Interação genótipos ambientes em animais via modelos de normas de reação
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2012 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | LOCUS Repositório Institucional da UFV |
Texto Completo: | http://locus.ufv.br/handle/123456789/4047 |
Resumo: | A basic issue in animal genetic improvement is if the selection of animals practiced in a given environment results in genetic progress in other environment. The presence of genotype environment interaction (GEI) is characterized by different response of genotypes to environmental variations, which can cause change in the classification of the genotypes in different environments. Among the ways to evaluate the GEI, models of reaction norms (MRN) have been distinguished themselves worldwide today. The GEI is a linear covariance function that lets you assign to each animal, two random regression coefficients (intercept and slope) that predict the genetic value depending on the environment. Thus, each animal has a genetic value for each environment. This study aims to verify the presence of GEI for weaning weight in Nelore Mocho created in different regions of Brazilian northeast, using the model of reaction norms. It was adjusted two models of norms of reaction to the data, MRN in two steps and MRN in one step. The first uses a model without considering the genotype environment interaction to obtain estimates of the environment effects and then uses them as a known covariate in a random regression model. The second, under the Bayesian approach estimates all parameters jointly. The analyzes were conducted using software SAS, R, AMC and Intergen. Based on two of the three criteria used for choosing the model the was the MRN in one step. Through this model it was possible to verify the presence of genotype environment interaction and to estimate the genetic value of animals for weaning weight in each producing region in the Northeast. Thus, it is possible to recommend the most appropriate sires for each environment studied, taking advantage of the GEI effects. |
id |
UFV_0192308aeb4f8976c7cfbb2407ce59e5 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:locus.ufv.br:123456789/4047 |
network_acronym_str |
UFV |
network_name_str |
LOCUS Repositório Institucional da UFV |
repository_id_str |
2145 |
spelling |
Rodrigues, Daniele Tôrreshttp://lattes.cnpq.br/4682555268827167Resende, Marcos Deon Vilela dehttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4709374E4Silva, Fabyano Fonseca ehttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4766260Z2Carneiro, Antônio Policarpo Souzahttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4799449E8Souza, Gustavo Henrique dehttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4760298P62015-03-26T13:32:13Z2012-11-142015-03-26T13:32:13Z2012-02-17RODRIGUES, Daniele Tôrres. Genotype environment interaction in animals by models of reaction norms. 2012. 86 f. Dissertação (Mestrado em Estatística Aplicada e Biometria) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2012.http://locus.ufv.br/handle/123456789/4047A basic issue in animal genetic improvement is if the selection of animals practiced in a given environment results in genetic progress in other environment. The presence of genotype environment interaction (GEI) is characterized by different response of genotypes to environmental variations, which can cause change in the classification of the genotypes in different environments. Among the ways to evaluate the GEI, models of reaction norms (MRN) have been distinguished themselves worldwide today. The GEI is a linear covariance function that lets you assign to each animal, two random regression coefficients (intercept and slope) that predict the genetic value depending on the environment. Thus, each animal has a genetic value for each environment. This study aims to verify the presence of GEI for weaning weight in Nelore Mocho created in different regions of Brazilian northeast, using the model of reaction norms. It was adjusted two models of norms of reaction to the data, MRN in two steps and MRN in one step. The first uses a model without considering the genotype environment interaction to obtain estimates of the environment effects and then uses them as a known covariate in a random regression model. The second, under the Bayesian approach estimates all parameters jointly. The analyzes were conducted using software SAS, R, AMC and Intergen. Based on two of the three criteria used for choosing the model the was the MRN in one step. Through this model it was possible to verify the presence of genotype environment interaction and to estimate the genetic value of animals for weaning weight in each producing region in the Northeast. Thus, it is possible to recommend the most appropriate sires for each environment studied, taking advantage of the GEI effects.Uma questão básica no melhoramento