Avaliação da reação em cadeia da polimerase quantitativa na detecção de Mycobacterium leprae em casos de hanseníase de difícil diagnóstico

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Autor(a) principal: Lima, Maria Gláucia Silva de
Data de Publicação: 2015
Outros Autores: http://lattes.cnpq.br/9623092249527057
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM
Texto Completo: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7951
Resumo: A hanseníase é doença infecto-contagiosa causada pelo Mycobacterium leprae (M. leprae) que afeta principalmente a pele e nervos periféricos e pode causar incapacidades físicas as quais evoluem, potencialmente, para deformidades físicas permanentes. O paciente hanseniano pode ser classificado como paucibacilar e multibacilar, sendo as formas paucibacilares de difícil diagnóstico. Novos métodos moleculares de alta sensibilidade e especificidade como PCR em Tempo Real qPCR, tem contribuído para diagnóstico da hanseníase, principalmente nos casos de difícil diagnóstico. Este estudo foi desenvolvido na Fundação de Dermatologia Tropical e Venereologia Alfredo da Matta, Manaus – Amazonas, no período de março de 2014 a agosto de 2015, e teve o intuito de validar a técnica de qPCR na detecção de M. leprae em biópsias cutâneas de pacientes com suspeita clínica de hanseníase e submetidos a exame histopatológico. As amplificações por qPCR a partir de uma sequência específica do gene 16S de M. leprae foram realizadas em 180 amostras, das quais, 82 eram biópsias frescas e 98 biópsias parafinadas. Das biópsias frescas, foram analisadas 65 amostras, entre as quais estão 9 amostras de pacientes com outras dermatoses, 12 amostras clinicamente inconclusivas e 38 amostras de pacientes com hanseníase. Destes, 68,5% (26/38) foram positivos no teste molecular para a hanseníase e 33,3% (3/9) foram positivas para outras dermatoses. A sensibilidade foi de 68,5%, especificidade de 66,70%, com valor preditivo positivo de 89,7% e valor preditivo negativo de 33,3%. Entre as biópsias parafinadas, foram analisadas somente 61 amostras dos pacientes com hanseníase, as quais 73,8% foram positivas. Nestas amostras, o teste molecular apresentou sensibilidade de 73,8%. Além disso, o número de genomas foi estimado nos dois grupos de biópsias e variou de 8,53 (em uma biópsia parafinada) a 2.060.230 (em uma biópsia fresca). Os dados sugerem claramente que o qPCR confirmam a diferença entre pacientes MB e PB tanto em biópsias frescas quanto em biópsias parafinadas sendo que as quantidades de genomas percentualmente e quantitativamente foi maior em pacientes MB no grupo de amostras frescas quando comparado ao grupo de amostras parafinadas. Curiosamente, os dados quantitativos nas amostras de pacientes PB embora apresentem menor número de genomas, tem também um percentual maior de positividade. A despeito de ajustes necessários para melhorar a eficiência da reação, os resultados nos mostram que o teste pode ser útil, em especial nos casos inconclusivos e de difícil diagnóstico, como nas formas paucibacilares quando o número de genomas for alto (maior que 50) que diminui o risco de falsos positivos.
