Análise da diversidade genética por aflp e identificação de marcadores associados à resistência a doenças em videira.
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2005 |
Outros Autores: | , , |
Tipo de documento: | Artigo |
Idioma: | eng |
Título da fonte: | Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) |
Texto Completo: | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/540917 |
Resumo: | RESUMO - Com objetivo de estudar diversidade genética e identificar marcadores associados à resistência ao míldio (Plasmopara viticola) e ao oídio (Uncinula necator), foram analisadas as cultivares de videira A 1976, CG 87746, CNPUV 154-27, Crimson Seedless, Gota de Ouro, Itália, Seyve Villard 12327 e Seyve Villard 12375. As análises de polimorfismo de comprimento de fragmento amplificado (AFLP) seguiram as etapas de digestão, ligação, pré-amplificação e amplificação. Efetuou-se a separação dos fragmentos amplificados em gel de 7% de poliacrilamida desnaturante (uréia 7M) e coloração com nitrato de prata. A similaridade foi estimada com base no coeficiente de Jaccard, e a agregação, por UPGMA. Foi gerada uma matriz de similaridade com bom ajustamento da agregação (r = 0,84). Os agrupamentos obtidos corresponderam à origem e classificação botânica das cultivares. Foram identificadas 15 marcas dissimilares associadas à resistência, sendo oito para míldio e sete para oídio. Termos para indexação: videira, marcadores AFLP, resistência a doenças, míldio, oídio. ABSTRACT - The grapevine cultivars A 1976, CG 87746, CNPUV 154-27, Crimson Seedless, Gota de Ouro, Itália, Seyve Villard 12327 and Seyve Villard 12375 were analyzed to establish the genetic relationship and to identify markers associated with resistance to downy mildew (Plasmopara viticola) and powdery mildew (Uncinula necator). The amplified fragment lenght polymorphism (AFLP) analysis comprise the steps of digestion, ligation, preamplification and amplification. The amplified fragments were separeted on a 7% denaturing polyacrylamide gel (7M urea) and silver stained. The similarity was estimated using Jaccard?s coefficient and the clustering was estimated by UPGMA. A similarity matrix was generated with a good fit for aggregation (r = 0,84). The clusters corresponded to origin and botany classification of the cultivars. Fifteen markers were associated with resistance, eight for downy mildew and seven for powdery mildew. Index terms: grapevine, AFLP markers, disease resistance, downy mildew, powdery mildew. |
id |
EMBR_2e4bca6ece23c1a1faa1de1529049bdd |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:www.alice.cnptia.embrapa.br:doc/540917 |
network_acronym_str |
EMBR |
network_name_str |
Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) |
repository_id_str |
2154 |
spelling |
Análise da diversidade genética por aflp e identificação de marcadores associados à resistência a doenças em videira.AFLPDoença de PlantaMarcador MolecularMíldioOídioResistênciaUvaViticulturaRESUMO - Com objetivo de estudar diversidade genética e identificar marcadores associados à resistência ao míldio (Plasmopara viticola) e ao oídio (Uncinula necator), foram analisadas as cultivares de videira A 1976, CG 87746, CNPUV 154-27, Crimson Seedless, Gota de Ouro, Itália, Seyve Villard 12327 e Seyve Villard 12375. As análises de polimorfismo de comprimento de fragmento amplificado (AFLP) seguiram as etapas de digestão, ligação, pré-amplificação e amplificação. Efetuou-se a separação dos fragmentos amplificados em gel de 7% de poliacrilamida desnaturante (uréia 7M) e coloração com nitrato de prata. A similaridade foi estimada com base no coeficiente de Jaccard, e a agregação, por UPGMA. Foi gerada uma matriz de similaridade com bom ajustamento da agregação (r = 0,84). Os agrupamentos obtidos corresponderam à origem e classificação botânica das cultivares. Foram identificadas 15 marcas dissimilares associadas à resistência, sendo oito para míldio e sete para oídio. Termos para indexação: videira, marcadores AFLP, resistência a doenças, míldio, oídio. ABSTRACT - The grapevine cultivars A 1976, CG 87746, CNPUV 154-27, Crimson Seedless, Gota de Ouro, Itália, Seyve Villard 12327 and Seyve Villard 12375 were analyzed to establish the genetic relationship and to identify markers associated with resistance to downy mildew (Plasmopara viticola) and powdery mildew (Uncinula necator). The amplified fragment lenght polymorphism (AFLP) analysis comprise the steps of digestion, ligation, preamplification and amplification. The amplified fragments were separeted on a 7% denaturing polyacrylamide gel (7M urea) and silver stained. The similarity was estimated using Jaccard?s coefficient and the clustering was estimated by UPGMA. A similarity matrix was generated with a good fit for aggregation (r = 0,84). The clusters corresponded to origin and botany classification of the cultivars. Fifteen markers were associated with resistance, eight for downy mildew and seven for powdery mildew. Index terms: grapevine, AFLP markers, disease resistance, downy mildew, powdery mildew.PAULO RICARDO DIAS DE OLIVEIRA, CNPUV.OLIVEIRA, P. R. D. deSCOTTON, D. C.NISHIMURA, D. S.FIGUEIRA, A.2019-04-14T00:29:31Z2019-04-14T00:29:31Z2006-02-0120052019-04-14T00:29:31Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleRevista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, v. 27, n. 3, p. 454-457, 2005.http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/540917enginfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)instacron:EMBRAPA2019-04-14T00:29:37Zoai:www.alice.cnptia.embrapa.br:doc/540917Repositório InstitucionalPUBhttps://www.alice.cnptia.embrapa.br/oai/requestopendoar:21542019-04-14T00:29:37falseRepositório InstitucionalPUBhttps://www.alice.cnptia.embrapa.br/oai/requestcg-riaa@embrapa.bropendoar:21542019-04-14T00:29:37Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)false |
