Genótipos e filogenia de cepas de Escherichia coli uropatogênicas : detecção de padrões epidemiológicos

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Lara, Flaviane Beatriz Marcelino
Data de Publicação: 2017
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UnB
Texto Completo: http://repositorio.unb.br/handle/10482/23510
http://dx.doi.org/10.26512/2017.02.D.23510
Resumo: Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Biologia, Pós-Graduação em Biologia Microbiana, 2017.
id UNB_c7826d9710e1593b1c0fcb2fb49d11b7
oai_identifier_str oai:repositorio.unb.br:10482/23510
network_acronym_str UNB
network_name_str Repositório Institucional da UnB
repository_id_str
spelling Genótipos e filogenia de cepas de Escherichia coli uropatogênicas : detecção de padrões epidemiológicosGenotipagemEscherichia coli - genéticaFilogenia - análiseInfecção urináriaDissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Biologia, Pós-Graduação em Biologia Microbiana, 2017.Escherichia coli uropatogênica (UPEC) é marcada pela sua versatilidade genética, sendo capaz de causar infecções em diferentes níveis do trato urinário bem como sepse urinária. Este estudo teve por objetivo estudar cepas de E. coli isoladas de casos de infecção do trato urinário (ITU) e sepse urinária (SU) atendidos no Hospital Regional de Ceilândia do Distrito Federal. A presença de 15 preditores genéticos de 3 patotipos de E. coli (UPEC, EAEC e MNEC) foi testada em 401 cepas. Análises filogenéticas baseadas na determinação de filogrupos e de tipos de sequências (sequence type – ST) foram realizadas. Os preditores moleculares de UPEC foram detectados em mais de 70% das cepas. Preditores moleculares de EAEC (aatA e aggR) foram detectados em apenas 2,4% (9/377) das cepas envolvendo dois casos de cistite e um de sepse urinária (SU). Marcadores de UPEC foram estatisticamente associados a diferentes aspectos epidemiológicos e analíticos da uropatogênese. Os marcadores fyuA (sistema sideróforo), chuA (sistema sideróforo), vat (toxina vacuolizante) e pic (mucinase) foram estatisticamente associados (p < 0,05) aos casos de infecção adquiridos na comunidade. Cepas positivas para csgA (fímbria curli), chuA (sistema sideróforo) ou ag43 (adesina de agregação) mostraram associação estatística com os casos de SU. Cepas positivas para pap (pilus associado a pielonefrite) foram associadas a piúria (p = 0,000) e a presença de muco nas amostras de urina (p = 0,003). Cepas com genótipo fyuA-pap-csgA (p = 0,020) ou pap-csgA-ag43 (p = 0,000) foram associadas a casos de SU e predominantes no filogrupo D. Análises filogenéticas mostraram que duas das três cepas híbridas EAEC/UPEC estudadas foram posicionadas em um clado característico de cepas de UPEC compartilhado por cepas de filogrupo D e ST3 (filogrupo D-ST3). A outra cepa EAEC/UPEC foi classificada como filogrupo A-ST478 e posicionada em um clado distinto juntamente com uma cepa comensal. Nossos resultados endossam a heterogeneidade genética de cepas uropatogênicas mostrando padrões moleculares especificos associados a casos de SU (cepas de filogrupo D e genótipo fyuA-pap-csgA ou pap-csgA-ag43), como também a participação de cepas híbridas EAEC/UPEC de linhagens extraintestinais (filogrupo D-ST3) e intestinais (filogrupo A-ST478) como uropatógenos.Uropathogenic Escherichia coli (UPEC) is marked by its genetic diversity and is responsible for infections in different levels of the urinary tract as well as urinary sepsis. This work aimed to study E. coli strains isolated from cases of urinary tract infections (UTI) and urosepsis that were attended in the Hospital Regional de Ceilândia in the Brazilian Federal District. Four hundred one strains were tested for the presence of 15 genetic predictors of 3 E. coli pathotypes (UPEC, EAEC and MNEC). Phylogenetic analysis based on the determination of phylogroups and sequence type (ST) were carried out. UPEC genetic predictors were detected in more than 70% of the strains. EAEC molecular predictors (aatA and aggR) were detected in only 2.4% (9/377) of the strains that were recovered from two cases of UTI and from one case of US. UPEC markers were statistically associated with distinct epidemiologic and analytic aspects of the uropathogenesis. The markers fyuA (siderophore system), chuA (siderophore system), vat (vacuolating toxin) and pic (mucinase) were statistically associated (p < 0.05) with community-onset infections. Strains positive for csgA (curli fimbria), chuA (siderophore system) or ag43 (aggregation adhesin) were associated with urosepsis cases. pap-positive strains were associated with pyuria (p = 0.000) and the presence of mucous in urine samples (p = 0.003). Strains displaying the genotype fyuA-pap-csgA (p = 0,020) or pap-csgA-ag43 (p = 0.000) were associated with urosepsis cases and were predominant in phylogroup D. Phylogenetic analysis show that two of out three studied hybrid EAEC/UPEC strains were positioned on a characteristic clade of UPEC strains that was shared by strains with phylogroup D and