Endosperm genotyping as a strategy to differentiate the allele source in maize heterozygous progeny

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Martins, Francielle Alline
Data de Publicação: 2009
Outros Autores: Carneiro, Pedro Crescêncio Souza, Cruz, Cosme Damião, Carneiro, José Eustáquio de Souza, Guimarães, Claudia Teixeira
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: LOCUS Repositório Institucional da UFV
Texto Completo: http://dx.doi.org/10.1590/S0100-204X2009001000012
https://locus.ufv.br//handle/123456789/26822
Resumo: O objetivo deste trabalho foi distinguir a origem de alelos em progênies heterozigóticas usando reação em cadeia da polimerase (PCR) semiquantitativa em endosperma de milho. Endospermas derivados de híbridos simples diretos e recíprocos entre as linhagens de milho L3 e L1113-01 foram genotipados pela metodologia de PCR semiquantitativa (PCR-SQ) com uso de primers microssatélites fluorescentes. Os produtos de amplificação foram avaliados por meio da razão de intensidade de fluorescência (RIF), calculada entre os valores de intensidade dos picos correspondentes aos alelos derivados de cada genitor. Com base no contraste estatisticamente significativo dos valores médios das RIF entre os híbridos simples direto e recíproco, foi possível distinguir o número de alelos recebidos de cada genitor e, finalmente, determinar a origem dos alelos de cada híbrido. Assim, a genotipagem de endosperma utilizando PCR-SQ é uma estratégia promissora no mapeamento de QTLs em populações exogâmicas de milho.
id UFV_9c1a742f42219a4bd7d7a96878f0af57
oai_identifier_str oai:locus.ufv.br:123456789/26822
network_acronym_str UFV
network_name_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
repository_id_str 2145
spelling Martins, Francielle AllineCarneiro, Pedro Crescêncio SouzaCruz, Cosme DamiãoCarneiro, José Eustáquio de SouzaGuimarães, Claudia Teixeira2019-09-03T14:29:19Z2019-09-03T14:29:19Z2009-1016783921http://dx.doi.org/10.1590/S0100-204X2009001000012https://locus.ufv.br//handle/123456789/26822O objetivo deste trabalho foi distinguir a origem de alelos em progênies heterozigóticas usando reação em cadeia da polimerase (PCR) semiquantitativa em endosperma de milho. Endospermas derivados de híbridos simples diretos e recíprocos entre as linhagens de milho L3 e L1113-01 foram genotipados pela metodologia de PCR semiquantitativa (PCR-SQ) com uso de primers microssatélites fluorescentes. Os produtos de amplificação foram avaliados por meio da razão de intensidade de fluorescência (RIF), calculada entre os valores de intensidade dos picos correspondentes aos alelos derivados de cada genitor. Com base no contraste estatisticamente significativo dos valores médios das RIF entre os híbridos simples direto e recíproco, foi possível distinguir o número de alelos recebidos de cada genitor e, finalmente, determinar a origem dos alelos de cada híbrido. Assim, a genotipagem de endosperma utilizando PCR-SQ é uma estratégia promissora no mapeamento de QTLs em populações exogâmicas de milho.The objective of this work was to distinguish the parental source of alleles in heterozygous progeny using semiquantitative polymerase chain reaction (PCR) in maize endosperm. Endosperms derived from direct and reciprocal single-cross hybrids between maize inbred lines L3 and L1113-01 were genotyped by semiquantitative PCR methodology (SQ-PCR) using fluorescent microsatellite primers. The amplification products were evaluated by the ratios of fluorescence intensity (RFI), calculated between the peaks corresponding to the alleles derived from each parental line. Based on the statistically significant contrast between RFI mean values of direct and reciprocal single-cross hybrids, it was possible to distinguish the number of alleles received from each parental line and, ultimately, to determine the origin of the alleles of each cross. Thus, endosperm genotyping using SQ-PCR is a promising strategy to map QTL in maize outbred populations.engPesquisa Agropecuária Brasileirav. 44, n. 10, p. 1291- 1296, out. 2009Zea maysAllelic originHeterozygoteNatural populationsPolygenesSemiquantitative PCROrigem alélicaHeterozigotoPopulações naturaisPoligenesPCR semiquantitativaEndosperm genotyping as a strategy to differentiate the allele source in maize heterozygous progenyinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleapplication/pdfinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:LOCUS Repositório Institucional da UFVinstname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)instacron:UFVORIGINALartigo.pdfartigo.pdftexto completoapplication/pdf501398https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/26822/1/artigo.pdfab8ad6cc9c183028cc7666ca4d5a16e9MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/26822/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52123456789/268222019-09-03 11:55:01.268oai:locus.ufv.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.locus.ufv.br/oai/requestfabiojreis@ufv.bropendoar:21452019-09-03T14:55:01LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)false