dc.title.none.fl_str_mv |
Análise da diversidade genética por aflp e identificação de marcadores associados à resistência a doenças em videira. |
title |
Análise da diversidade genética por aflp e identificação de marcadores associados à resistência a doenças em videira. |
spellingShingle |
Análise da diversidade genética por aflp e identificação de marcadores associados à resistência a doenças em videira. OLIVEIRA, P. R. D. de AFLP Doença de Planta Marcador Molecular Míldio Oídio Resistência Uva Viticultura |
title_short |
Análise da diversidade genética por aflp e identificação de marcadores associados à resistência a doenças em videira. |
title_full |
Análise da diversidade genética por aflp e identificação de marcadores associados à resistência a doenças em videira. |
title_fullStr |
Análise da diversidade genética por aflp e identificação de marcadores associados à resistência a doenças em videira. |
title_full_unstemmed |
Análise da diversidade genética por aflp e identificação de marcadores associados à resistência a doenças em videira. |
title_sort |
Análise da diversidade genética por aflp e identificação de marcadores associados à resistência a doenças em videira. |
author |
OLIVEIRA, P. R. D. de |
author_facet |
OLIVEIRA, P. R. D. de SCOTTON, D. C. NISHIMURA, D. S. FIGUEIRA, A. |
author_role |
author |
author2 |
SCOTTON, D. C. NISHIMURA, D. S. FIGUEIRA, A. |
author2_role |
author author author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
PAULO RICARDO DIAS DE OLIVEIRA, CNPUV. |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
OLIVEIRA, P. R. D. de SCOTTON, D. C. NISHIMURA, D. S. FIGUEIRA, A. |
dc.subject.por.fl_str_mv |
AFLP Doença de Planta Marcador Molecular Míldio Oídio Resistência Uva Viticultura |
topic |
AFLP Doença de Planta Marcador Molecular Míldio Oídio Resistência Uva Viticultura |
description |
RESUMO - Com objetivo de estudar diversidade genética e identificar marcadores associados à resistência ao míldio (Plasmopara viticola) e ao oídio (Uncinula necator), foram analisadas as cultivares de videira A 1976, CG 87746, CNPUV 154-27, Crimson Seedless, Gota de Ouro, Itália, Seyve Villard 12327 e Seyve Villard 12375. As análises de polimorfismo de comprimento de fragmento amplificado (AFLP) seguiram as etapas de digestão, ligação, pré-amplificação e amplificação. Efetuou-se a separação dos fragmentos amplificados em gel de 7% de poliacrilamida desnaturante (uréia 7M) e coloração com nitrato de prata. A similaridade foi estimada com base no coeficiente de Jaccard, e a agregação, por UPGMA. Foi gerada uma matriz de similaridade com bom ajustamento da agregação (r = 0,84). Os agrupamentos obtidos corresponderam à origem e classificação botânica das cultivares. Foram identificadas 15 marcas dissimilares associadas à resistência, sendo oito para míldio e sete para oídio. Termos para indexação: videira, marcadores AFLP, resistência a doenças, míldio, oídio. ABSTRACT - The grapevine cultivars A 1976, CG 87746, CNPUV 154-27, Crimson Seedless, Gota de Ouro, Itália, Seyve Villard 12327 and Seyve Villard 12375 were analyzed to establish the genetic relationship and to identify markers associated with resistance to downy mildew (Plasmopara viticola) and powdery mildew (Uncinula necator). The amplified fragment lenght polymorphism (AFLP) analysis comprise the steps of digestion, ligation, preamplification and amplification. The amplified fragments were separeted on a 7% denaturing polyacrylamide gel (7M urea) and silver stained. The similarity was estimated using Jaccard?s coefficient and the clustering was estimated by UPGMA. A similarity matrix was generated with a good fit for aggregation (r = 0,84). The clusters corresponded to origin and botany classification of the cultivars. Fifteen markers were associated with resistance, eight for downy mildew and seven for powdery mildew. Index terms: grapevine, AFLP markers, disease resistance, downy mildew, powdery mildew. |
publishDate |
2005 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2005 2006-02-01 2019-04-14T00:29:31Z 2019-04-14T00:29:31Z 2019-04-14T00:29:31Z |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion info:eu-repo/semantics/article |
format |
article |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
Revista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, v. 27, n. 3, p. 454-457, 2005. http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/540917 |
identifier_str_mv |
Revista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, v. 27, n. 3, p. 454-457, 2005. |
url |
http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/540917 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
eng |
language |
eng |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) instacron:EMBRAPA |
instname_str |
Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) |
instacron_str |
EMBRAPA |
institution |
EMBRAPA |
reponame_str |
Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) |
collection |
Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) |
repository.mail.fl_str_mv |
cg-riaa@embrapa.br |
_version_ |
1794503474003574784 |