Epidemiologia e caracterização molecular de parasitos intestinais em diferentes regiões brasileiras, com ênfase em Giardia duodenalis e Entamoeba spp.
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Summary: | Objetivos. Descrever cenários locais de infecções humanas por parasitos intestinais em diferentes regiões brasileiras, com ênfase na identificação de determinantes socioambientais e da diversidade genética de Entamoeba histolytica/Entamoeba dispar, Entamoeba coli e Giardia duodenalis. Explorar a diversidade genética de Giardia duodenalis em infecções de caprinos, ovinos e suínos vivendo em ambiente peridoméstico no estado do Piauí Metodologia. Foram realizados estudos transversais para coleta de amostras fecais e dados sociodemográficos e antropométricos em: i) Santa Isabel do Rio Negro, Amazonas (n= 392), ii) Bagre, Pará (n=362), iii) Teresina, Piauí (n=298) e iv) São João do Piauí, Piauí (n=131), e Cachoeiras de Macacu, Rio de Janeiro (n=545). Amostras fecais de suínos (n=49), caprinos (n=12) e ovinos (n=10) foram coletadas em Nossa Senhora de Nazaré, Piauí. As amostras foram submetidas às técnicas parasitológicas microscópicas. As amostras positivas para Entamoeba spp. foram submetidas à análises moleculares por meio de Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) e sequenciamento de fragmento do DNA do gene SSU (small subunit) ribosomal DNA. Amostras positivas para G. duodenalis foram submetidas à PCR e sequenciamento de fragmento do DNA do gene da \03B2-giardina. As amostras de animais foram submetidas diretamente à PCR e sequenciamento de fragmento do DNA do gene da \03B2-giardina. Resultados. i) Em Cachoeiras de Macacu-RJ, foi observada uma taxa mais baixa de infeção por geo-helmintos, que atingiu 1,7%. Destacaram-se infecções por G. duodenalis e E. histolytica/E. dispar, com positividade de 8,6% e 13,4%, respectivamente, sendo estas infecções significativamente mais frequentes nos grupos com menor renda; ii) em áreas rurais de Teresina-PI, a proporção de infectados com A. lumbricoides e ancilostomídeos foi de 5,7% e 8,6%, respectivamente, analisando-se em conjunto as crianças de Cachoeiras de Macacu-RJ e Teresina-PI, um modelo de regressão linear múltipla demonstrou que os parâmetros antropométricos altura-para-idade e pesopara-idade foram positivamente influenciados pela renda familiar e negativamente influenciados por sexo feminino e por infecções por A. lumbricoides e E. coli; iii) Analisandose sequencias nucleotídicas do gene SSU (small subunit) ribosomal DNA de espécies de Entamoeba que produzem cistos octanucleados de todas as regiões estudadas, verificou-se que E. coli ST1 predomina nas localidades da Caatinga e Mata Atlântica, e que ST2 predomina na região amazônica. Os amebídeos tetranucleados foram caracterizados por: E. histolytica, E. dispar, e E. hartmanni, sendo E. histolytica detectada apenas na Amazônia; iv) com relação à giardíase, considerando-se todas as regiões estudadas em conjunto, a frequência de infecção foi superior em Bagre-PA (17,3%), estando associada à pobreza, à pobreza extrema e a cenários sanitários mais desfavoráveis. A genotipagem do gene da \03B2giardina revelou que na Amazônia houve predomínio de genótipo B, enquanto o genótipo A foi o mais frequente em Cachoeiras de Macacu-RJ e no Piauí; v) a genotipagem de G. duodenalis obtida de pequenos ruminantes e suínos revelou predomínio de genótipo A, filogeneticamente relacionadas a isolados humanos. Conclusões.O perfil etiológico do parasitismo intestinal variou nas regiões brasileiras analisadas, demonstrando que as mesmas ainda persistem como um problema de saúde coletiva, com claros determinantes socioambientais. |
