Genomic and phylogenetic characterisation of an imported case of SARS-CoV-2 in Amazonas State, Brazil

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Autor(a) principal: Nascimento, Valdinete Alves do
Data de Publicação: 2020
Outros Autores: Corado, André de Lima Guerra, Nascimento, Fernanda Oliveira do, Costa, Ágatha Kelly Araújo da, Duarte, Debora Camila Gomes, Luz, Sérgio Luiz Bessa, Gonçalves, Luciana Mara Fé, Jesus, Michele Silva de, Costa, Cristiano Fernandes da, Delatorre, Edson, Naveca, Felipe Gomes N.
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/43651
Resumo: A Rede Genômica Fiocruz é formada por especialistas de todas as unidades da Fundação no país e de institutos parceiros que se empenham diariamente em gerar dados mais robustos sobre o comportamento do SARS-Cov-2 e contribuir para um melhor preparo do país no enfrentamento da pandemia em termos de diagnóstico mais precisos e vacinas eficazes. Saiba mais sobre a Rede Genômica Fiocruz em: http://www.genomahcov.fiocruz.br/
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Saiba mais sobre a Rede Genômica Fiocruz em: http://www.genomahcov.fiocruz.br/Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Manaus, AM, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Manaus, AM, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Manaus, AM, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Programa de Pós-Graduação em Biologia da Interação Patógeno-Hospedeiro. Manaus, AM, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Manaus, AM, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Programa de Pós-Graduação em Biologia da Interação Patógeno-Hospedeiro. Manaus, AM, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. 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Manaus, AM, Brasil / Rede Genômica de Vigilância em Saúde do Estado do Amazonas. Manaus, AM, Brasil.A new coronavirus [severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)] is currently causing a life-threatening pandemic. In this study, we report the complete genome sequencing and genetic characterisation of a SARS-CoV-2 detected in Manaus, Amazonas, Brazil, and the protocol we designed to generate high-quality SARS-CoV-2 full genome data. The isolate was obtained from an asymptomatic carrier returning from Madrid, Spain. Nucleotide sequence analysis showed a total of nine mutations in comparison with the original human case in Wuhan, China, and support this case as belonging to the recently proposed lineage A.2. Phylogeographic analysis further confirmed the likely European origin of this case. To our knowledge, this is the first SARS-CoV-2 genome obtained from the North Brazilian Region. We believe that the information generated in this study may contribute to the ongoing efforts toward the SARS-CoV-2 emergence.engFundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz.CoronavírusSARS-CoV-2COVID-19BrasilRegião AmazônicaGenomaRede Genômica FiocruzGENOMAHCOVCoronavirusSARS-CoV-2COVID-19BrazilAmazon RegionGenomeGenomic and phylogenetic characterisation of an imported case of SARS-CoV-2 in Amazonas State, Brazilinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; 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