Aspectos sobre a diversidade genética de Escherichia coli enteropatogênica atípica e sua relação com o potencial patogênico extra intestinal

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Silva, Roberta Souza [UNIFESP]
Data de Publicação: 2022
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UNIFESP
Texto Completo: https://repositorio.unifesp.br/xmlui/handle/11600/63934
Resumo: Escherichia coli é reconhecidamente dotada de grande plasticidade genética, no sentido de ser uma espécie receptiva para genes que chegam por meio de mecanismos de transferência horizontal, ou HGT, mediada por plasmídeos, bacteriófagos, elementos genéticos transponíveis e ilhas de patogenicidade (PAI). As E. coli enteropatogênicas atípicas, aEPEC, são consideradas um patotipo emergente associado à diarreia aguda e persistente, definido geneticamente pela presença da PAI LEE e ausência dos genes bfpA e stx. Tendo em vista o aumento dos relatos de aEPEC isoladas de casos de infecções extra intestinais, este trabalho buscou investigar a ocorrência em aEPEC de determinantes genéticos associados à patogenicidade extra intestinal, e seu potencial de virulência em modelo de patogenicidade extra intestinal. Foram estudadas 113 cepas pertencentes a 48 diferentes tipos sorológricos. Testes fenotípicos foram empregados para detectar cepas colicinogênicas, hemolíticas e resistentes ao soro humano. Genes associados às propriedades fenotípicas detectadas foram pesquisados por meio de reações em cadeia da polimerase (PCR) utilizando-se iniciadores específicos. A PCR também foi utilizada para determinar a filogenia, a presença de Ilhas de patogenicidade (PAIs), e os marcadores genéticos de virulência extraintestinal intrínseca (ExPEC) e de uropatogenicidade (UPEC). A relação clonal entre diferentes cepas de aEPEC foi avaliada pelo método de “Randon Amplified Polymorphic DNA”. O perfil plasmidial foi obtido utilizando-se o método de extração por lise alcalina. Os ensaios de virulência in vivo empregaram o modelo de infecção em larvas de Galleria mellonela. Cerca de 75% das cepas foi dos filogrupos B1 e A, e 15% de B2. Curiosamente, cada tipo sorológico foi alocado em um único filogrupo. Vinte e um por cento das cepas mostrou atividade colicinogênica, com Ia e Ib sendo os tipos de colicinas mais frequentes, enquanto a atividade hemolítica foi detectada em 18,6%. A maioria das cepas apresentou atividade hemolítica após 24 horas, incompatível com o fato de apresentarem somente o gene hlyA. Mais de 88% das cepas foi resistente ao soro normal no teste de viabilidade, embora cerca da metade não apresentasse aumento de turbidez nas culturas. Marcadores de PAIs foram encontrados em 55,7% da amostragem, mas somente a PAI IV536 parecia estar íntegra como denotado pela presença do gene irp2, enquanto as PAIs ICFT073, IICFT073, IJ96 e II536 não tiveram seus ix genes detectados. Houve grande diversidade de perfis plasmidiais e de clones não relacionados entre si. Seis cepas de aEPEC foram geneticamente classificadas como híbridas por serem classificadas como ExPEC (5 cepas) e UPEC (uma cepa), e as três testadas confirmaram seu potencial de virulência extra intestinal no modelo de Gallleria mellonella. Conclui-se que aEPEC compreende inúmeros clones não relacionados, caracterizados por um background genético receptivo à aquisição de genes mediados por eventos de HGT. Esses eventos frequentemente parecem não ser bem sucedidos, pois tais genes não obrigatoriamente se perpetuam. Mas, quando isso ocorre, podem promover a evolução de subtipos patogênicos ainda pouco reconhecidos, como os híbridos genéticos aEPEC/ExPEC e aEPEC/UPEC evidenciados neste trabalho.
