Draft genome sequence of Sugiyamaella xylanicola UFMG-CM-Y1884T, a xylan-degrading yeast species isolated from rotting wood samples in Brazil
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Data de Publicação: | 2017 |
Outros Autores: | , , , , , |
Tipo de documento: | Artigo |
Idioma: | eng |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFMG |
Texto Completo: | https://doi.org/10.1016/j.gdata.2017.01.006 http://hdl.handle.net/1843/72644 https://orcid.org/0000-0002-0755-1206 https://orcid.org/0000-0003-2775-1333 https://orcid.org/0000-0002-2548-1053 https://orcid.org/0000-0001-5245-2365 https://orcid.org/0000-0001-9749-5182 |
Resumo: | Apresentamos o rascunho da sequência do genoma da cepa da levedura Sugiyamaella xylanicola UFMG-CM-Y1884T (= UFMG-CA-32.1T = CBS 12683T), uma espécie degradadora de xilana capaz de fermentar d-xilose em etanol. O genoma montado tem um tamanho de ~ 13,7 Mb e um conteúdo de GC de 33,8% e contém 5.971 genes codificadores de proteínas. Identificamos 15 genes com similaridade significativa com o gene da d-xilose redutase de várias outras espécies de fungos. O rascunho do genoma montado a partir do sequenciamento shotgun de todo o genoma da levedura Sugiyamaella xylanicola UFMG-CM-Y1884T (= UFMG-CA-32.1T = CBS 12683T) foi depositado em DDBJ/ENA/GenBank sob o número de acesso MQSX00000000 na versão MQSX01000000. |
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Draft genome sequence of Sugiyamaella xylanicola UFMG-CM-Y1884T, a xylan-degrading yeast species isolated from rotting wood samples in BrazilSugiyamaella xylanicolaGenome sequenceD-xylose-fermenting yeastXylan-degrading speciesGenoma microbianoD-xiloseLeveduras (Fungos)Apresentamos o rascunho da sequência do genoma da cepa da levedura Sugiyamaella xylanicola UFMG-CM-Y1884T (= UFMG-CA-32.1T = CBS 12683T), uma espécie degradadora de xilana capaz de fermentar d-xilose em etanol. O genoma montado tem um tamanho de ~ 13,7 Mb e um conteúdo de GC de 33,8% e contém 5.971 genes codificadores de proteínas. Identificamos 15 genes com similaridade significativa com o gene da d-xilose redutase de várias outras espécies de fungos. O rascunho do genoma montado a partir do sequenciamento shotgun de todo o genoma da levedura Sugiyamaella xylanicola UFMG-CM-Y1884T (= UFMG-CA-32.1T = CBS 12683T) foi depositado em DDBJ/ENA/GenBank sob o número de acesso MQSX00000000 na versão MQSX01000000.We present the draft genome sequence of the type strain of the yeast Sugiyamaella xylanicola UFMG-CM-Y1884T (= UFMG-CA-32.1T = CBS 12683T), a xylan-degrading species capable of fermenting d-xylose to ethanol. The assembled genome has a size of ~ 13.7 Mb and a GC content of 33.8% and contains 5971 protein-coding genes. We identified 15 genes with significant similarity to the d-xylose reductase gene from several other fungal species. The draft genome assembled from whole-genome shotgun sequencing of the yeast Sugiyamaella xylanicola UFMG-CM-Y1884T (= UFMG-CA-32.1T = CBS 12683T) has been deposited at DDBJ/ENA/GenBank under the accession number MQSX00000000 under version MQSX01000000.CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoFAPEMIG - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas GeraisUniversidade Federal de Minas GeraisBrasilICB - DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA E IMUNOLOGIAICB - DEPARTAMENTO DE BOTÂNICAICB - DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGIAUFMG2024-08-05T20:04:50Z2024-08-05T20:04:50Z2017info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articlepdfapplication/pdfhttps://doi.org/10.1016/j.gdata.2017.01.0062213-5960http://hdl.handle.net/1843/72644https://orcid.org/0000-0002-0755-1206https://orcid.org/0000-0003-2775-1333https://orcid.org/0000-0002-2548-1053https://orcid.org/0000-0001-5245-2365https://orcid.org/0000-0001-9749-5182engGenomics DataThiago Mafra BatistaRennan G. MoreiraHeron O. HilárioCamila G. MoraisGlória R. FrancoLuiz H. RosaCarlos Augusto Rosainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFMGinstname:Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)instacron:UFMG2024-08-05T20:04:51Zoai:repositorio.ufmg.br:1843/72644Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufmg.br/oairepositorio@ufmg.bropendoar:2024-08-05T20:04:51Repositório Institucional da UFMG - Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)false |
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Draft genome sequence of Sugiyamaella xylanicola UFMG-CM-Y1884T, a xylan-degrading yeast species isolated from rotting wood samples in Brazil Thiago Mafra Batista Sugiyamaella xylanicola Genome sequence D-xylose-fermenting yeast Xylan-degrading species Genoma microbiano D-xilose Leveduras (Fungos) |
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Apresentamos o rascunho da sequência do genoma da cepa da levedura Sugiyamaella xylanicola UFMG-CM-Y1884T (= UFMG-CA-32.1T = CBS 12683T), uma espécie degradadora de xilana capaz de fermentar d-xilose em etanol. O genoma montado tem um tamanho de ~ 13,7 Mb e um conteúdo de GC de 33,8% e contém 5.971 genes codificadores de proteínas. Identificamos 15 genes com similaridade significativa com o gene da d-xilose redutase de várias outras espécies de fungos. O rascunho do genoma montado a partir do sequenciamento shotgun de todo o genoma da levedura Sugiyamaella xylanicola UFMG-CM-Y1884T (= UFMG-CA-32.1T = CBS 12683T) foi depositado em DDBJ/ENA/GenBank sob o número de acesso MQSX00000000 na versão MQSX01000000. |
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