Sequenciamento de nova geração como ferramenta de detecção de variantes genéticas de origens somáticas e germinativas

• Autor(a) principal: Nacarato, Nicole Malachias
• Data de Publicação: 2023
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/11449/244333
• topic: Sequenciamento de nova geração; Oncologia; Sequenciamento de nucleotídeo; Variação genética

As metodologias de sequenciamento de DNA têm sofrido grandes transformações nas últimas duas décadas com o advento do Sequenciamento de Nova Geração (NGS). Esse método tem revolucionado a pesquisa básica e as aplicações clínicas na área da genética e genômica. A técnica é robusta, permitindo a obtenção da sequência de múltiplos fragmentos de DNA simultaneamente, tornando a sua execução mais rápida e acessível. O NGS consiste em um conjunto de diferentes tecnologias baseadas na incorporação de nucleotídeos à fita em síntese, permitindo a determinação da sequência de interesse. Existe uma variedade de análises que pode ser feita a partir do NGS: sequenciamento de genoma completo (WGS – whole genome sequencing), exoma completo (WES – whole exome sequencing), painéis multigênicos e sequenciamento alvo específico (targeted sequencing), que inclui o sequenciamento de amplicons, ou seja, pequenas regiões genômicas amplificadas por PCR (targeted amplicon sequencing). O NGS de amplicons com alta cobertura permite uma análise mais direcionada e sua implementação tem se expandido cada vez mais, sendo uma das aplicações mais importantes a estimativa da ploidia baseada nas variantes genéticas, tanto germinativas como somáticas, além de permitir a detecção de variantes em baixa frequência. Assim, apresenta grande aplicabilidade no campo da oncologia, tanto em pesquisa científica como na prática clínica da oncologia personalizada. O NGS de amplicon de alta cobertura é bastante utilizado para avaliação de variantes patogênicas conhecidas em pacientes suspeitos de síndromes de predisposição hereditária ao câncer e avaliação de variantes acionáveis que respaldam a prescrição de terapias dirigidas.