dc.title.en.fl_str_mv Endosperm genotyping as a strategy to differentiate the allele source in maize heterozygous progeny
title Endosperm genotyping as a strategy to differentiate the allele source in maize heterozygous progeny
spellingShingle Endosperm genotyping as a strategy to differentiate the allele source in maize heterozygous progeny
Martins, Francielle Alline
Zea mays
Allelic origin
Heterozygote
Natural populations
Polygenes
Semiquantitative PCR
Origem alélica
Heterozigoto
Populações naturais
Poligenes
PCR semiquantitativa
title_short Endosperm genotyping as a strategy to differentiate the allele source in maize heterozygous progeny
title_full Endosperm genotyping as a strategy to differentiate the allele source in maize heterozygous progeny
title_fullStr Endosperm genotyping as a strategy to differentiate the allele source in maize heterozygous progeny
title_full_unstemmed Endosperm genotyping as a strategy to differentiate the allele source in maize heterozygous progeny
title_sort Endosperm genotyping as a strategy to differentiate the allele source in maize heterozygous progeny
author Martins, Francielle Alline
author_facet Martins, Francielle Alline
Carneiro, Pedro Crescêncio Souza
Cruz, Cosme Damião
Carneiro, José Eustáquio de Souza
Guimarães, Claudia Teixeira
author_role author
author2 Carneiro, Pedro Crescêncio Souza
Cruz, Cosme Damião
Carneiro, José Eustáquio de Souza
Guimarães, Claudia Teixeira
author2_role author
author
author
author
dc.contributor.author.fl_str_mv Martins, Francielle Alline
Carneiro, Pedro Crescêncio Souza
Cruz, Cosme Damião
Carneiro, José Eustáquio de Souza
Guimarães, Claudia Teixeira
dc.subject.pt-BR.fl_str_mv Zea mays
Allelic origin
Heterozygote
Natural populations
Polygenes
Semiquantitative PCR
Origem alélica
Heterozigoto
Populações naturais
Poligenes
PCR semiquantitativa
topic Zea mays
Allelic origin
Heterozygote
Natural populations
Polygenes
Semiquantitative PCR
Origem alélica
Heterozigoto
Populações naturais
Poligenes
PCR semiquantitativa
description O objetivo deste trabalho foi distinguir a origem de alelos em progênies heterozigóticas usando reação em cadeia da polimerase (PCR) semiquantitativa em endosperma de milho. Endospermas derivados de híbridos simples diretos e recíprocos entre as linhagens de milho L3 e L1113-01 foram genotipados pela metodologia de PCR semiquantitativa (PCR-SQ) com uso de primers microssatélites fluorescentes. Os produtos de amplificação foram avaliados por meio da razão de intensidade de fluorescência (RIF), calculada entre os valores de intensidade dos picos correspondentes aos alelos derivados de cada genitor. Com base no contraste estatisticamente significativo dos valores médios das RIF entre os híbridos simples direto e recíproco, foi possível distinguir o número de alelos recebidos de cada genitor e, finalmente, determinar a origem dos alelos de cada híbrido. Assim, a genotipagem de endosperma utilizando PCR-SQ é uma estratégia promissora no mapeamento de QTLs em populações exogâmicas de milho.
publishDate 2009
dc.date.issued.fl_str_mv 2009-10
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2019-09-03T14:29:19Z
dc.date.available.fl_str_mv 2019-09-03T14:29:19Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://dx.doi.org/10.1590/S0100-204X2009001000012
https://locus.ufv.br//handle/123456789/26822
dc.identifier.issn.none.fl_str_mv 16783921
identifier_str_mv 16783921
url http://dx.doi.org/10.1590/S0100-204X2009001000012
https://locus.ufv.br//handle/123456789/26822
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.ispartofseries.pt-BR.fl_str_mv v. 44, n. 10, p. 1291- 1296, out. 2009
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Pesquisa Agropecuária Brasileira
publisher.none.fl_str_mv Pesquisa Agropecuária Brasileira
dc.source.none.fl_str_mv reponame:LOCUS Repositório Institucional da UFV
instname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron:UFV
instname_str Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron_str UFV
institution UFV
reponame_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
collection LOCUS Repositório Institucional da UFV
bitstream.url.fl_str_mv https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/26822/1/artigo.pdf
https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/26822/2/license.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv ab8ad6cc9c183028cc7666ca4d5a16e9
8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)
repository.mail.fl_str_mv fabiojreis@ufv.br
_version_ 1801212927497207808

Registros relacionados