Detection of different Brazilian strains of the bovine herpesvirus-1 (BHV-1) by polymerase chain reaction
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Data de Publicação: | 1999 |
Outros Autores: | , , |
Tipo de documento: | Artigo |
Idioma: | eng |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFS |
Texto Completo: | https://ri.ufs.br/handle/riufs/866 |
Resumo: | A técnica da reação em cadeia pela DNA polimerase (PCR) foi usada para a amplificação rápida de um fragmento de 456bp da região única curta (Us) do genoma do BHV-1. Iniciadores de 18pb do gene da ORF1 foram usados para a amplificação das amostras-padrão e brasileiras. Uma amplificação clássica não foi bem sucedida. A amplificação foi obtida quando se escolheu uma região com baixa concentração de GC no DNA do BHV-1 e através da desnaturação térmica (95° C para 5min) seguida de ciclos térmicos (94° C por 1min e 30seg; 52° C por 1min; 72° C por 1min e 30seg; e ainda por 35 ciclos de 94° C por 1min; 52° C por 1min; 72° C por 1min e 30seg; usando um tempo de extensão final de 72° C por 5min). A clivagem com Pst I confirmou a especificidade do fragmento da ORF 1 do BHV-1. A amplificação do fragmento em todas as amostras testadas sugere que a região é fortemente conservada no genoma do BHV-1. Este PCR poderá detectar rapidamente amostras clínicas, sendo sensível e específico para diagnosticar infecções pelo BHV-1. |
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A amplificação foi obtida quando se escolheu uma região com baixa concentração de GC no DNA do BHV-1 e através da desnaturação térmica (95° C para 5min) seguida de ciclos térmicos (94° C por 1min e 30seg; 52° C por 1min; 72° C por 1min e 30seg; e ainda por 35 ciclos de 94° C por 1min; 52° C por 1min; 72° C por 1min e 30seg; usando um tempo de extensão final de 72° C por 5min). A clivagem com Pst I confirmou a especificidade do fragmento da ORF 1 do BHV-1. A amplificação do fragmento em todas as amostras testadas sugere que a região é fortemente conservada no genoma do BHV-1. Este PCR poderá detectar rapidamente amostras clínicas, sendo sensível e específico para diagnosticar infecções pelo BHV-1.Escola de Veterinária UFMGHerpesvirus bovinoReação em cadeia da polimeraseDNADetection of different Brazilian strains of the bovine herpesvirus-1 (BHV-1) by polymerase chain reactionDetecção de amostras brasileiras do herpesvirus bovino 1 (BHV-1) pela reação em cadeia pela polimeraseinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleengreponame:Repositório Institucional da UFSinstname:Universidade Federal de Sergipe (UFS)instacron:UFSinfo:eu-repo/semantics/openAccessTHUMBNAILDetectionBHV-1.pdf.jpgDetectionBHV-1.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1719https://ri.ufs.br/jspui/bitstream/riufs/866/4/DetectionBHV-1.pdf.jpgeba1cf662ef8ce26290e3fe48a1e6cc1MD54ORIGINALDetectionBHV-1.pdfDetectionBHV-1.pdfapplication/pdf164373https://ri.ufs.br/jspui/bitstream/riufs/866/1/DetectionBHV-1.pdfb1851a50d86532e97032e249b2aeb457MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://ri.ufs.br/jspui/bitstream/riufs/866/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52TEXTDetectionBHV-1.pdf.txtDetectionBHV-1.pdf.txtExtracted texttext/plain12007https://ri.ufs.br/jspui/bitstream/riufs/866/3/DetectionBHV-1.pdf.txtd2db528bc4d0b567136abdf3016524d7MD53riufs/8662014-02-04 02:00:16.192oai:ufs.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://ri.ufs.br/oai/requestrepositorio@academico.ufs.bropendoar:2014-02-04T05:00:16Repositório Institucional da UFS - Universidade Federal de Sergipe (UFS)false |
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A técnica da reação em cadeia pela DNA polimerase (PCR) foi usada para a amplificação rápida de um fragmento de 456bp da região única curta (Us) do genoma do BHV-1. Iniciadores de 18pb do gene da ORF1 foram usados para a amplificação das amostras-padrão e brasileiras. Uma amplificação clássica não foi bem sucedida. A amplificação foi obtida quando se escolheu uma região com baixa concentração de GC no DNA do BHV-1 e através da desnaturação térmica (95° C para 5min) seguida de ciclos térmicos (94° C por 1min e 30seg; 52° C por 1min; 72° C por 1min e 30seg; e ainda por 35 ciclos de 94° C por 1min; 52° C por 1min; 72° C por 1min e 30seg; usando um tempo de extensão final de 72° C por 5min). A clivagem com Pst I confirmou a especificidade do fragmento da ORF 1 do BHV-1. A amplificação do fragmento em todas as amostras testadas sugere que a região é fortemente conservada no genoma do BHV-1. Este PCR poderá detectar rapidamente amostras clínicas, sendo sensível e específico para diagnosticar infecções pelo BHV-1. |
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