Filogenia de proteínas da subfamília DNAJ/HSP40 e estudo da organização dos membros das subclasses A, B e C

• Autor(a) principal: Musskopf, Maiara Kolbe
• Data de Publicação: 2018
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFRGS
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/198167
• topic: Chaperonas moleculares; Heterogeneidade; Filogenia; DNAJ/HSP40; Molecular chaperones; Heterogeneity; Phylogeny

A família de chaperonas moleculares DNAJ/HSP40 é uma das maiores e mais complexas subfamílias de Heat Shock Proteins (HSPs) descobertas até hoje, e seus membros são encontrados desde bactérias até humanos. A assinatura desta subfamília é o domínio-J, o qual é uma região de aproximadamente 70 aminoácidos bastante conservada evolutivamente entre diversos organismos e é fundamental para a maquinaria HSP70 das células. Apesar de compartilharem o domínio-J, estas proteínas são divididas em 3 subclasses (A, B ou C) de acordo com um sistema de classificação baseado na presença ou ausência de outras regiões, levando ao agrupamento de proteínas funcionalmente similares no caso das subclasses A e B, mas muito heterogêneas no caso da subclasse C. De forma interessante, a quantidade de proteínas DNAJC em relação as proteínas DNAJA e DNAJB e significativamente maior, representando 78.34% da família DNAJ proveniente do banco de dados utilizado neste trabalho, enquanto as subclasses A e B representam 13.66% e 8.00%, respectivamente. Esta proporção destoante e a considerável heterogeneidade desta família instigam questionamentos referentes a relação entre as subclasses de DNAJ em diferentes organismos. Apesar dos estudos evolutivos voltados para a família DNAJ explorarem a diversidade de alguns dos seus membros em uma ou mais espécies, análises filogenéticas abrangendo as três subclasses ao longo da evolução ainda precisam ser exploradas. Desta forma, o presente estudo visa analisar a organização das proteínas DNAJ das subclasses A, B e C de diversos organismos através de uma abordagem filogenética utilizando um banco de dados de HSPs manualmente curado. Portanto, diversas reconstruções filogenéticas foram geradas a partir do alinhamento de toda a extensão da proteína na ou da região correspondente ao domínio-J, de acordo com o conjunto de dados. Foi possível observar que um pequeno grupo de proteínas da subclasse C e pontualmente distinto dos outros membros da família DNAJ em relação a estrutura primária do domínio-J, permanecendo agrupado nas diferentes árvores. Além disso, a filogenia das 3 subclasses reunidas demonstrou uma possível divisão evolutiva da maioria dos membros das subclasses A e B em relação a maioria dos membros da subclasse C.