Analise da expressão genica em diferentes especies de eucalipto utilizando a tecnologia de microarranjos de cDNA

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Lepikson-Neto, Jorge, 1980-
Data de Publicação: 2008
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
Texto Completo: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1608264
Resumo: Orientador: Gonçalo Amarante Guimães Pereira
id UNICAMP-30_24cfc6791909a6e00ab2884d2cab6f48
oai_identifier_str oai::434646
network_acronym_str UNICAMP-30
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
repository_id_str
spelling Analise da expressão genica em diferentes especies de eucalipto utilizando a tecnologia de microarranjos de cDNAMicroarray cDNA gene expression analyses of different eucalyptus speciesExpressão gênicaEucaliptoMicroarranjos de DNAGene expressionEucalyptusMicroarrays, DNAOrientador: Gonçalo Amarante Guimães PereiraDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de BiologiaResumo: Com o intuito de obter informações relevantes para o melhoramento genético do eucalipto para a produção de biomassa, o presente trabalho buscou comparar a expressão dos genes relacionados com a formação e desenvolvimento da madeira em quatro diferentes espécies de eucalipto, tendo como objetivo identificar os padrões que as tornam mais aptas, bem como quais genes relacionados com determinadas características. Essa análise abre a possibilidade da identificação de genes chave que possam ser manipulados, através do melhoramento clássico ou da transgênia, para aumentar o conteúdo relativo de celulose das plantas, incrementando a sua eficiência para processos econômicos. 384 ESTs do banco de dados do Consórcio Genolyptus foram selecionadas para serem analisadas através da tecnologia de microarranjos de cDNA. Foram selecionadas ESTs de genes com funções conhecidas relacionadas com a formação da madeira, bem como de genes relacionados com o desenvolvimento do vegetal e de genes com função ainda desconhecida. Os dados obtidos foram cruzados com a biblioteca de ESTs do Consorcio Genolyptus (Northern Eletrônico), e foram feitos PCR em tempo real para os principais genes diferenciais nos microarranjos e para os genes da via de lignina e flavonóides. Os resultados mostraram que diferentes genes estão expressos nas espécies estudadas sendo um grande número deles ainda com função desconhecida no metabolismo do eucalipto. A maioria dos genes relacionados com a formação da parede celular não apresentou perfil de expressão diferencial nos microarranjos, sugerindo que as diferenças fenotípicas entre as madeiras das espécies estudadas podem estar sustentadas em vias alternativas, com fatores de elongação, cliclínas e outros genes desempenhando papel importante, bem como genes ainda não relacionados com o desenvolvimento da parede celular e ou ao desenvolvimento do vegetal. Os experimentos com PCR em tempo real mostraram que genes da via de flavonóides relacionados com a via de lignina e formação da madeira podem estar desempenhando papeis importantes no controle da formação da madeira da espécie. Esses resultados representam avanços significativos no entedimento da formação da madeira em eucalipto e servem como base para orientar futuras investigações no intuito de melhorar geneticamente esta espécie.Abstract: In this work we intended to assemble relevant information for the genetic engineering of Eucalyptus for biomass production by comparing gene expression of genes related with the xylem and wood development of four different Eucalyptus species with distinct caractheristics, as a form to identify patterns and wich genes are possibly related to their differences. This analysis opens the possibilities to manipulate the specie and increase the overall celluloses content and its purpose for industrial production. 384 ESTs were selected from de Genolyptus database and analysed by microarryay cDNA experiments. Among the ESTs selected some were related to wood formation, cell wall assembly and some still had no general function known on the specie. The data from the microarray experiments were then crossed with the Genolyptus ESTs lybrary (Eletronic Northern) and Real-Time PCR were performed for the most relevant resultas as well as the genes from de lignin and flavonoid pathway. Results show that different genes are expressed among the xylem of the four species studied and most of them still have no related function to the metabolism of the plant. Most of the genes related to cell wall formation were not differentially expressed on the microarrays suggesting that the differences on the quality and structure of the wood among the four species might as well be resulted from the expression of alternative pathways and genes such as elongation factors, ciclins and others not yet related to the cell wall formation and