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Calegar, Deiviane AparecidaCosta, Filipe Aníbal Carvalho2021-10-19T17:01:58Z2021-10-19T17:01:58Z2021CALEGAR, Deiviane Aparecida. Epidemiologia e caracterização molecular de parasitos intestinais em diferentes regiões brasileiras, com ênfase em Giardia duodenalis e Entamoeba spp. 2021. 185 f. Tese (Doutorado em Medicina Tropical) - Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2021.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/49469Objetivos. Descrever cenários locais de infecções humanas por parasitos intestinais em diferentes regiões brasileiras, com ênfase na identificação de determinantes socioambientais e da diversidade genética de Entamoeba histolytica/Entamoeba dispar, Entamoeba coli e Giardia duodenalis. Explorar a diversidade genética de Giardia duodenalis em infecções de caprinos, ovinos e suínos vivendo em ambiente peridoméstico no estado do Piauí Metodologia. Foram realizados estudos transversais para coleta de amostras fecais e dados sociodemográficos e antropométricos em: i) Santa Isabel do Rio Negro, Amazonas (n= 392), ii) Bagre, Pará (n=362), iii) Teresina, Piauí (n=298) e iv) São João do Piauí, Piauí (n=131), e Cachoeiras de Macacu, Rio de Janeiro (n=545). Amostras fecais de suínos (n=49), caprinos (n=12) e ovinos (n=10) foram coletadas em Nossa Senhora de Nazaré, Piauí. As amostras foram submetidas às técnicas parasitológicas microscópicas. As amostras positivas para Entamoeba spp. foram submetidas à análises moleculares por meio de Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) e sequenciamento de fragmento do DNA do gene SSU (small subunit) ribosomal DNA. Amostras positivas para G. duodenalis foram submetidas à PCR e sequenciamento de fragmento do DNA do gene da \03B2-giardina. As amostras de animais foram submetidas diretamente à PCR e sequenciamento de fragmento do DNA do gene da \03B2-giardina. Resultados. i) Em Cachoeiras de Macacu-RJ, foi observada uma taxa mais baixa de infeção por geo-helmintos, que atingiu 1,7%. Destacaram-se infecções por G. duodenalis e E. histolytica/E. dispar, com positividade de 8,6% e 13,4%, respectivamente, sendo estas infecções significativamente mais frequentes nos grupos com menor renda; ii) em áreas rurais de Teresina-PI, a proporção de infectados com A. lumbricoides e ancilostomídeos foi de 5,7% e 8,6%, respectivamente, analisando-se em conjunto as crianças de Cachoeiras de Macacu-RJ e Teresina-PI, um modelo de regressão linear múltipla demonstrou que os parâmetros antropométricos altura-para-idade e pesopara-idade foram positivamente influenciados pela renda familiar e negativamente influenciados por sexo feminino e por infecções por A. lumbricoides e E. coli; iii) Analisandose sequencias nucleotídicas do gene SSU (small subunit) ribosomal DNA de espécies de Entamoeba que produzem cistos octanucleados de todas as regiões estudadas, verificou-se que E. coli ST1 predomina nas localidades da Caatinga e Mata Atlântica, e que ST2 predomina na região amazônica. Os amebídeos tetranucleados foram caracterizados por: E. histolytica, E. dispar, e E. hartmanni, sendo E. histolytica detectada apenas na Amazônia; iv) com relação à giardíase, considerando-se todas as regiões estudadas em conjunto, a frequência de infecção foi superior em Bagre-PA (17,3%), estando associada à pobreza, à pobreza extrema e a cenários sanitários mais desfavoráveis. A genotipagem do gene da \03B2giardina revelou que na Amazônia houve predomínio de genótipo B, enquanto o genótipo A foi o mais frequente em Cachoeiras de Macacu-RJ e no Piauí; v) a genotipagem de G. duodenalis obtida de pequenos ruminantes e suínos revelou predomínio de genótipo A, filogeneticamente relacionadas a isolados humanos. Conclusões.O perfil etiológico do parasitismo intestinal variou nas regiões brasileiras analisadas, demonstrando que as mesmas ainda persistem como um problema de saúde coletiva, com claros determinantes socioambientais.Objectives. To describe local scenarios of intestinal parasite human infections in different Brazilian regions, with emphasis on the identification of socio-environmental determinants and genetic diversity of Entamoeba histolytica/Entamoeba dispar, Entamoeba coli and Giardia duodenalis. To explore the genetic diversity of G. duodenalis in infections of goats, sheep and pigs living in a peridomestic environment