Caracterização molecular de uma nova proteína tirosina quinase, SmFes, de Schistosoma mansoni.

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Ribeiro, Fernanda Ludolf
Data de Publicação: 2005
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/20771
Resumo: A identif icação de moléculas sinalizadoras e a elucidação de processo s de transdução de sinal de Schistosoma mansoni são necessárias para o entendi mento da interação hospedeiro- parasito e de proces sos fisiológicos do parasito. Proteínas tirosinas quinase (PTK s) são molécu las importan tes na comunica ção intra e intercelu lar, tendo um papel crucial nos mecan ismos de transdução de sinal. Estas proteínas estão envolvidas nos processo s de desenvolvim ento, diferenciação e comuni cação celular entre outros. Uma nova PTKs foi identificad a em S. mansoni e nomeada, SmFes. SmFes é um gene de cópia única e o seu cDNA comple to contém uma ORF de 3.780 pb. SmFes exibe característi cas da família Fes/Fps/Fer das PTKs, com assinaturas de domín io proteína quinase, SH2 e coiled- coil característ icos. SmFes é o prime iro gene da família Fes/Fp s/Fer identificado em S. mansoni. Análise filogenétic a revelou que SmFes está relacionada a proteínas da família Fes/Fps/Fer, agrupadas mais próximas às proteínas ortólogas de organismos invertebrados. O alinham ento entre o cDNA de SmFes e seqüências genôm icas depositadas pelos bancos de dados de S. mansoni indicara m a presença de 17 introns, alguns demonstrados experi mentalmente. Análises parciais de clones de cDNA indicara m a inserção de 9 pb na posição 3’ do exon 10, formando duas populações de cDNA, comprovadas por RFLP. A análise da seqüência genômic a indicou que existem dois possíveis sítios de edição do RNA na proximidad e 5’ do intron, indicando um evento de edição alternat iva. A existência de um alelo contendo uma inserção de 15 pb na seqüência genômi ca foi observada. As amplif icaçõ es de diferentes espécies de Schistosoma com pares de iniciador es desenhados para SmFes indicara m a presença de ortólogos de SmFes em várias espécies do gênero. SmFes é transcrita em baixos níveis nas diversas fases de desenvolvi mento do parasito, com uma maior taxa de transcrição em verm es machos, como detectado por PCR em tempo real e northern- blot. A expressão da proteína SmFes foi verificada em esporocisto, mirac ídio, verme adulto e em nível mais elevado em cercári a. Uma proteína recombinan te de SmFes foi expressa para ser usada em experim entos de identif icação de parceiros de SmFes em futuros ensaios de co-precipitaç ão e també m em experim entos de duplo híbrido. Vários possíveis parceiros de SmFes foram identificados por análise compu tacion al. A compre ensão de genes envolvidos nos mecan ismos de transdução de sinal pode fornecer novas estratégias de desenvolvi mento de drogas.
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spelling Ribeiro, Fernanda LudolfBahia, DianaOliveira, Guilherme Corrêa deBrito, Cristiana Ferreira Alves deFantappié, Marcelo RosadoOliveira, Guilherme Corrêa de2017-08-25T17:02:54Z2017-08-25T17:02:54Z2005RIBEIRO, Fernanda Ludolf. Caracterização molecular de uma nova proteína tirosina quinase, SmFes, de Schistosoma mansoni. 2005. 142 f. Dissertação (Mestrado em Ciências da Saúde - Biologia Celular e Molecular)-Ministério da Saúde. Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa René Rachou. Programa de Pós Graduação em Ciências da Saúde. Belo Horizonte. 2005https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/20771A identif icação de moléculas sinalizadoras e a elucidação de processo s de transdução de sinal de Schistosoma mansoni são necessárias para o entendi mento da interação hospedeiro- parasito e de proces sos fisiológicos do parasito. Proteínas tirosinas quinase (PTK s) são molécu las importan tes na comunica ção intra e intercelu lar, tendo um papel crucial nos mecan ismos de transdução de sinal. Estas proteínas estão envolvidas nos processo s de desenvolvim ento, diferenciação e comuni cação celular entre outros. Uma nova PTKs foi identificad a em S. mansoni e nomeada, SmFes. SmFes é um gene de cópia única e o seu cDNA comple to contém uma ORF de 3.780 pb. SmFes exibe característi cas da família Fes/Fps/Fer das PTKs, com assinaturas de domín io proteína quinase, SH2 e coiled- coil característ icos. SmFes é o prime iro gene da família Fes/Fp s/Fer identificado em S. mansoni. Análise filogenétic a revelou que SmFes está relacionada a proteínas da família Fes/Fps/Fer, agrupadas mais próximas às proteínas ortólogas de organismos invertebrados. O alinham ento entre o cDNA de SmFes e seqüências genôm icas depositadas pelos bancos de dados de S. mansoni indicara m a presença de 17 introns, alguns demonstrados experi mentalmente. Análises parciais de clones de cDNA indicara m a inserção