas psicológicos em portadores dessa doença e reflete em devastadores efeitos sociais aos seus amigos e familiares. Tais características resultam no redirecionamento de parte das atenções da comunidade científica para o planejamento de estratégias que buscam diminuir ou cessar tais efeitos. Uma dessas estratégias incide sobre o sistema colinérgico de neurotransmissão, buscando inibir a acetilcolinesterase e consequentemente, aumentar a concentração de acetilcolina no espaço sináptico. Isso permite que o sinal neural seja prolongado em casos de danos aos neurônios em doenças neurodegenerativas. Um inibidor natural dessa enzima, a galantamina, mostra-se especialmente promissor. Dois derivados de galantamina, a sanguinina e a licoramina, diferem quimicamente dessa, respectivamente, apenas por uma substituição metoxi-hidroxi e uma mudança de ligação sp2-sp3. Esses compostos mostram, no entanto, modificações totalmente diferentes e opostas na atividade inibitória original. A simples análise estrutural de estruturas rígidas não revela os mecanismos pelos quais tais sutis distinções químicas resultam em diferenças de afinidade tão drásticas. Aqui, usamos métodos de modelagem computacional e dinâmica molecular para melhor acessar os fatores moleculares de tais distinções. Para verificação dos efeitos cumulativos associados a tais substituições, um ligante híbrido de licoramina e sanguinina foi também modelado. Os resultados sugerem que as diferenças na mobilidade do anel não-aromático presente em licoramina (com a modificação sp2-sp3), implicam em uma maior facilidade de hidratação desse ligante em solução, além de drásticas penalidades conformacionais, vibratórias e entrópicas na ligação em comparação com galantamina. Por sua vez, a possibilidade do estabelecimento de uma rede de ligações de hidrogênio adiciona vantagens entálpicas para a ligação de sanguinina. Efeitos cumulativos das modificações estudadas são observados com as análises do ligante híbrido. Esses resultados, ao mesmo tempo que sugerem uma classificação de afinidade em consonância com a literatura, também sugerem ideias que esperamos serem úteis no planejamento mais racional de medicamentos anti-Alzheimer
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Isso permite que o sinal neural seja prolongado em casos de danos aos neurônios em doenças neurodegenerativas. Um inibidor natural dessa enzima, a galantamina, mostra-se especialmente promissor. Dois derivados de galantamina, a sanguinina e a licoramina, diferem quimicamente dessa, respectivamente, apenas por uma substituição metoxi-hidroxi e uma mudança de ligação sp2-sp3. Esses compostos mostram, no entanto, modificações totalmente diferentes e opostas na atividade inibitória original. A simples análise estrutural de estruturas rígidas não revela os mecanismos pelos quais tais sutis distinções químicas resultam em diferenças de afinidade tão drásticas. Aqui, usamos métodos de modelagem computacional e dinâmica molecular para melhor acessar os fatores moleculares de tais distinções. Para verificação dos efeitos cumulativos associados a tais substituições, um ligante híbrido de licoramina e sanguinina foi também modelado. 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Esses resultados, ao mesmo tempo que sugerem uma classificação de afinidade em consonância com a literatura, também sugerem ideias que esperamos serem úteis no planejamento mais racional de medicamentos anti-AlzheimerAlzheimer's disease is currently a serious public health and economic problem stemming from the increased life expectancy of the world's population, which results in complicated psychological symptoms in people with this disease and reflects on devastating social effects on their friends and family. These characteristics result in the redirection of part of the attention of the scientific community to the planning of strategies that seek to decrease or to cease these effects. One of these strategies focuses on the cholinergic system of neurotransmission, searching to inhibit acetylcholinesterase and consequently increase the concentration of acetylcholine in the synaptic space. This allows the neural signal to be prolonged in cases of damage to neurons in neurodegenerative diseases. A natural inhibitor of this enzyme, galantamine, is especially promising. Two galantaminics derivatives, sanguinine and lycoramine, chemically differ from this, respectively, only by a methoxy-hydroxy substitution and a sp2-sp3 binding change. These compounds, however, show very different and opposite modifications in the original inhibitory activity. The simple structural analysis of rigid structures does not reveal the mechanisms by which such subtle chemical distinctions result in such drastic affinity differences. Here, we use computational modeling and molecular dynamics methods to better access the molecular factors of such distinctions. To verify the cumulative effects associated with such substitutions, a hybrid ligand of lycoramine and sanguinine was also modeled. The results suggest that the differences in the mobility of the non-aromatic ring present in lycoramine (with the sp2-sp3 modification) imply a greater ease of hydration of this ligand in solution, in addition to drastic conformational, vibratory and entropic penalties in the binding compared to galantamine. In turn, the possibility of establishing a hydrogen-bonds network adds enthalpic advantages for sanguinine binding. Cumulative effects of the studied modifications are observed with hybrid ligand analyzes. These results, while suggesting an affinity ranking in line with the literature, also suggest ideas that we hope will be useful in more rational planning of anti-Alzheimer's drugsUniversidade Federal de Minas GeraisUFMGGalantaminaBioinformáticaDoença de AlzheimerMétodos de modelagemDinamica molecularBioinformáticaEstudos de modelagem molecular dos mecanismos de afinidade relativa para quatro galantamínicos com potencial anti-Alzheimerinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFMGinstname:Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)instacron:UFMGORIGINALdisserta__o.pdfapplication/pdf4323089https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/BUOS-B43MLZ/1/disserta__o.pdf021e8cfbb092eb98f4127b3ebbf09013MD51TEXTdisserta__o.pdf.txtdisserta__o.pdf.txtExtracted texttext/plain161199https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/BUOS-B43MLZ/2/disserta__o.pdf.txtafc2ee0e7041245dc43f27aa10e957b7MD521843/BUOS-B43MLZ2019-11-14 09:21:26.008oai:repositorio.ufmg.br:1843/BUOS-B43MLZRepositório de PublicaçõesPUBhttps://repositorio.ufmg.br/oaiopendoar:2019-11-14T12:21:26Repositório Institucional da UFMG - Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)false
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