Biomarkers in Ovis aries

• Main Author: Esteves, Eduardo Jorge Mónica
• Publication Date: 2014
• Format: Master thesis
• Language: por
• Source: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
• Download full: http://hdl.handle.net/10773/14034
• topic: Biologia molecular; Bioinformática; Proteínas - Bases de dados; Proteomas; Marcadores bioquímicos; Ovinos - Patologias

Ferramentas que armazenem e procedam à catalogação das proteínas identificadas em proteomas resultantes de amostras de tecidos diversos recolhidos a partir de indivíduos representativos de situações fisiológicas e patológicas, constituem instrumentos poderosos para a integração da informação já publicada. Muita informação sobre os mecanismos moleculares subjacentes a patologias pode hoje ser gerada a partir de estratégias bioinformáticas. No âmbito de projetos anteriormente desenvolvidos foi construída uma base de dados, o OralOme. O presente trabalho tem como objetivo a criação de uma base de dados, o OvinOme, aplicando a mesma metodologia desenvolvida para saúde humana, agora para o armazenamento e catalogação de proteínas identificadas a partir dos proteomas parciais de Ovis aries. A criação desta ferramenta bioinformática contribuirá para o desenvolvimento de métodos de diagnóstico em vida, capazes de detetar as principais patologias que grassam nos rebanhos de ovelhas Serra da Estrela. O desenvolvimento da base de dados passa pelo compilar manual das proteínas identificadas pelos vários estudos publicados relativamente a Ovis aries, anotando toda a informação relativa à caracterização do individuo dador da amostra, tipo de amostra biológica, técnicas utilizadas para a identificação das proteínas e toda a informação conhecida relativa a cada proteína catalogada. O desenvolvimento de um método de diagnóstico em vida passa pela concepção de protocolos de colheita, armazenamento e caracterização da qualidade da amostra. Assim no âmbito de presente trabalho foi também objectivo o desenvolvimento de toda a estratégia para recolha de amostras de saliva em ovinos, transporte, armazenamento e avaliação da qualidade da amostra. A criação de um banco de saliva de rebanhos de ovelhas Serra da Estrela será um objectivo a cumprir em termos de futuro, visando o estabelecimento do diagnóstico precoce utilizando a saliva como fluído para avaliação de proteínas que identifiquem cada patologia, determinadas por análise in silico recorrendo á ferramenta bioinformática OvinOme desenvolvida no âmbito do presente trabalho.