de 9 pb na posição 3’ do exon 10, formando duas populações de cDNA, comprovadas por RFLP. A análise da seqüência genômic a indicou que existem dois possíveis sítios de edição do RNA na proximidad e 5’ do intron, indicando um evento de edição alternat iva. A existência de um alelo contendo uma inserção de 15 pb na seqüência genômi ca foi observada. As amplif icaçõ es de diferentes espécies de Schistosoma com pares de iniciador es desenhados para SmFes indicara m a presença de ortólogos de SmFes em várias espécies do gênero. SmFes é transcrita em baixos níveis nas diversas fases de desenvolvi mento do parasito, com uma maior taxa de transcrição em verm es machos, como detectado por PCR em tempo real e northern- blot. A expressão da proteína SmFes foi verificada em esporocisto, mirac ídio, verme adulto e em nível mais elevado em cercári a. Uma proteína recombinan te de SmFes foi expressa para ser usada em experim entos de identif icação de parceiros de SmFes em futuros ensaios de co-precipitaç ão e també m em experim entos de duplo híbrido. Vários possíveis parceiros de SmFes foram identificados por análise compu tacion al. A compre ensão de genes envolvidos nos mecan ismos de transdução de sinal pode fornecer novas estratégias de desenvolvi mento de drogas.The identifi cation and elucida tion of signal transduction molecules and mechan isms are necessary for the understanding of the Schistosoma mansoni host-parasite interac tion and of physiologica l process of the parasite. Protein Tyrosine kinases (PTKs) are impor tant molecu les for intra and interce llular comm unication, playing a crucial role in signal transduction processes. These proteins are known to be involved in developm ental, differentiat ion and communication processes of cells, among others. A novel member of PTK was identified in S. mansoni and designated SmFes. SmFes is a single copy gene and the comple te cDNA contains a 3.780 bp ORF. SmFes exhibits the characteristi c features of Fes/Fps/Fer protein tyrosine kinases family, containing three coiled- coil regions, an SH2 and a protein tyrosine kinase catal ytic doma in signatures. SmFes is the first gene from Fes/Fps/Fer family identified in S. mansoni. Phylogene tic analyses reveled that SmFes is more closel y related to invertebrate proteins orthologues of the Fes/Fps/Fer family. The assembly of the SmFes cDNA and genomi c sequences indicated the presence of 17 introns, some experim entally demonstra ted. Analy sis of partial cDNA clones indicated the presence of a 9 pb insertion at the 3’ end of exon 10, producing two different populations of cDNA. The analysis of the genomi c sequence indicated that there are two possible splice sites at the 5’end of the intron, pointing to an alternative splicing event in the SmFes pre-mRNA. An allele of the SmFes containing a 15 pb insertion was observed in genomi c sequence. The amplification of different Schistosoma species with SmFes specific primers indicat ed that orthologues of SmFes are present in several species of the genus. SmFes is transcribed at low levels in the different develop mental stages of the parasite, with higher level in adult male worms as detected by real time PCR and northern-blot . The expression of SmFes protein was verified in sporoc yst, mirac idium, adult worm and in higher levels in cercariae. A recombin ant protein was expressed to be used in experi ments to identif y SmFes partner proteins in future pull- down assay s and also in two-h ybrid systems. Various possible partners or SmFes were identified by computa tional analy sis. The comprehension of signal transduction processes could also contribute to the identific ation of po ssible new targets for drug s.Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil.porSchistosoma mansonimoléculas sinalizadorasCaracterização molecular de uma nova proteína tirosina quinase, SmFes, de Schistosoma mansoni.info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2005Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas René RachouMestrado AcadêmicoBelo Horizonte/MGPrograma de Pós-Graduação em Ciências da Saúdeinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-83082https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/20771/1/license.txt9193a7c197bc67acd023525e72a03240MD51ORIGINALFernanda Ludolf Ribeiro.pdfFernanda Ludolf Ribeiro.pdfapplication/pdf37073099https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/20771/2/Fernanda%20Ludolf%20Ribeiro.pdf866dc18aba4b6a7fa2899db801df0c20MD52TEXTFernanda Ludolf Ribeiro.pdf.txtFernanda Ludolf Ribeiro.pdf.txtExtracted texttext/plain156531https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/20771/3/Fernanda%20Ludolf%20Ribeiro.pdf.txt92d3c8884090573d23419dc130fee263MD53icict/207712019-09-09 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