Estimação da fração de recombinação e da fase de ligação em espécies de polinização aberta: uma abordagem bayesiana

• Autor(a) principal: Pereira, Júlio César
• Data de Publicação: 2005
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
• Texto Completo: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11134/tde-20191218-182133/
• topic: ANÁLISE GENÉTICA; CRUZAMENTO VEGETAL; ESTATÍSTICA BAYESIANA; MÁXIMA VEROSSIMILHANÇA; POLINIZAÇÃO; PROGÊNIES

A análise de ligação em populações de espécies de polinização aberta, em que não é possível a obtenção de linhagens, é mais complicada do que em populações de cruzamentos controlados em que isso é possível. Este trabalho trata da análise de ligação em progênies resultantes de diferentes cruzamentos entre duas plantas de espécie de polinização aberta, considerando-se dois locos. Dois métodos de estimação para a freqüência de recombinação foram comparados: o método da máxima verossimilhança e um método Bayesiano com o uso de uma priori uniforme. As estimativas da freqüência de recombinação obtidas pelo método Bayesiano, em geral apresentam menor soma de quadrados de resíduos que as estimativas de máxima verossimilhança e os comportamentos das estimativas obtidas pelos dois métodos, tornam-se próximos a medida em que o tamanho da progênie aumenta. Além disso, o fato de se estimar a freqüência de recombinação por um método ou outro não interfere na estimação da fase de ligação (que também é estimada por um método Bayesiano). Assim, o método puramente Bayesiano pode também ser recomendado para a análise de ligação. Uma vez que a abordagem Bayesiana também permite a incorporação de informações a priori fornecidas pelo pesquisador ou com base em artigos já publicados, nota-se que o enfoque Bayesiano pode ser uma alternativa útil em vários casos.