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Tendo em vista o aumento dos relatos de aEPEC isoladas de casos de infecções extra intestinais, este trabalho buscou investigar a ocorrência em aEPEC de determinantes genéticos associados à patogenicidade extra intestinal, e seu potencial de virulência em modelo de patogenicidade extra intestinal. Foram estudadas 113 cepas pertencentes a 48 diferentes tipos sorológricos. Testes fenotípicos foram empregados para detectar cepas colicinogênicas, hemolíticas e resistentes ao soro humano. Genes associados às propriedades fenotípicas detectadas foram pesquisados por meio de reações em cadeia da polimerase (PCR) utilizando-se iniciadores específicos. A PCR também foi utilizada para determinar a filogenia, a presença de Ilhas de patogenicidade (PAIs), e os marcadores genéticos de virulência extraintestinal intrínseca (ExPEC) e de uropatogenicidade (UPEC). A relação clonal entre diferentes cepas de aEPEC foi avaliada pelo método de “Randon Amplified Polymorphic DNA”. O perfil plasmidial foi obtido utilizando-se o método de extração por lise alcalina. Os ensaios de virulência in vivo empregaram o modelo de infecção em larvas de Galleria mellonela. Cerca de 75% das cepas foi dos filogrupos B1 e A, e 15% de B2. Curiosamente, cada tipo sorológico foi alocado em um único filogrupo. Vinte e um por cento das cepas mostrou atividade colicinogênica, com Ia e Ib sendo os tipos de colicinas mais frequentes, enquanto a atividade hemolítica foi detectada em 18,6%. A maioria das cepas apresentou atividade hemolítica após 24 horas, incompatível com o fato de apresentarem somente o gene hlyA. Mais de 88% das cepas foi resistente ao soro normal no teste de viabilidade, embora cerca da metade não apresentasse aumento de turbidez nas culturas. Marcadores de PAIs foram encontrados em 55,7% da amostragem, mas somente a PAI IV536 parecia estar íntegra como denotado pela presença do gene irp2, enquanto as PAIs ICFT073, IICFT073, IJ96 e II536 não tiveram seus ix genes detectados. Houve grande diversidade de perfis plasmidiais e de clones não relacionados entre si. Seis cepas de aEPEC foram geneticamente classificadas como híbridas por serem classificadas como ExPEC (5 cepas) e UPEC (uma cepa), e as três testadas confirmaram seu potencial de virulência extra intestinal no modelo de Gallleria mellonella. Conclui-se que aEPEC compreende inúmeros clones não relacionados, caracterizados por um background genético receptivo à aquisição de genes mediados por eventos de HGT. Esses eventos frequentemente parecem não ser bem sucedidos, pois tais genes não obrigatoriamente se perpetuam. Mas, quando isso ocorre, podem promover a evolução de subtipos patogênicos ainda pouco reconhecidos, como os híbridos genéticos aEPEC/ExPEC e aEPEC/UPEC evidenciados neste trabalho.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)2017/14821-7103 f.porUniversidade Federal de São PauloEscherichia coliaEPECExPECPatogenicidade híbridaAspectos sobre a diversidade genética de Escherichia coli enteropatogênica atípica e sua relação com o potencial patogênico extra intestinalAspects regarding the genetic diversity of atypical enteropathogenic Escherichia coli and its correlation with the extraintestinalinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UNIFESPinstname:Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)instacron:UNIFESPEscola Paulista de Medicina (EPM)Microbiologia e ImunologiaMicrobiologiaORIGINALDissertação Roberta S Silva corrigida.pdfDissertação Roberta S Silva corrigida.pdfDissertaçãoapplication/pdf1662024${dspace.ui.url}/bitstream/11600/63934/1/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20Roberta%20S%20Silva%20corrigida.pdfc08f3ae23a1f2517cc8dfde64356e37eMD51open accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-85893${dspace.ui.url}/bitstream/11600/63934/2/license.txt3ae980289a394a420a869e7a4f50fd6cMD52open accessTEXTDissertação Roberta S Silva corrigida.pdf.txtDissertação Roberta S Silva corrigida.pdf.txtExtracted texttext/plain191716${dspace.ui.url}/bitstream/11600/63934/6/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20Roberta%20S%20Silva%20corrigida.pdf.txt1c034e43cd05be0fabda72d978cc57c7MD56open accessTHUMBNAILDissertação Roberta S Silva corrigida.pdf.jpgDissertação Roberta S Silva corrigida.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg3942${dspace.ui.url}/bitstream/11600/63934/8/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20Roberta%20S%20Silva%20corrigida.pdf.jpg682c30efd9a74e4bdc76d0ae85065614MD58open access11600/639342023-05-16 01:41:10.796open 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author Silva, Roberta Souza [UNIFESP]