genético animal é se a seleção dos animais praticada em um determinado ambiente resulta em progresso genético em outro tipo de ambiente. A presença de interação genótipos ambientes (IGA) é caracterizada pela resposta diferenciada dos genótipos às variações ambientais, o que pode ocasionar alteração na classificação dos genótipos nos diferentes ambientes. Dentre as formas de se avaliar a IGA, os modelos de norma de reação (MNR) têm se destacado, atualmente, em todo o mundo. O MNR linear é uma função de covariância que permite atribuir a cada animal, dois coeficientes de regressão aleatórios (intercepto e inclinação) que predizem o valor genético em função do ambiente. Assim, cada animal terá um valor genético predito para cada ambiente. Este estudo tem o objetivo de verificar a presença de IGA para peso à desmama em bovinos da raça Nelore Mocho criados em diferentes regiões produtoras no Nordeste do Brasil, utilizando o modelo de normas de reação. Ajustou-se dois modelos de normas de reação aos dados, MNR em dois passos e o MNR em um passo. O primeiro utiliza um modelo sem considerar a interação genótipos ambientes para obter estimativas dos efeitos de ambiente e em seguida as utiliza como uma covariável conhecida em um modelo de regressão aleatória e o segundo, sob o enfoque Bayesiano, estima todos os parâmetros simultaneamente. As análises foram realizadas por meio dos softwares SAS, R, AMC e Intergen. Com base em dois dos três critérios utilizados para escolha do modelo, o que melhor se ajustou aos dados foi o MNR em um passo. Por meio deste modelo foi possível verificar a presença de interação genótipos ambientes e estimar o valor genético dos animais para cada região produtora do Nordeste, para a característica peso à desmama. Assim, é possível recomendar os reprodutores mais apropriados para cada ambiente estudado, capitalizando os efeitos da IGA.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superiorapplication/pdfporUniversidade Federal de ViçosaMestrado em Estatística Aplicada e BiometriaUFVBREstatística Aplicada e BiometriaMelhoramento genéticoNelore MochoInferência BayesianaBreedingNelore MochoBayesian InferenceCNPQ::CIENCIAS AGRARIASInteração genótipos ambientes em animais via modelos de normas de reaçãoGenotype environment interaction in animals by models of reaction normsinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:LOCUS Repositório Institucional da UFVinstname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)instacron:UFVORIGINALtexto completo.pdfapplication/pdf3841900https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/4047/1/texto%20completo.pdf0cacdbb43213a6d667c6941e828f2c74MD51TEXTtexto completo.pdf.txttexto completo.pdf.txtExtracted texttext/plain94013https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/4047/2/texto%20completo.pdf.txt07cf04c7ae9360aa8759f5f5e5caeb6dMD52THUMBNAILtexto completo.pdf.jpgtexto completo.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg3725https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/4047/3/texto%20completo.pdf.jpgd3db750af5f7154d5d90e3891f2ab2d4MD53123456789/40472016-04-09 23:17:20.11oai:locus.ufv.br:123456789/4047Repositório InstitucionalPUBhttps://www.locus.ufv.br/oai/requestfabiojreis@ufv.bropendoar:21452016-04-10T02:17:20LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)false |
dc.title.por.fl_str_mv |
Interação genótipos ambientes em animais via modelos de normas de reação |
dc.title.alternative.eng.fl_str_mv |
Genotype environment interaction in animals by models of reaction norms |
title |
Interação genótipos ambientes em animais via modelos de normas de reação |
spellingShingle |
Interação genótipos ambientes em animais via modelos de normas de reação Rodrigues, Daniele Tôrres Melhoramento genético Nelore Mocho Inferência Bayesiana Breeding Nelore Mocho Bayesian Inference CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS |
title_short |
Interação genótipos ambientes em animais via modelos de normas de reação |
title_full |
Interação genótipos ambientes em animais via modelos de normas de reação |
title_fullStr |
Interação genótipos ambientes em animais via modelos de normas de reação |
title_full_unstemmed |
Interação genótipos ambientes em animais via modelos de normas de reação |
title_sort |
Interação genótipos ambientes em animais via modelos de normas de reação |
author |
Rodrigues, Daniele Tôrres |
author_facet |
Rodrigues, Daniele Tôrres |
author_role |
author |
dc.contributor.authorLattes.por.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/4682555268827167 |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Rodrigues, Daniele Tôrres |
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv |
Resende, Marcos Deon Vilela de |
dc.contributor.advisor-co1Lattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4709374E4 |
dc.contributor.advisor-co2.fl_str_mv |
Silva, Fabyano Fonseca e |
