Proposal for a mass spectrometry analysis simulation model for practical Biochemistry classes in higher education

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Barbosa, Eduardo Fernandes
Data de Publicação: 2015
Tipo de documento: Artigo
Idioma: por
Título da fonte: Revista de Ensino de Bioquímica
Texto Completo: http://bioquimica.org.br/revista/ojs/index.php/REB/article/view/556
Resumo: Mass spectrometry is a very important tool to elucidate many aspects of modern biochemistry. This proposal aims to enable that any graduate student get an initial contact with this technique through simulations in practical classes. Low cost and simple implementation enable and facilitate its application. The student can understand the basic principles of mass spectrometry and enable data interpretation obtained through this methodology. This simulation can provide to students an initial contact with modern research tools on Internet databases for structural similarity, as well as the elucidation of possible secondary structures in biomolecules. After application of this proposal it is expected that students can understand better and more critically the data from these advanced characterization techniques largely used in biochemical and molecular sciences.
id SBBQM-1_2d3fef79cab0f27838f146d485de4c14
oai_identifier_str oai:ojs.bioquimica.org.br:article/556
network_acronym_str SBBQM-1
network_name_str Revista de Ensino de Bioquímica
repository_id_str
spelling Proposal for a mass spectrometry analysis simulation model for practical Biochemistry classes in higher educationProposta de um modelo de simulação de análises de espectrometria de massa para aulas práticas de Bioquímica no ensino superiorMass Spectrometry; Simulation; Biochemistry TeachingSimulação para Aula PráticaEspectrometria de massa; Simulação; Ensino de BioquímicaMass spectrometry is a very important tool to elucidate many aspects of modern biochemistry. This proposal aims to enable that any graduate student get an initial contact with this technique through simulations in practical classes. Low cost and simple implementation enable and facilitate its application. The student can understand the basic principles of mass spectrometry and enable data interpretation obtained through this methodology. This simulation can provide to students an initial contact with modern research tools on Internet databases for structural similarity, as well as the elucidation of possible secondary structures in biomolecules. After application of this proposal it is expected that students can understand better and more critically the data from these advanced characterization techniques largely used in biochemical and molecular sciences.A espectrometria de massa representa uma ferramenta de grande importância na elucidação de vários aspectos da bioquímica moderna. A presente proposta objetiva possibilitar a qualquer estudante de graduação um contato com essa técnica, por meio de simulações em aulas práticas. O baixo custo envolvido e a execução simples viabilizam e facilitam sua aplicação. O estudante pode compreender os princípios básicos da técnica de espectrometria de massa e se capacitar à interpretação de dados obtidos por meio dessa metodologia. Possibilita-se ainda ao estudante o contato com ferramentas modernas de busca em bancos de dados disponíveis na internet, tanto para investigações de similaridade estrutural com os dados obtidos na simulação, quanto na elucidação de possíveis estruturas secundárias nas biomoléculas. Após a aplicação dessa proposta espera-se que o estudante possa compreender melhor e mais criticamente os dados oriundos dessas técnicas avançadas de caracterização que são amplamente utilizadas nas ciências bioquímicas e moleculares.Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBqUniversidade Federal do Oeste da BahiaBarbosa, Eduardo Fernandes2015-12-23info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionSimulação de técnica experimentalapplication/pdfhttp://bioquimica.org.br/revista/ojs/index.php/REB/article/view/55610.16923/reb.v13i2.556Revista de Ensino de Bioquímica; v. 13, n. 3 (2015): REB (Jul - Dez); 36 - 53Revista de Enseñanza de Bioquímica; v. 13, n. 3 (2015): REB (Jul - Dez); 36 - 53Journal of Biochemistry Education; v. 13, n. 3 (2015): REB (Jul - Dez); 36 - 53Revista de Ensino de Bioquímica; v. 13, n. 3 (2015): REB (Jul - Dez); 36 - 532318-8790reponame:Revista de Ensino de Bioquímicainstname:Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq)instacron:SBBQMporhttp://bioquimica.org.br/revista/ojs/index.php/REB/article/view/556/517/*ref*/Tyers M, Mann M. From genomics to proteomics. Nature 2003; 422 (6928): 193-197./*ref*/Aebersold R, Mann M. Mass spectrometry-based proteomics. Nature 2003; 422 (6928): 198-207./*ref*/Cantú MD, Carrilho E. Sequenciamento de peptídeos usando espectrometria de massas: um guia prático. Quim Nova 2008; 31 (3): 669-675./*ref*/Karas M, Hillenkamp F. Laser desorption ionization of proteins with molecular masses exceeding 10,000 daltons. Anal Chem 1988; 60 (20): 2299-2301./*ref*/Fenn JB, Mann M, Meng CK, Wong SF, Whitehouse CM. Electrospray ionization for mass spectrometry of large biomolecules. Science 1989; 246 (4926): 64-71./*ref*/Steen H, Mann M. The abc's (and xyz's) of peptide sequencing. Nature Rev 2004; 5: 699-711./*ref*/Kinter K, Sherman NE. Protein sequencing and identification using tandem mass spectrometry, Wiley-Intersc: New York, 2000./*ref*/Nelson DL, Cox MM. Lehninger: Princípios de Bioquímica. 5. ed. São Paulo: SARVIER. 2011.Brasília, Bahia, Brasil2013; 2015Estudante; ProfessorDireitos autorais 2015 Revista de Ensino de Bioquímicahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0info:eu-repo/semantics/openAccess2022-03-25T17:24:59Zoai:ojs.bioquimica.org.br:article/556Revistahttp://bioquimica.org.br/revista/ojs/index.php/REBONGhttp://bioquimica.org.br/revista/ojs/index.php/REB/oaicontato@bioquimica.org.br||ensinodebioquimica@gmail.com2318-87901677-2318opendoar:2022-03-25T17:24:59Revista de Ensino de Bioquímica - Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq)false
dc.title.none.fl_str_mv Proposal for a mass spectrometry analysis simulation model for practical Biochemistry classes in higher education
Proposta de um modelo de simulação de análises de espectrometria de massa para aulas práticas de Bioquímica no ensino superior
title Proposal for a mass spectrometry analysis simulation model for practical Biochemistry classes in higher education
spellingShingle Proposal for a mass spectrometry analysis simulation model for practical Biochemistry classes in higher education
Barbosa, Eduardo Fernandes
Mass Spectrometry; Simulation; Biochemistry Teaching
Simulação para Aula Prática
Espectrometria de massa; Simulação; Ensino de Bioquímica
title_short Proposal for a mass spectrometry analysis simulation model for practical Biochemistry classes in higher education
title_full Proposal for a mass spectrometry analysis simulation model for practical Biochemistry classes in higher education
title_fullStr Proposal for a mass spectrometry analysis simulation model for practical Biochemistry classes in higher education
title_full_unstemmed Proposal for a mass spectrometry analysis simulation model for practical Biochemistry classes in higher education
title_sort Proposal for a mass spectrometry analysis simulation model for practical Biochemistry classes in higher education
author Barbosa, Eduardo Fernandes
author_facet Barbosa, Eduardo Fernandes
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv
Universidade Federal do Oeste da Bahia
dc.contributor.author.fl_str_mv Barbosa, Eduardo Fernandes
dc.subject.none.fl_str_mv
dc.subject.por.fl_str_mv Mass Spectrometry; Simulation; Biochemistry Teaching
Simulação para Aula Prática
Espectrometria de massa; Simulação; Ensino de Bioquímica
topic Mass Spectrometry; Simulation; Biochemistry Teaching
Simulação para Aula Prática
Espectrometria de massa; Simulação; Ensino de Bioquímica
description Mass spectrometry is a very important tool to elucidate many aspects of modern biochemistry. This proposal aims to enable that any graduate student get an initial contact with this technique through simulations in practical classes. Low cost and simple implementation enable and facilitate its application. The student can understand the basic principles of mass spectrometry and enable data interpretation obtained through this methodology. This simulation can provide to students an initial contact with modern research tools on Internet databases for structural similarity, as well as the elucidation of possible secondary structures in biomolecules. After application of this proposal it is expected that students can understand better and more critically the data from these advanced characterization techniques largely used in biochemical and molecular sciences.
publishDate 2015
dc.date.none.fl_str_mv 2015-12-23
dc.type.none.fl_str_mv




dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
Simulação de técnica experimental
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://bioquimica.org.br/revista/ojs/index.php/REB/article/view/556
10.16923/reb.v13i2.556
url http://bioquimica.org.br/revista/ojs/index.php/REB/article/view/556
identifier_str_mv 10.16923/reb.v13i2.556
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv http://bioquimica.org.br/revista/ojs/index.php/REB/article/view/556/517
/*ref*/Tyers M, Mann M. From genomics to proteomics. Nature 2003; 422 (6928): 193-197.
/*ref*/Aebersold R, Mann M. Mass spectrometry-based proteomics. Nature 2003; 422 (6928): 198-207.
/*ref*/Cantú MD, Carrilho E. Sequenciamento de peptídeos usando espectrometria de massas: um guia prático. Quim Nova 2008; 31 (3): 669-675.
/*ref*/Karas M, Hillenkamp F. Laser desorption ionization of proteins with molecular masses exceeding 10,000 daltons. Anal Chem 1988; 60 (20): 2299-2301.
/*ref*/Fenn JB, Mann M, Meng CK, Wong SF, Whitehouse CM. Electrospray ionization for mass spectrometry of large biomolecules. Science 1989; 246 (4926): 64-71.
/*ref*/Steen H, Mann M. The abc's (and xyz's) of peptide sequencing. Nature Rev 2004; 5: 699-711.
/*ref*/Kinter K, Sherman NE. Protein sequencing and identification using tandem mass spectrometry, Wiley-Intersc: New York, 2000.
/*ref*/Nelson DL, Cox MM. Lehninger: Princípios de Bioquímica. 5. ed. São Paulo: SARVIER. 2011.
dc.rights.driver.fl_str_mv Direitos autorais 2015 Revista de Ensino de Bioquímica
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Direitos autorais 2015 Revista de Ensino de Bioquímica
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv


Brasília, Bahia, Brasil
2013; 2015
Estudante; Professor
dc.publisher.none.fl_str_mv Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq
publisher.none.fl_str_mv Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq
dc.source.none.fl_str_mv Revista de Ensino de Bioquímica; v. 13, n. 3 (2015): REB (Jul - Dez); 36 - 53
Revista de Enseñanza de Bioquímica; v. 13, n. 3 (2015): REB (Jul - Dez); 36 - 53
Journal of Biochemistry Education; v. 13, n. 3 (2015): REB (Jul - Dez); 36 - 53
Revista de Ensino de Bioquímica; v. 13, n. 3 (2015): REB (Jul - Dez); 36 - 53
2318-8790
reponame:Revista de Ensino de Bioquímica
instname:Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq)
instacron:SBBQM
instname_str Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq)
instacron_str SBBQM
institution SBBQM
reponame_str Revista de Ensino de Bioquímica
collection Revista de Ensino de Bioquímica
repository.name.fl_str_mv Revista de Ensino de Bioquímica - Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq)
repository.mail.fl_str_mv contato@bioquimica.org.br||ensinodebioquimica@gmail.com
_version_ 1752126679502815232

Registros relacionados