wood development. Real-Time PCR experiments shown that genes from the flavonoid pathway related to lignin and wood formation might be playing a crucial role determining wicht pathway must be followed and therefore the type and quality of the wood on Eucalyptus. These results represent significant advances to our understanding on the formation of wood on Eucalyptus and will be valuable as a basis for future investigation aiming genetic engeneering of the specie.MestradoBioquímicaMestre em Biologia Funcional e Molecular[s.n.]Pereira, Gonçalo Amarante Guimarães, 1964-Colombo, Carlos AugustoNovello, Jose CamilloUniversidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de BiologiaPrograma de Pós-Graduação em Biologia Funcional e MolecularUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINASLepikson-Neto, Jorge, 1980-2008info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdf87 f. : il.https://hdl.handle.net/20.500.12733/1608264LEPIKSON-NETO, Jorge. Analise da expressão genica em diferentes especies de eucalipto utilizando a tecnologia de microarranjos de cDNA. 2008. 87 f. Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1608264. Acesso em: 2 set. 2024.https://repositorio.unicamp.br/acervo/detalhe/434646porreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instname:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instacron:UNICAMPinfo:eu-repo/semantics/openAccess2017-06-02T13:50:38Zoai::434646Biblioteca Digital de Teses e DissertaçõesPUBhttp://repositorio.unicamp.br/oai/tese/oai.aspsbubd@unicamp.bropendoar:2017-06-02T13:50:38Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)false
dc.title.none.fl_str_mv Analise da expressão genica em diferentes especies de eucalipto utilizando a tecnologia de microarranjos de cDNA
Microarray cDNA gene expression analyses of different eucalyptus species
title Analise da expressão genica em diferentes especies de eucalipto utilizando a tecnologia de microarranjos de cDNA
spellingShingle Analise da expressão genica em diferentes especies de eucalipto utilizando a tecnologia de microarranjos de cDNA
Lepikson-Neto, Jorge, 1980-
Expressão gênica
Eucalipto
Microarranjos de DNA
Gene expression
Eucalyptus
Microarrays, DNA
title_short Analise da expressão genica em diferentes especies de eucalipto utilizando a tecnologia de microarranjos de cDNA
title_full Analise da expressão genica em diferentes especies de eucalipto utilizando a tecnologia de microarranjos de cDNA
title_fullStr Analise da expressão genica em diferentes especies de eucalipto utilizando a tecnologia de microarranjos de cDNA
title_full_unstemmed Analise da expressão genica em diferentes especies de eucalipto utilizando a tecnologia de microarranjos de cDNA
title_sort Analise da expressão genica em diferentes especies de eucalipto utilizando a tecnologia de microarranjos de cDNA
author Lepikson-Neto, Jorge, 1980-
author_facet Lepikson-Neto, Jorge, 1980-
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Pereira, Gonçalo Amarante Guimarães, 1964-
Colombo, Carlos Augusto
Novello, Jose Camillo
Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Biologia
Programa de Pós-Graduação em Biologia Funcional e Molecular
UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS
dc.contributor.author.fl_str_mv Lepikson-Neto, Jorge, 1980-
dc.subject.por.fl_str_mv Expressão gênica
Eucalipto
Microarranjos de DNA
Gene expression
Eucalyptus
Microarrays, DNA
topic Expressão gênica
Eucalipto
Microarranjos de DNA
Gene expression
Eucalyptus
Microarrays, DNA
description Orientador: Gonçalo Amarante Guimães Pereira
publishDate 2008
dc.date.none.fl_str_mv 2008
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://hdl.handle.net/20.500.12733/1608264
LEPIKSON-NETO, Jorge. Analise da expressão genica em diferentes especies de eucalipto utilizando a tecnologia de microarranjos de cDNA. 2008. 87 f. Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1608264. Acesso em: 2 set. 2024.
url https://hdl.handle.net/20.500.12733/1608264
identifier_str_mv LEPIKSON-NETO, Jorge. Analise da expressão genica em diferentes especies de eucalipto utilizando a tecnologia de microarranjos de cDNA. 2008. 87 f. Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1608264. Acesso em: 2 set. 2024.
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv https://repositorio.unicamp.br/acervo/detalhe/434646
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
87 f. : il.
dc.publisher.none.fl_str_mv [s.n.]
publisher.none.fl_str_mv [s.n.]
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
instname:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
instacron:UNICAMP
instname_str Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
instacron_str UNICAMP
institution UNICAMP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
repository.mail.fl_str_mv sbubd@unicamp.br
_version_ 1809188996830461952