ST3 (phylogroup D-ST3). Another EAEC/UPEC strain was classified as phylogroup A-ST478 and was positioned on a different clade along with a commensal strain. Our findings endorse the genetic heterogeneity displayed by uropathogenic strains showing specific molecular pattern associated with urosepsis cases (strains displaying phylogroup D and genotype fyuA-pap-csgA or pap-csgA-ag43) as well as the participation of hybrid EAEC/UPEC strains from both extraintestinal (phygroup D-ST3) and intestinal lineages as uropathogens.Instituto de Ciências Biológicas (IB)Departamento de Biologia Celular (IB CEL)Programa de Pós-Graduação em Biologia MicrobianaPereira, Alex LeiteLara, Flaviane Beatriz Marcelino2017-05-16T19:46:51Z2017-05-16T19:46:51Z2017-05-162017-02-10info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfLARA, Flaviane Beatriz Marcelino. Genótipos e filogenia de cepas de Escherichia coli uropatogênicas: detecção de padrões epidemiológicos. 2017. x, 81, il. Dissertação (Mestrado em Biologia Microbiana)—Universidade de Brasília, Brasília, 2017.http://repositorio.unb.br/handle/10482/23510http://dx.doi.org/10.26512/2017.02.D.23510A concessão da licença deste item refere-se ao termo de autorização impresso assinado pelo autor com as seguintes condições: Na qualidade de titular dos direitos de autor da publicação, autorizo a Universidade de Brasília e o IBICT a disponibilizar por meio dos sites www.bce.unb.br, www.ibict.br, http://hercules.vtls.com/cgi-bin/ndltd/chameleon?lng=pt&skin=ndltd sem ressarcimento dos direitos autorais, de acordo com a Lei nº 9610/98, o texto integral da obra disponibilizada, conforme permissões assinaladas, para fins de leitura, impressão e/ou download, a título de divulgação da produção científica brasileira, a partir desta data.info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UnBinstname:Universidade de Brasília (UnB)instacron:UNB2024-02-08T18:15:12Zoai:repositorio.unb.br:10482/23510Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.unb.br/oai/requestrepositorio@unb.bropendoar:2024-02-08T18:15:12Repositório Institucional da UnB - Universidade de Brasília (UnB)false
dc.title.none.fl_str_mv Genótipos e filogenia de cepas de Escherichia coli uropatogênicas : detecção de padrões epidemiológicos
title Genótipos e filogenia de cepas de Escherichia coli uropatogênicas : detecção de padrões epidemiológicos
spellingShingle Genótipos e filogenia de cepas de Escherichia coli uropatogênicas : detecção de padrões epidemiológicos
Lara, Flaviane Beatriz Marcelino
Genotipagem
Escherichia coli - genética
Filogenia - análise
Infecção urinária
title_short Genótipos e filogenia de cepas de Escherichia coli uropatogênicas : detecção de padrões epidemiológicos
title_full Genótipos e filogenia de cepas de Escherichia coli uropatogênicas : detecção de padrões epidemiológicos
title_fullStr Genótipos e filogenia de cepas de Escherichia coli uropatogênicas : detecção de padrões epidemiológicos
title_full_unstemmed Genótipos e filogenia de cepas de Escherichia coli uropatogênicas : detecção de padrões epidemiológicos
title_sort Genótipos e filogenia de cepas de Escherichia coli uropatogênicas : detecção de padrões epidemiológicos
author Lara, Flaviane Beatriz Marcelino
author_facet Lara, Flaviane Beatriz Marcelino
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Pereira, Alex Leite
dc.contributor.author.fl_str_mv Lara, Flaviane Beatriz Marcelino
dc.subject.por.fl_str_mv Genotipagem
Escherichia coli - genética
Filogenia - análise
Infecção urinária
topic Genotipagem
Escherichia coli - genética
Filogenia - análise
Infecção urinária
description Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Biologia, Pós-Graduação em Biologia Microbiana, 2017.
publishDate 2017
dc.date.none.fl_str_mv 2017-05-16T19:46:51Z
2017-05-16T19:46:51Z
2017-05-16
2017-02-10
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv LARA, Flaviane Beatriz Marcelino. Genótipos e filogenia de cepas de Escherichia coli uropatogênicas: detecção de padrões epidemiológicos. 2017. x, 81, il. Dissertação (Mestrado em Biologia Microbiana)—Universidade de Brasília, Brasília, 2017.
http://repositorio.unb.br/handle/10482/23510
http://dx.doi.org/10.26512/2017.02.D.23510
identifier_str_mv LARA, Flaviane Beatriz Marcelino. Genótipos e filogenia de cepas de Escherichia coli uropatogênicas: detecção de padrões epidemiológicos. 2017. x, 81, il. Dissertação (Mestrado em Biologia Microbiana)—Universidade de Brasília, Brasília, 2017.
url http://repositorio.unb.br/handle/10482/23510
http://dx.doi.org/10.26512/2017.02.D.23510
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UnB
instname:Universidade de Brasília (UnB)
instacron:UNB
instname_str Universidade de Brasília (UnB)
instacron_str UNB
institution UNB
reponame_str Repositório Institucional da UnB
collection Repositório Institucional da UnB
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UnB - Universidade de Brasília (UnB)
repository.mail.fl_str_mv repositorio@unb.br
_version_ 1810580777803448320

Registros relacionados