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aEPEC
ExPEC
Patogenicidade híbrida
topic Escherichia coli
aEPEC
ExPEC
Patogenicidade híbrida
description Escherichia coli é reconhecidamente dotada de grande plasticidade genética, no sentido de ser uma espécie receptiva para genes que chegam por meio de mecanismos de transferência horizontal, ou HGT, mediada por plasmídeos, bacteriófagos, elementos genéticos transponíveis e ilhas de patogenicidade (PAI). As E. coli enteropatogênicas atípicas, aEPEC, são consideradas um patotipo emergente associado à diarreia aguda e persistente, definido geneticamente pela presença da PAI LEE e ausência dos genes bfpA e stx. Tendo em vista o aumento dos relatos de aEPEC isoladas de casos de infecções extra intestinais, este trabalho buscou investigar a ocorrência em aEPEC de determinantes genéticos associados à patogenicidade extra intestinal, e seu potencial de virulência em modelo de patogenicidade extra intestinal. Foram estudadas 113 cepas pertencentes a 48 diferentes tipos sorológricos. Testes fenotípicos foram empregados para detectar cepas colicinogênicas, hemolíticas e resistentes ao soro humano. Genes associados às propriedades fenotípicas detectadas foram pesquisados por meio de reações em cadeia da polimerase (PCR) utilizando-se iniciadores específicos. A PCR também foi utilizada para determinar a filogenia, a presença de Ilhas de patogenicidade (PAIs), e os marcadores genéticos de virulência extraintestinal intrínseca (ExPEC) e de uropatogenicidade (UPEC). A relação clonal entre diferentes cepas de aEPEC foi avaliada pelo método de “Randon Amplified Polymorphic DNA”. O perfil plasmidial foi obtido utilizando-se o método de extração por lise alcalina. Os ensaios de virulência in vivo empregaram o modelo de infecção em larvas de Galleria mellonela. Cerca de 75% das cepas foi dos filogrupos B1 e A, e 15% de B2. Curiosamente, cada tipo sorológico foi alocado em um único filogrupo. Vinte e um por cento das cepas mostrou atividade colicinogênica, com Ia e Ib sendo os tipos de colicinas mais frequentes, enquanto a atividade hemolítica foi detectada em 18,6%. A maioria das cepas apresentou atividade hemolítica após 24 horas, incompatível com o fato de apresentarem somente o gene hlyA. Mais de 88% das cepas foi resistente ao soro normal no teste de viabilidade, embora cerca da metade não apresentasse aumento de turbidez nas culturas. Marcadores de PAIs foram encontrados em 55,7% da amostragem, mas somente a PAI IV536 parecia estar íntegra como denotado pela presença do gene irp2, enquanto as PAIs ICFT073, IICFT073, IJ96 e II536 não tiveram seus ix genes detectados. Houve grande diversidade de perfis plasmidiais e de clones não relacionados entre si. Seis cepas de aEPEC foram geneticamente classificadas como híbridas por serem classificadas como ExPEC (5 cepas) e UPEC (uma cepa), e as três testadas confirmaram seu potencial de virulência extra intestinal no modelo de Gallleria mellonella. Conclui-se que aEPEC compreende inúmeros clones não relacionados, caracterizados por um background genético receptivo à aquisição de genes mediados por eventos de HGT. Esses eventos frequentemente parecem não ser bem sucedidos, pois tais genes não obrigatoriamente se perpetuam. Mas, quando isso ocorre, podem promover a evolução de subtipos patogênicos ainda pouco reconhecidos, como os híbridos genéticos aEPEC/ExPEC e aEPEC/UPEC evidenciados neste trabalho.
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