dc.contributor.advisor-co2Lattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4766260Z2 |
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Carneiro, Antônio Policarpo Souza |
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4799449E8 |
dc.contributor.referee1.fl_str_mv |
Souza, Gustavo Henrique de |
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4760298P6 |
contributor_str_mv |
Resende, Marcos Deon Vilela de Silva, Fabyano Fonseca e Carneiro, Antônio Policarpo Souza Souza, Gustavo Henrique de |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Melhoramento genético Nelore Mocho Inferência Bayesiana |
topic |
Melhoramento genético Nelore Mocho Inferência Bayesiana Breeding Nelore Mocho Bayesian Inference CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS |
dc.subject.eng.fl_str_mv |
Breeding Nelore Mocho Bayesian Inference |
dc.subject.cnpq.fl_str_mv |
CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS |
description |
A basic issue in animal genetic improvement is if the selection of animals practiced in a given environment results in genetic progress in other environment. The presence of genotype environment interaction (GEI) is characterized by different response of genotypes to environmental variations, which can cause change in the classification of the genotypes in different environments. Among the ways to evaluate the GEI, models of reaction norms (MRN) have been distinguished themselves worldwide today. The GEI is a linear covariance function that lets you assign to each animal, two random regression coefficients (intercept and slope) that predict the genetic value depending on the environment. Thus, each animal has a genetic value for each environment. This study aims to verify the presence of GEI for weaning weight in Nelore Mocho created in different regions of Brazilian northeast, using the model of reaction norms. It was adjusted two models of norms of reaction to the data, MRN in two steps and MRN in one step. The first uses a model without considering the genotype environment interaction to obtain estimates of the environment effects and then uses them as a known covariate in a random regression model. The second, under the Bayesian approach estimates all parameters jointly. The analyzes were conducted using software SAS, R, AMC and Intergen. Based on two of the three criteria used for choosing the model the was the MRN in one step. Through this model it was possible to verify the presence of genotype environment interaction and to estimate the genetic value of animals for weaning weight in each producing region in the Northeast. Thus, it is possible to recommend the most appropriate sires for each environment studied, taking advantage of the GEI effects. |
publishDate |
2012 |
dc.date.available.fl_str_mv |
2012-11-14 2015-03-26T13:32:13Z |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2012-02-17 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2015-03-26T13:32:13Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.citation.fl_str_mv |
RODRIGUES, Daniele Tôrres. Genotype environment interaction in animals by models of reaction norms. 2012. 86 f. Dissertação (Mestrado em Estatística Aplicada e Biometria) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2012. |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://locus.ufv.br/handle/123456789/4047 |
identifier_str_mv |
RODRIGUES, Daniele Tôrres. Genotype environment interaction in animals by models of reaction norms. 2012. 86 f. Dissertação (Mestrado em Estatística Aplicada e Biometria) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2012. |
url |
http://locus.ufv.br/handle/123456789/4047 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de Viçosa |
dc.publisher.program.fl_str_mv |
Mestrado em Estatística Aplicada e Biometria |
dc.publisher.initials.fl_str_mv |
UFV |
dc.publisher.country.fl_str_mv |
BR |
dc.publisher.department.fl_str_mv |
Estatística Aplicada e Biometria |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de Viçosa |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:LOCUS Repositório Institucional da UFV instname:Universidade Federal de Viçosa (UFV) instacron:UFV |
instname_str |
Universidade Federal de Viçosa (UFV) |
instacron_str |
UFV |
institution |
UFV |
reponame_str |
LOCUS Repositório Institucional da UFV |
collection |
LOCUS Repositório Institucional da UFV |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/4047/1/texto%20completo.pdf https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/4047/2/texto%20completo.pdf.txt https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/4047/3/texto%20completo.pdf.jpg |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
0cacdbb43213a6d667c6941e828f2c74 07cf04c7ae9360aa8759f5f5e5caeb6d d3db750af5f7154d5d90e3891f2ab2d4 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV) |
repository.mail.fl_str_mv |
fabiojreis@ufv.br |
_version_ |
1801212939579949056 |