Caracterização molecular do vírus associado à doença do amarelão do meloeiro

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Autor(a) principal: Dutra, Luisa Silva
Data de Publicação: 2007
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UCB
Texto Completo: https://repositorio.ucb.br:9443/jspui/handle/123456789/12296
Resumo: Recentemente, uma doença viral em plantas de melão se tornou um sério problema para o Brasil. Os sintomas foram principalmente o amarelecimento e o mosqueado nas folhas mais velhas. Partículas virais longas e filamentosas, assemelhando-se às de Carlavirus, foram encontradas em folhas sintomáticas. Neste estudo a região terminal 3’ do genoma do isolado viral de uma planta infectada, incluindo os últimos cinco ORFs, foram clonados e seqüenciados. Uma parte da região do genoma tinha 3137 nucleotídeos, incluindo a região 3’ UTR sem contar com a cauda poli(A). A seqüência revelou três novos ORFs, exibindo similaridade ao “triple gene block” (TGB) do Carlavirus (Sweet potato chlorotic fleck virus). Dois ORFs, os quais eram associados ao gene viral da capa protéica e ao gene da “nucleic acid-binding protein” do vírus Melon yellowing-associated virus foram também analisados através de comparações com as seqüências anteriormente reportadas. O possível domínio da helicase foi reconhecido no domínio da proteína TGB 1 através da busca de domínio. A proteína TGB 2 é possivelmente a proteína associada ao movimento viral célula-a-célula. A análise das seqüências, a organização do genoma e a morfologia das partículas virais indicaram que o vírus pode ser classificado como um novo flexivirus transmitido por mosca-branca.
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spelling Nagata, TatsuyaDutra, Luisa Silva2019-09-20T20:47:02Z2019-07-262019-09-20T20:47:02Z2007-05DUTRA, Luisa Silva. Caracterização molecular do vírus associado à doença do amarelão do meloeiro. 2007. 68 f. Monografia (Graduação em Ciências Biológicas) – Universidade Católica de Brasília, Brasília, 2007.https://repositorio.ucb.br:9443/jspui/handle/123456789/12296Recentemente, uma doença viral em plantas de melão se tornou um sério problema para o Brasil. Os sintomas foram principalmente o amarelecimento e o mosqueado nas folhas mais velhas. Partículas virais longas e filamentosas, assemelhando-se às de Carlavirus, foram encontradas em folhas sintomáticas. Neste estudo a região terminal 3’ do genoma do isolado viral de uma planta infectada, incluindo os últimos cinco ORFs, foram clonados e seqüenciados. Uma parte da região do genoma tinha 3137 nucleotídeos, incluindo a região 3’ UTR sem contar com a cauda poli(A). A seqüência revelou três novos ORFs, exibindo similaridade ao “triple gene block” (TGB) do Carlavirus (Sweet potato chlorotic fleck virus). Dois ORFs, os quais eram associados ao gene viral da capa protéica e ao gene da “nucleic acid-binding protein” do vírus Melon yellowing-associated virus foram também analisados através de comparações com as seqüências anteriormente reportadas. O possível domínio da helicase foi reconhecido no domínio da proteína TGB 1 através da busca de domínio. A proteína TGB 2 é possivelmente a proteína associada ao movimento viral célula-a-célula. A análise das seqüências, a organização do genoma e a morfologia das partículas virais indicaram que o vírus pode ser classificado como um novo flexivirus transmitido por mosca-branca.In recent years, a viral disease on melon plants becomes a serious problem in Brazil. Symptoms were principally yellowing and mottling on older leaves. Long filamentous virus particles, resembling those of carlaviruses, were seen in symptomatic leaves. In this study, the 3’ terminal region of the virus genome isolated from an infected plant, including the last five ORFs, was cloned and sequenced. The partial genomic region had 3137 nucleotides in length, including the region 3’UTR without counting Poly-A tail. The sequence revealed three new ORFs, those of exhibiting similarity to Carlavirus (Sweet potato chlorotic fleck virus) “triple gene block” (TGB). Two ORFs which were Melon yellowing-associated virus coat protein gene and potencial nucleic acid-binding protein gene were also analyzed by comparison with former reported sequence. The possible helicase domain were recognized in TGB 1 by domain research. The protein TGB 2 is possible cell-to-cell viral movement protein. The sequence analysis, the genome organization and the virus particle morphology indicated that the virus could be classified as a novel whitefly-transmitted flexivirus.Submitted by Maria José Martins (mmartins@ucb.br) on 2019-07-26T13:58:13Z No. of bitstreams: 1 LuisaSilvaDutraTCCGraduacao2007.pdf: 640507 bytes, checksum: 05178acf74efe2bf15d116a3b1091b8e (MD5)Approved for entry into archive by Sara Ribeiro (sara.ribeiro@ucb.br) on 2019-09-20T20:47:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 LuisaSilvaDutraTCCGraduacao2007.pdf: 640507 bytes, checksum: 05178acf74efe2bf15d116a3b1091b8e (MD5)Made available in DSpace on 2019-09-20T20:47:02Z (GMT). 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In recent years, a viral disease on melon plants becomes a serious problem in Brazil. Symptoms were principally yellowing and mottling on older leaves. Long filamentous virus particles, resembling those of carlaviruses, were seen in symptomatic leaves. In this study, the 3’ terminal region of the virus genome isolated from an infected plant, including the last five ORFs, was cloned and sequenced. The partial genomic region had 3137 nucleotides in length, including the region 3’UTR without counting Poly-A tail. The sequence revealed three new ORFs, those of exhibiting similarity to Carlavirus (Sweet potato chlorotic fleck virus) “triple gene block” (TGB). Two ORFs which were Melon yellowing-associated virus coat protein gene and potencial nucleic acid-binding protein gene were also analyzed by comparison with former reported sequence. The possible helicase domain were recognized in TGB 1 by domain research. The protein TGB 2 is possible cell-to-cell viral movement protein. The sequence analysis, the genome organization and the virus particle morphology indicated that the virus could be classified as a novel whitefly-transmitted flexivirus.
description Recentemente, uma doença viral em plantas de melão se tornou um sério problema para o Brasil. Os sintomas foram principalmente o amarelecimento e o mosqueado nas folhas mais velhas. Partículas virais longas e filamentosas, assemelhando-se às de Carlavirus, foram encontradas em folhas sintomáticas. Neste estudo a região terminal 3’ do genoma do isolado viral de uma planta infectada, incluindo os últimos cinco ORFs, foram clonados e seqüenciados. Uma parte da região do genoma tinha 3137 nucleotídeos, incluindo a região 3’ UTR sem contar com a cauda poli(A). A seqüência revelou três novos ORFs, exibindo similaridade ao “triple gene block” (TGB) do Carlavirus (Sweet potato chlorotic fleck virus). Dois ORFs, os quais eram associados ao gene viral da capa protéica e ao gene da “nucleic acid-binding protein” do vírus Melon yellowing-associated virus foram também analisados através de comparações com as seqüências anteriormente reportadas. O possível domínio da helicase foi reconhecido no domínio da proteína TGB 1 através da busca de domínio. A proteína TGB 2 é possivelmente a proteína associada ao movimento viral célula-a-célula. A análise das seqüências, a organização do genoma e a morfologia das partículas virais indicaram que o vírus pode ser classificado como um novo flexivirus transmitido por mosca-branca.
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