Produção e purificação de DNA plasmidial a partir de Escherichia coli recombinante

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: MOREIRA, Keila Aparecida
Data de Publicação: 2003
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPE
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Texto Completo: https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/1851
Resumo: A produção e a purificação de DNA plasmidial com elevado grau de pureza tem tido um elevado interesse nos últimos anos, devido fundamentalmente aos desenvolvimentos de técnicas de medicina molecular, como a terapia gênica e a vacinação com DNA. O plasmídeo pD2 foi produzido em diferentes condições de cultivo, sendo analisado várias parâmetros durante o crescimento, tais como, influência da velocidade de agitação (120, 160 e 200 rpm), concentrações de canamicina (10, 20, 30, 40 e 50mg ml-1) e meio de cultura (Terrific Broth - TB ou Luria Bertani com glicose - LBG). Foram também investigados o efeito da partição de DNA plasmidial, RNA e proteínas totais nos sistemas de duas fases aquosas (SDFA) do tipo polietileno glicol (PEG)/sal de fosfato de sódio dibásico (K2HPO4) do plasmídeo (pD2) durante o processo de purificação. Analisou-se a influência da massa molar do PEG, massa que carrega o sistema da solução de lise (20, 40 ou 60% m/m) na partição do plasmídeo. A técnica de precipitação com sulfato de amônio (2,0, 2,5 e 3,0M), seguido da técnica cromatográfica de interação hidrofóbica (CIH) utilizando como matriz estacionária o suporte Phenyl Sepharose 6 Fast Flow foram utilizadas para purificar o plasmídeo pVax-LacZ. A velocidade de agitação que apresentou os melhores resultados para a produção de biomassa e DNA plasmidial foi a 200 rpm, enquanto as concentrações 30- 50mg mL-1 de canamicina apresentaram resultados semelhantes para todas as condições estudadas. O meio de cultura TB apresentou ser o melhor em termos de produção de DNA plasmidial e biomassa, neste meio de cultura o plasmídeo foi mais estável, apresentando 82% de células contendo o plasmídeo. O DNA plasmidial foi particionado entre a fase superior e inferior na dependência da massa molar do polímero constituinte do sistema, tendo uma grande quantidade de proteína do lisado celular acumulada na interfase dos sistemas. O melhor rendimento plasmidial (37%) foi obtido com sistema PEG 400/K2HPO4 (20/20% m/m) carregado com 60% (m/m) de lisado celular. O procedimento de precipitação com sulfato de amônio (2,5M) seguido da cromatografia de interação hidrofóbica foram capazes de separar proteínas e DNA genômico do plasmídeo, obtendo 51% de rendimento e um fator de purificação de 3,3
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spelling MOREIRA, Keila AparecidaLIMA FILHO, José Luiz de2014-06-12T15:52:45Z2014-06-12T15:52:45Z2003Aparecida Moreira, Keila; Luiz de Lima Filho, José. Produção e purificação de DNA plasmidial a partir de Escherichia coli recombinante. 2003. Tese (Doutorado). Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas, Universidade Federal de Pernambuco, Recife, 2003.https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/1851ark:/64986/0013000001nwqA produção e a purificação de DNA plasmidial com elevado grau de pureza tem tido um elevado interesse nos últimos anos, devido fundamentalmente aos desenvolvimentos de técnicas de medicina molecular, como a terapia gênica e a vacinação com DNA. O plasmídeo pD2 foi produzido em diferentes condições de cultivo, sendo analisado várias parâmetros durante o crescimento, tais como, influência da velocidade de agitação (120, 160 e 200 rpm), concentrações de canamicina (10, 20, 30, 40 e 50mg ml-1) e meio de cultura (Terrific Broth - TB ou Luria Bertani com glicose - LBG). Foram também investigados o efeito da partição de DNA plasmidial, RNA e proteínas totais nos sistemas de duas fases aquosas (SDFA) do tipo polietileno glicol (PEG)/sal de fosfato de sódio dibásico (K2HPO4) do plasmídeo (pD2) durante o processo de purificação. Analisou-se a influência da massa molar do PEG, massa que carrega o sistema da solução de lise (20, 40 ou 60% m/m) na partição do plasmídeo. A técnica de precipitação com sulfato de amônio (2,0, 2,5 e 3,0M), seguido da técnica cromatográfica de interação hidrofóbica (CIH) utilizando como matriz estacionária o suporte Phenyl Sepharose 6 Fast Flow foram utilizadas para purificar o plasmídeo pVax-LacZ. A velocidade de agitação que apresentou os melhores resultados para a produção de biomassa e DNA plasmidial foi a 200 rpm, enquanto as concentrações 30- 50mg mL-1 de canamicina apresentaram resultados semelhantes para todas as condições estudadas. O meio de cultura TB apresentou ser o melhor em termos de produção de DNA plasmidial e biomassa, neste meio de cultura o plasmídeo foi mais estável, apresentando 82% de células contendo o plasmídeo. O DNA plasmidial foi particionado entre a fase superior e inferior na dependência da massa molar do polímero constituinte do sistema, tendo uma grande quantidade de proteína do lisado celular acumulada na interfase dos sistemas. O melhor rendimento plasmidial (37%) foi obtido com sistema PEG 400/K2HPO4 (20/20% m/m) carregado com 60% (m/m) de lisado celular. O procedimento de precipitação com sulfato de amônio (2,5M) seguido da cromatografia de interação hidrofóbica foram capazes de separar proteínas e DNA genômico do plasmídeo, obtendo 51% de rendimento e um fator de purificação de 3,3porUniversidade Federal de PernambucoAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/openAccessMicrobiologiaBiotecnologiaProdução e purificação de DNA plasmidial a partir de Escherichia coli recombinanteinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisreponame:Repositório Institucional da UFPEinstname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)instacron:UFPEORIGINALarquivo5052_1.pdfapplication/pdf2036213https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/1851/1/arquivo5052_1.pdf2c0f7ed2b7243e81e2ec1a3c2684f2dfMD51LICENSElicense.txttext/plain1748https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/1851/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52TEXTarquivo5052_1.pdf.txtarquivo5052_1.pdf.txtExtracted texttext/plain131438https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/1851/3/arquivo5052_1.pdf.txt54aabd02938e5eb2d78964be074a8b66MD53THUMBNAILarquivo5052_1.pdf.jpgarquivo5052_1.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1255https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/1851/4/arquivo5052_1.pdf.jpgc0f8aaab422612ff02daffb08e210545MD54123456789/18512019-10-25 02:41:52.522oai:repositorio.ufpe.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufpe.br/oai/requestattena@ufpe.bropendoar:22212019-10-25T05:41:52Repositório Institucional da UFPE - Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)false
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