Investigação citogenômica em pacientes com atraso de desenvolvimento global e mosaicismo pigmentar

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Oliveira, Yanca Gasparini de
Data de Publicação: 2023
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5141/tde-27062023-123633/
Resumo: O mosaicismo é um evento frequente na população em geral, cuja frequência em casos que levam a efeitos fenotípicos é estimada em aproximadamente 1 para 10.000 nascidos vivos. Contudo, é pouco identificado devido à dificuldade de caracterização citogenética e molecular que pode ocorrer em diferentes populações celulares. A detecção de alterações genômicas em diferentes tecidos utilizando as técnicas citogenômicas pode revelar elementos importantes para o entendimento da relação entre a arquitetura genômica e seu efeito fenotípico para assim auxiliar na conclusão diagnóstica dos pacientes com atraso de desenvolvimento global e mosaicismo pigmentar. Estudamos 21 conjuntos de amostras de pacientes com ADG/MP (14 do sexo feminino e 7 do sexo masculino) por bandamento G e e array genômico, totalizando 84 amostras. Nosso estudo revelou 39 alterações classificadas como patogênicas ou provavelmente patogênicas permitindo o diagnóstico de 13/21 pacientes deste estudo. Observamos que a pele (fibroblastos) foi o tecido com um maior número de alterações patogênicas, fato este, relacionado com o mosaicismo pigmentar e, ressaltamos que o array genômico foi essencial para a caracterização molecular inequívoca de cada população celular, dada a facilidade de obtenção de DNA de qualquer tipo de amostra. Ainda foi possível observar que o array genômico possibilitou o diagnóstico dos pacientes e a detecção de mosaicismo em diferentes níveis. Concluindo, nosso estudo mostrou que a associação genótipo-fenótipo, considerando distintos tecidos, é imprescindível para a rotina diagnóstica de pacientes com ADG/MP. Bem como melhora o entendimento do papel da dosagem gênica, inter e intratecidual, e sua relação com as manifestações clínicas
id USP_851917dc9b6f9899879a4dd25e700e5b
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-27062023-123633
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str 2721
spelling Investigação citogenômica em pacientes com atraso de desenvolvimento global e mosaicismo pigmentarCitogenomic investigation in patients with developmental delay and pigmentary mosaicismAnálise de sequência com séries de oligonucleotídeosDNA copy number variationsDoenças rarasGenetic testsGenomic rearrangementsMosaicismMosaicismoOligonucleotide array sequence analysisRare diseasesRearranjos genômicosTestes genéticosVariação do número de cópias de DNAO mosaicismo é um evento frequente na população em geral, cuja frequência em casos que levam a efeitos fenotípicos é estimada em aproximadamente 1 para 10.000 nascidos vivos. Contudo, é pouco identificado devido à dificuldade de caracterização citogenética e molecular que pode ocorrer em diferentes populações celulares. A detecção de alterações genômicas em diferentes tecidos utilizando as técnicas citogenômicas pode revelar elementos importantes para o entendimento da relação entre a arquitetura genômica e seu efeito fenotípico para assim auxiliar na conclusão diagnóstica dos pacientes com atraso de desenvolvimento global e mosaicismo pigmentar. Estudamos 21 conjuntos de amostras de pacientes com ADG/MP (14 do sexo feminino e 7 do sexo masculino) por bandamento G e e array genômico, totalizando 84 amostras. Nosso estudo revelou 39 alterações classificadas como patogênicas ou provavelmente patogênicas permitindo o diagnóstico de 13/21 pacientes deste estudo. Observamos que a pele (fibroblastos) foi o tecido com um maior número de alterações patogênicas, fato este, relacionado com o mosaicismo pigmentar e, ressaltamos que o array genômico foi essencial para a caracterização molecular inequívoca de cada população celular, dada a facilidade de obtenção de DNA de qualquer tipo de amostra. Ainda foi possível observar que o array genômico possibilitou o diagnóstico dos pacientes e a detecção de mosaicismo em diferentes níveis. Concluindo, nosso estudo mostrou que a associação genótipo-fenótipo, considerando distintos tecidos, é imprescindível para a rotina diagnóstica de pacientes com ADG/MP. Bem como melhora o entendimento do papel da dosagem gênica, inter e intratecidual, e sua relação com as manifestações clínicasMosaicism is a frequent event in the general population, whose frequency in cases that lead to phenotypic effects is estimated at approximately 1 in 10.000 live births. However, it is poorly identified due to the difficulty of cytogenetic and molecular characterization that can occur in different cell populations. The detection of genomic alterations in different tissues using cytogenomic techniques can reveal important elements for understanding the relationship between genomic architecture and its phenotypic effect, thus helping in the diagnostic conclusion of patients with global developmental delay and pigmentary mosaicism. We studied 21 sets of samples from patients with GDD/PM (14 females and 7 males) by G-banding and genomic array, totaling 84 samples. Our study revealed 39 alterations classified as pathogenic or probably pathogenic, allowing the diagnosis of 13/21 patients in this study. We observed that the skin (fibroblasts) was the tissue with the highest number of pathogenic alterations, a fact related to pigmentary mosaicism, and we emphasize that the genomic array was essential for the unequivocal molecular characterization of each cell population, given the ease of obtaining of DNA from any type of sample. It was also possible to observe that the genomic array enabled the diagnosis of patients and the detection of mosaicism at different levels. In conclusion, our study showed that the genotype-phenotype association, considering different tissues, is essential for the diagnostic routine of patients with GDD/PM. As well as improving the understanding of the role of gene dosage, inter and intra-tissue, and its relationship with clinical manifestationsBiblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPKulikowski, Leslie DomeniciOliveira, Yanca Gasparini de2023-03-17info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5141/tde-27062023-123633/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2023-07-04T18:11:21Zoai:teses.usp.br:tde-27062023-123633Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212023-07-04T18:11:21Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Investigação citogenômica em pacientes com atraso de desenvolvimento global e mosaicismo pigmentar
Citogenomic investigation in patients with developmental delay and pigmentary mosaicism
title Investigação citogenômica em pacientes com atraso de desenvolvimento global e mosaicismo pigmentar
spellingShingle Investigação citogenômica em pacientes com atraso de desenvolvimento global e mosaicismo pigmentar
Oliveira, Yanca Gasparini de
Análise de sequência com séries de oligonucleotídeos
DNA copy number variations
Doenças raras
Genetic tests
Genomic rearrangements
Mosaicism
Mosaicismo
Oligonucleotide array sequence analysis
Rare diseases
Rearranjos genômicos
Testes genéticos
Variação do número de cópias de DNA
title_short Investigação citogenômica em pacientes com atraso de desenvolvimento global e mosaicismo pigmentar
title_full Investigação citogenômica em pacientes com atraso de desenvolvimento global e mosaicismo pigmentar
title_fullStr Investigação citogenômica em pacientes com atraso de desenvolvimento global e mosaicismo pigmentar
title_full_unstemmed Investigação citogenômica em pacientes com atraso de desenvolvimento global e mosaicismo pigmentar
title_sort Investigação citogenômica em pacientes com atraso de desenvolvimento global e mosaicismo pigmentar
author Oliveira, Yanca Gasparini de
author_facet Oliveira, Yanca Gasparini de
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Kulikowski, Leslie Domenici
dc.contributor.author.fl_str_mv Oliveira, Yanca Gasparini de
dc.subject.por.fl_str_mv Análise de sequência com séries de oligonucleotídeos
DNA copy number variations
Doenças raras
Genetic tests
Genomic rearrangements
Mosaicism
Mosaicismo
Oligonucleotide array sequence analysis
Rare diseases
Rearranjos genômicos
Testes genéticos
Variação do número de cópias de DNA
topic Análise de sequência com séries de oligonucleotídeos
DNA copy number variations
Doenças raras
Genetic tests
Genomic rearrangements
Mosaicism
Mosaicismo
Oligonucleotide array sequence analysis
Rare diseases
Rearranjos genômicos
Testes genéticos
Variação do número de cópias de DNA
description O mosaicismo é um evento frequente na população em geral, cuja frequência em casos que levam a efeitos fenotípicos é estimada em aproximadamente 1 para 10.000 nascidos vivos. Contudo, é pouco identificado devido à dificuldade de caracterização citogenética e molecular que pode ocorrer em diferentes populações celulares. A detecção de alterações genômicas em diferentes tecidos utilizando as técnicas citogenômicas pode revelar elementos importantes para o entendimento da relação entre a arquitetura genômica e seu efeito fenotípico para assim auxiliar na conclusão diagnóstica dos pacientes com atraso de desenvolvimento global e mosaicismo pigmentar. Estudamos 21 conjuntos de amostras de pacientes com ADG/MP (14 do sexo feminino e 7 do sexo masculino) por bandamento G e e array genômico, totalizando 84 amostras. Nosso estudo revelou 39 alterações classificadas como patogênicas ou provavelmente patogênicas permitindo o diagnóstico de 13/21 pacientes deste estudo. Observamos que a pele (fibroblastos) foi o tecido com um maior número de alterações patogênicas, fato este, relacionado com o mosaicismo pigmentar e, ressaltamos que o array genômico foi essencial para a caracterização molecular inequívoca de cada população celular, dada a facilidade de obtenção de DNA de qualquer tipo de amostra. Ainda foi possível observar que o array genômico possibilitou o diagnóstico dos pacientes e a detecção de mosaicismo em diferentes níveis. Concluindo, nosso estudo mostrou que a associação genótipo-fenótipo, considerando distintos tecidos, é imprescindível para a rotina diagnóstica de pacientes com ADG/MP. Bem como melhora o entendimento do papel da dosagem gênica, inter e intratecidual, e sua relação com as manifestações clínicas
publishDate 2023
dc.date.none.fl_str_mv 2023-03-17
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5141/tde-27062023-123633/
url https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5141/tde-27062023-123633/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1809091125463482368

Registros relacionados