Molecular characterization of progenies of bacurizeiro (Platonia insignis) from Marajó Island, northeastern Amazon
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Data de Publicação: | 2017 |
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Título da fonte: | Repositório Institucional da UFPA |
Texto Completo: | http://repositorio.ufpa.br/jspui/handle/2011/10794 http://dx.doi.org/10.1590/1809-4392201701302 |
Resumo: | O bacurizeiro (Platonia insignis Mart.) é uma espécie frutífera nativa da Amazônia muito utilizada na cultura alimentar nas regiões Norte e Nordeste do Brasil. Devido a seu grande potencial econômico regional, a espécie vem sendo conservada em bancos ativos de germoplasma (BAG) para apoiar programas de melhoramento genético. Dessa forma, o objetivo deste trabalho foi caracterizar molecularmente acessos de P. insignis pertencentes ao BAG da Embrapa Amazônia Oriental por meio de marcadores ISSR (Inter Simple Sequence Repeat). Foram coletados 78 acessos de P. insignis pertencentes a 16 progênies coletadas em dois locais diferentes na Ilha de Marajó, PA. Das 16 progênies, sete foram coletadas em Soure e nove em Salvaterra. Os 78 acessos foram genotipados com 23 primers ISSR pré-selecionados. Obteve-se 121 produtos amplificados, dos quais 54 foram polimórficos. Os primers mais polimórficos foram UBC 834, UBC 899 e UBC 900. Já os primers UBC810 e UBC884 não apresentaram bandas polimórficas. Das 54 marcas, 49 foram selecionadas para as análises genéticas. A AMOVA entre e dentro de progênies identificou baixa diferenciação genética (ΦPT = 0,064, P<0,001) com maior diversidade dentro de progênies (96%), bem como baixa diferenciação genética entre os locais de coleta (ΦPT = 0,025, P<0,013), com maior diversidade dentro (98%) do que entre locais. O agrupamento pelo método UPGMA, com base nas similaridades de Jaccard entre os acessos, não separou as amostras por progênie ou local de coleta. Recomenda-se que novas coletas de germoplasma considerem maior esforço de coleta em cada local amostrado. |
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2019-03-27T18:08:40Z2019-03-27T18:08:40Z2017-12PONTES, Lígia Cristine Gonçalves et al. Molecular characterization of progenies of bacurizeiro (Platonia insignis) from Marajó Island, northeastern Amazon. Acta Amazonica, Manaus, v. 47, n. 4, p. 293-300, Oct./Dec. 2017. DOI: http://dx.doi.org/10.1590/1809-4392201701302. Disponível em: http://repositorio.ufpa.br/jspui/handle/2011/10794. Acesso em:.1809-4392http://repositorio.ufpa.br/jspui/handle/2011/10794http://dx.doi.org/10.1590/1809-4392201701302O bacurizeiro (Platonia insignis Mart.) é uma espécie frutífera nativa da Amazônia muito utilizada na cultura alimentar nas regiões Norte e Nordeste do Brasil. Devido a seu grande potencial econômico regional, a espécie vem sendo conservada em bancos ativos de germoplasma (BAG) para apoiar programas de melhoramento genético. Dessa forma, o objetivo deste trabalho foi caracterizar molecularmente acessos de P. insignis pertencentes ao BAG da Embrapa Amazônia Oriental por meio de marcadores ISSR (Inter Simple Sequence Repeat). Foram coletados 78 acessos de P. insignis pertencentes a 16 progênies coletadas em dois locais diferentes na Ilha de Marajó, PA. Das 16 progênies, sete foram coletadas em Soure e nove em Salvaterra. Os 78 acessos foram genotipados com 23 primers ISSR pré-selecionados. Obteve-se 121 produtos amplificados, dos quais 54 foram polimórficos. Os primers mais polimórficos foram UBC 834, UBC 899 e UBC 900. Já os primers UBC810 e UBC884 não apresentaram bandas polimórficas. Das 54 marcas, 49 foram selecionadas para as análises genéticas. A