Genômica comparativa como ferramenta para estudar a predisposição à displsia do quadril canina

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Geraldo, Márcia Eduarda
Data de Publicação: 2022
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFSC
Texto Completo: https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/233000
Resumo: TCC(graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências Biológicas. Biologia.
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spelling Genômica comparativa como ferramenta para estudar a predisposição à displsia do quadril caninaMedicina VeterináriaBioinformáticaSinteniaCãesTCC(graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências Biológicas. Biologia.O cão doméstico possui um papel importante na sociedade, desempenhando inúmeras atividades além de ser considerado membro importante nas famílias. Foi uma das primeiras espécies a serem domesticadas e alguns registros fósseis indicam uma domesticação com cerca de 30.000 anos antes do presente, ocorrendo de forma natural, inicialmente. Nos últimos séculos novas raças surgiram devido a seleção artificial, buscando características que melhor se adequassem às necessidades e interesses dos criadores. Como consequência, observamos uma ampla variedade de fenótipos, porém, além das características desejadas, foram selecionadas também mutações de susceptibilidade que podem afetar a saúde e bem-estar do animal. Uma doença de grande interesse na medicina veterinária é a displasia do quadril canina. Trata-se de uma doença genética, multifatorial, que causa a má formação da articulação do quadril afetando principalmente os cães de grande porte. Sendo uma doença complexa e de alta incidência, esse estudo buscou comparar as regiões genômicas associadas ao fenótipo afetado da doença, visando uma melhor compreensão dessas regiões e favorecendo abordagens precoces da medicina veterinária. Através do banco de dados públicos NCBI GenBank, obtivemos os dados genômicos das variedades Basenji, Boxer, Dogue Alemão, Labrador Retriever e Pastor Alemão. Os haplótipos foram alinhados e as maiores semelhanças foram obtidas entre as raças Boxer e Dogue Alemão, e entre Boxer e Pastor Alemão, ambos com 99.62% de identidade. A menor semelhança foi entre as raças Basenji e Labrador Retriever, com 99.51% de identidade. Após revisão bibliográfica, identificamos um marcador genético associado ao gene da Fibrilina 2 (FBN2), presente no cromossomo 11, envolvido com a displasia do quadril. Submetemos a região associada ao gene à análise de sintenia, buscando compreender o quão relacionadas essas áreas estão entre as raças estudadas. Obtivemos um total de 87.45% de cobertura entre as regiões. Encontramos também alguns dados de variantes genéticas, sendo uma delas compartilhadas entre Labrador Retriever e Pastor Alemão. A falta de informações sobre esses genomas, apesar da importância da espécie, se tornou um fator limitante para maiores investigações. A análise de alinhamento de haplótipos de cães permitiu um reconhecimento do grau de identidade entre as variedades, permitindo mensurar a semelhança entre elas. A análise de sintenia entre a região associada ao gene FBN2 proporcionou um melhor entendimentonas diferentes raças abordadas e por sua vez, o levantamento de variantes nos permitiu verificar a variabilidade dessa região. Este presente trabalho conclui que a análise genômica comparativa é uma ferramenta interessante para o estudo de predisposição a doenças genéticas, podendo ser aplicada à medicina veterinária buscando aprofundar o conhecimento acerca da displasia do quadril em distintas variedades de cães.Florianópolis, SC.Silva, Guilherme de Toledo eMaia, Guilherme AugustoUniversidade Federal de Santa CatarinaGeraldo, Márcia Eduarda2022-03-25T17:45:18Z2022-03-25T17:45:18Z2022-03-07info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesis48 f.application/pdfhttps://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/233000info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFSCinstname:Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)instacron:UFSC2022-03-25T17:45:19Zoai:repositorio.ufsc.br:123456789/233000Repositório InstitucionalPUBhttp://150.162.242.35/oai/requestopendoar:23732022-03-25T17:45:19Repositório Institucional da UFSC - Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)false
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