Uma abordagem para a construção de uma única árvore a partir de uma Random Forest para classificação de bases de expressão gênica

• Autor(a) principal: Oshiro, Thais Mayumi
• Data de Publicação: 2013
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
• Texto Completo: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-15102013-183234/
• topic: Aprendizado de Máquina; Classicador Simbólico.; Expressão Gênica; Gene Expression; Machine Learning; Random Forest; Random Forest; Symbolic Classier.

Random Forest é uma técnica computacionalmente eciente que pode operar rapida-mente sobre grandes bases de dados. Ela tem sido usada em muitos projetos de pesquisa recentes e aplicações do mundo real em diversos domínios, entre eles a bioinformática uma vez que a Random Forest consegue lidar com bases que apresentam muitos atributos e poucos exemplos. Porém, ela é de difícil compreensão para especialistas humanos de diversas áreas. A pesquisa de mestrado aqui relatada tem como objetivo criar um modelo simbólico, ou seja, uma única árvore a partir da Random Forest para a classicação de bases de dados de expressão gênica. Almeja-se assim, aumentar a compreensão por parte dos especialistas humanos sobre o processo que classica os exemplos no mundo real tentando manter um bom desempenho. Os resultados iniciais obtidos com o algoritmo aqui proposto são pro-missores, uma vez que ela apresenta, em alguns casos, desempenho melhor do que outro algoritmo amplamente utilizado (J48) e um pouco inferior à Random Forest. Além disso, a árvore criada apresenta, no geral, tamanho menor do que a árvore criada pelo algoritmo J48.