AMOVA entre e dentro de progênies identificou baixa diferenciação genética (ΦPT = 0,064, P<0,001) com maior diversidade dentro de progênies (96%), bem como baixa diferenciação genética entre os locais de coleta (ΦPT = 0,025, P<0,013), com maior diversidade dentro (98%) do que entre locais. O agrupamento pelo método UPGMA, com base nas similaridades de Jaccard entre os acessos, não separou as amostras por progênie ou local de coleta. Recomenda-se que novas coletas de germoplasma considerem maior esforço de coleta em cada local amostrado.The bacurizeiro (Platonia insignis Mart.) is a tree native to the Amazon whose fruit is much used in the gastronomy in the North and Northeast regions of Brazil. Due to its great economic potential for these regions, the species is being conserved in germplasm banks to support genetic breeding programs. The aim of this work was the molecular characterization of P. insignis accessions belonging to the germplasm bank of the Embrapa Eastern Amazon research unit using ISSR (Inter Simple Sequence Repeat) markers. Seventy-eight accessions of P. insignis belonging to 16 progenies were sampled in two different localities on Marajó Island, state of Pará, Brazil. Among the 16 progenies, seven were collected in Soure and nine in Salvaterra. The 78 accessions were genotyped with 23 pre-selected primers. We obtained 121 amplified products, of which 54 were polymorphic. The most polymorphic primers were UBC 834, UBC 899 and UBC 900. Primers UBC810 and UBC884 did not amplify polymorphic bands. Forty-nine markers out of 54 were selected for genetic analyses. AMOVA within and among progenies showed low genetic differentiation (ΦPT = 0.064, P<0.001) with higher diversity within progenies (96%), low genetic differentiation among sampling localities (ΦPT = 0.025, P<0.013), and higher diversity within (98%) than among localities. Clustering by UPGMA based on Jaccard similarities among pairs of accessions did not separate genotypes according to progeny or sampling localitiy. We recommend that new germplasm surveys consider a greater sampling effort within sampling localitites.EMBRAPA - Empresa Brasileira de Pesquisa AgropecuáriaPONTES, L. C. G. Universidade Federal do ParáengInstituto Nacional de Pesquisas da AmazôniaINPABrasilActa Amazonicahttp://ref.scielo.org/d9x2tfreponame:Repositório Institucional da UFPAinstname:Universidade Federal do Pará (UFPA)instacron:UFPADiversidade genéticaBanco de germoplasmaClusiaceaeGenetic diversityGermplasm bankClusiaceaeMolecular characterization of progenies of bacurizeiro (Platonia insignis) from Marajó Island, northeastern AmazonCaracterização molecular de progênies de bacurizeiro (Platonia insignis) da Ilha de Marajó, nordeste da Amazôniainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/article474293300http://lattes.cnpq.br/1939184553339067http://lattes.cnpq.br/3333132054799190http://lattes.cnpq.br/5420645730181718http://lattes.cnpq.br/0024475963010401http://lattes.cnpq.br/6955194101181577http://lattes.cnpq.br/9863515446766167http://lattes.cnpq.br/9863515446766167PONTES, Lígia Cristine GonçalvesMOURA, Elisa FerreiraMOURA, Mônika FecuryRODRIGUES, Simone de MirandaOLIVEIRA, Maria do Socorro Padilha deCARVALHO, José Edmar Urano deTHERRIER, Josetteinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALArticle_MolecularCharacterizationProgenies.pdfArticle_MolecularCharacterizationProgenies.pdfapplication/pdf510776http://repositorio.ufpa.br/oai/bitstream/2011/10794/1/Article_MolecularCharacterizationProgenies.pdf08ad81fef506b4b4bcaf5aa19c47d851MD51CC-LICENSElicense_urllicense_urltext/plain; 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