in the state of Piauí.Methodology. Cross-sectional studies were conducted to collect fecal samples and sociodemographic and anthropometric data in the municipalities of i) Santa Isabel do Rio Negro, Amazonas (n= 392), ii) Bagre, Pará (n=362), iii) Teresina, Piauí (n=298) and iv) São João do Piauí, Piauí (n=131), and Cachoeiras de Macacu, Rio de Janeiro (n=545). Fecal samples of pigs (n=49) goats (n=12) and sheep (n=10) were collected in Nossa Senhora do Nazaré, Piauí. The samples were submitted to parasitological microscopic techniques. Positive samples for Entamoeba spp. were submitted to molecular analysis by Polymerase Chain Reaction (PCR) and DNA sequencing of the SSU (small subunit) ribosomal DNA gene. Samples positive for G. duodenalis were submitted to PCR and DNA sequencing of the \03B2-giardin gene. The animal samples were submitted directly to PCR and sequencing. Results. i) In Cachoeiras de Macacu-RJ, a lower rate of infection by geohelminths was observed, which reached 1.7%. There, infections by G. duodenalis and E. histolytica/E. dispar stood, with positivity of 8.6% and 13.4%, respectively, these infections were significantly more frequent in the groups with lower income; ii) in rural areas of Teresina-PI, the proportion of those infected with A. lumbricoides and hookworms were 5.7% and 8.6%, respectively and, analyzing together the children of Cachoeiras de Macacu-RJ and Teresina-PI, a multiple linear regression model demonstrated that the anthropometric parameters height-for-age and weight-for-age are positively influenced by family income and negatively influenced by females and infections by A. lumbricoides and E coli. iii) Analyzing nucleotide sequences of the Small subunit rRNA gene (SSU rDNA) of Entamoeba species that produce octanucleated cysts from all regions studied, it was possible to verify that Entamoeba coli ST1 predominates in the caatinga and atlantic forest localities, while ST2 predominates in the Amazon region. Tetranucleated amoebids were characterized by: E. histolytica, E. dispar, and E. hartmanni, being E. histolytica detected only in the Amazon; iv) in relation to giardiasis, taking all the regions studied together, the frequency of infection was higher in Bagre-PA (17.3%), being associated with poverty, extreme poverty and more unfavorable health scenarios. Genotyping by partial sequencing of the \03B2-giardin gene revealed that in the Amazon there was a predominance of assemblage B, while assemblage A was the most frequent in Cachoeiras de Macacu-RJ and Piauí; v) the genotyping of G. duodenalis obtained from small ruminants and pigs revealed a predominance of assemblage A, phylogenetically related to human isolates. Conclusions. The etiological profile of intestinal parasitism varied in the Brazilian regions analyzed, demonstrating that they persist as a collective health problem, with clear socio-environmental determinants.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porGiardia lambliaEntamoebaEpidemiologiaEnteropatias ParasitáriasetiologiaEstado NutricionalGiardia lambliaEntamoebaEpidemiologiaEnteropatias ParasitáriasetiologiaEstado NutricionalEpidemiologia e caracterização molecular de parasitos intestinais em diferentes regiões brasileiras, com ênfase em Giardia duodenalis e Entamoeba spp.info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis2021Instituto Oswaldo CruzFundação Oswaldo CruzRio de JaneiroPrograma de Pós-Graduação em Medicina Tropicalinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/49469/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALdeiviane_calegar_ioc_dout_2021.pdfdeiviane_calegar_ioc_dout_2021.pdfapplication/pdf13974174https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/49469/2/deiviane_calegar_ioc_dout_2021.pdf26d1ef5996103742c1a8b9368e2f81d1MD52icict/494692023-09-04 11:49:28.125oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352023-09-04T14:49:28Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false |
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