Structural, functional and comparative genomics of Nile tilapia (Oreochromis niloticus)

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Bueno, Laura
Data de Publicação: 2024
Outros Autores: Choupina, Altino
Tipo de documento: Artigo
Idioma: por
Título da fonte: Revista Brasileira de Iniciação Científica
Texto Completo: https://periodicoscientificos.itp.ifsp.edu.br/index.php/rbic/article/view/1551
Resumo: Nile tilapia stands out in aquaculture due to its adaptability to freshwater and brackish water environments. The significant advance in the area of ​​genomics culminated in the sequencing and annotation of the genome of Oreochromis niloticus, submitted by the University of Maryland in 2019. The present study aims to present structural, functional and comparative aspects of the genome of this species, through the use of genomic databases, focusing on the growth hormone (GH) gene. Genomic associative studies allowed the identification of another five genes related to growth. Phylogenetic analysis revealed the evolution of this gene in several species, while functional and comparative genomics point to the need for greater characterization of the relationships between genes.
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spelling Structural, functional and comparative genomics of Nile tilapia (Oreochromis niloticus)Genómica estructural, funcional y comparada de la tilapia del Nilo (Oreochromis niloticus)Genômica estrutural, funcional e comparativa da tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus)GenômicaGHOreochromis niloticusTilápia do NilobiologiaGenomicsGHOreochromis niloticusNile tilapiabiological sciencesGenómicaGHOreochromis niloticusTilapia del NilobiologíaNile tilapia stands out in aquaculture due to its adaptability to freshwater and brackish water environments. The significant advance in the area of ​​genomics culminated in the sequencing and annotation of the genome of Oreochromis niloticus, submitted by the University of Maryland in 2019. The present study aims to present structural, functional and comparative aspects of the genome of this species, through the use of genomic databases, focusing on the growth hormone (GH) gene. Genomic associative studies allowed the identification of another five genes related to growth. Phylogenetic analysis revealed the evolution of this gene in several species, while functional and comparative genomics point to the need for greater characterization of the relationships between genes.La tilapia del Nilo se destaca en la acuicultura debido a su adaptabilidad a ambientes de agua dulce y salobre. El importante avance en el área de genómica culminó con la secuenciación y anotación del genoma de Oreochromis niloticus, presentado por la Universidad de Maryland en 2019. El presente estudio tiene como objetivo presentar aspectos estructurales, funcionales y comparativos del genoma de esta especie, mediante el uso de bases de datos genómicas, centrándose en el gen de la hormona del crecimiento (GH). Los estudios genómicos asociativos permitieron identificar otros cinco genes relacionados con el crecimiento. Los análisis filogenéticos revelaron la evolución de este gen en varias especies, mientras que la genómica funcional y comparada apuntan a la necesidad de una mayor caracterización de las relaciones entre genes.A tilápia do Nilo destaca-se na aquacultura devido à sua adaptabilidade a ambientes de água doce e salobra. O avanço significativo na área da genômica culminou na sequenciação e anotação do genoma de Oreochromis niloticus, submetido pela Universidade de Maryland no ano de 2019. O presente estudo tem como objetivo apresentar aspectos estruturais, funcionais e comparativos do genoma desta espécie, através da utilização de bancos de dados genômicos, tendo como foco o gene do hormônio do crescimento (GH). Estudos associativos genômicos permitiram a identificação de outros cinco genes relacionados ao crescimento. A análise filogenética revelou a evolução deste gene em diversas espécies, enquanto a genômica funcional e comparativa apontam para a necessidade de maior caracterização das relações entre genes.Revista Brasileira de Iniciação Científica2024-02-29info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionartigo avaliado pelos paresapplication/pdfhttps://periodicoscientificos.itp.ifsp.edu.br/index.php/rbic/article/view/1551Revista Brasileira de Iniciação Científica; Volume 11, 2024 – publicação Contínua; e0240142359-232Xreponame:Revista Brasileira de Iniciação Científicainstname:Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de São Paulo (IFSP)instacron:IFSPporhttps://periodicoscientificos.itp.ifsp.edu.br/index.php/rbic/article/view/1551/597Copyright (c) 2024 Revista Brasileira de Iniciação Científicahttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0info:eu-repo/semantics/openAccessBueno, LauraChoupina, Altino2024-04-05T14:02:25Zoai:ojs2.periodicosnovo.itp.ifsp.edu.br:article/1551Revistahttps://periodicos.itp.ifsp.edu.br/index.php/IC/PUBhttps://periodicos.itp.ifsp.edu.br/index.php/IC/oaishigunov.ifsp.edu@gmail.com||revista.hipotese@gmail.com2359-232X2359-232Xopendoar:2024-04-05T14:02:25Revista Brasileira de Iniciação Científica - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de São Paulo (IFSP)false
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