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Este estudo foi desenvolvido na Fundação de Dermatologia Tropical e Venereologia Alfredo da Matta, Manaus – Amazonas, no período de março de 2014 a agosto de 2015, e teve o intuito de validar a técnica de qPCR na detecção de M. leprae em biópsias cutâneas de pacientes com suspeita clínica de hanseníase e submetidos a exame histopatológico. As amplificações por qPCR a partir de uma sequência específica do gene 16S de M. leprae foram realizadas em 180 amostras, das quais, 82 eram biópsias frescas e 98 biópsias parafinadas. Das biópsias frescas, foram analisadas 65 amostras, entre as quais estão 9 amostras de pacientes com outras dermatoses, 12 amostras clinicamente inconclusivas e 38 amostras de pacientes com hanseníase. Destes, 68,5% (26/38) foram positivos no teste molecular para a hanseníase e 33,3% (3/9) foram positivas para outras dermatoses. A sensibilidade foi de 68,5%, especificidade de 66,70%, com valor preditivo positivo de 89,7% e valor preditivo negativo de 33,3%. Entre as biópsias parafinadas, foram analisadas somente 61 amostras dos pacientes com hanseníase, as quais 73,8% foram positivas. Nestas amostras, o teste molecular apresentou sensibilidade de 73,8%. Além disso, o número de genomas foi estimado nos dois grupos de biópsias e variou de 8,53 (em uma biópsia parafinada) a 2.060.230 (em uma biópsia fresca). Os dados sugerem claramente que o qPCR confirmam a diferença entre pacientes MB e PB tanto em biópsias frescas quanto em biópsias parafinadas sendo que as quantidades de genomas percentualmente e quantitativamente foi maior em pacientes MB no grupo de amostras frescas quando comparado ao grupo de amostras parafinadas. Curiosamente, os dados quantitativos nas amostras de pacientes PB embora apresentem menor número de genomas, tem também um percentual maior de positividade. A despeito de ajustes necessários para melhorar a eficiência da reação, os resultados nos mostram que o teste pode ser útil, em especial nos casos inconclusivos e de difícil diagnóstico, como nas formas paucibacilares quando o número de genomas for alto (maior que 50) que diminui o risco de falsos positivos.Leprosy is an infectious disease caused by Mycobacterium leprae (M. leprae) that affects the skin and peripheral nerves and can cause physical disabilities which evolve to permanent physical deformities. The leprosy patient can be classified as paucibacillary and multibacillary and paucibacillary forms difficult to diagnose. New molecular methods of high sensitivity and specificity as RT-PCR qPCR, has contributed to leprosy diagnosis, especially in cases of difficult diagnosis. This study was developed in Fundação de Dermatologia Tropical e Venereologia Alfredo da Matta, Manaus – Amazonas, from March 2014 to August 2015, and we aimed to validate the qPCR technique in the detection of M. leprae in skin biopsies patients with clinical suspicion of leprosy and subjected to histopathological examination. The qPCR amplifications from a specific sequence of the 16S gene from M. leprae were performed on 180 samples, of which 82 were fresh biopsies and 98 paraffin biopsies. From Fresh biopsies were analyzed 65 samples, of which 9 are samples of patients with other dermatoses, 12 clinically inconclusive samples and 38 samples from patients with leprosy. Of these, 68.5% (26/38) were positive in molecular test for leprosy and 33,3% (3/9) were positive for other dermatoses. The sensitivity was 68.5%, specificity of 66.70%, with positive predictive value of 89.7% and a negative predictive value of 33.3%. Among the paraffin biopsies were analyzed 61 samples from patients with leprosy, which 73.8% were positive. In these samples, the molecular test had a sensitivity of 73.8%. Furthermore, the number of genomes was estimated in both groups biopsies and ranged from 8.53 (paraffin in a biopsy) to 2,060,230 (on a fresh biopsy). This data suggest that the qPCR confirm the difference between patients MB and PB both fresh biopsies as for paraffin biopsies and the amounts of genomes percentage and quantity was greater in MB patients in the fresh specimens group compared to the group of paraffin samples. Interestingly, the figures in the samples of PB patients even though they have fewer genomes, also has a higher percentage of positivity. Despite adjustments to improve the reaction efficiency, the results show that the test can be useful, particularly in inconclusive cases and difficult diagnosis, as in Paucibacillary forms when the number of genomes is high (greater than 50) reduces the risk of false positives.CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorUniversidade Federal do AmazonasFaculdade de MedicinaBrasilUFAMPrograma de Pós-graduação em Ciências da SaúdeCortez, Carolina Chrusciak Talharihttp://lattes.cnpq.br/4041028384017266Frota, Maria Zeli Moreirahttp://lattes.cnpq.br/0827847750398440Ramasawmy, Rajendranathhttp://lattes.cnpq.br/3420417277915974Lima, Maria Gláucia Silva dehttp://lattes.cnpq.br/96230922495270572020-10-01T16:06:07Z2015-09-30info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisimage/jpegapplication/pdfLIMA, Maria Gláucia Silva de. Avaliação da reação em cadeia da polimerase quantitativa na detecção de Mycobacterium leprae em casos de hanseníase de difícil diagnóstico. 2015. 82 f. Dissertação (Mestrado em Ciências da Saúde) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2015.https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7951porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAMinstname:Universidade Federal do Amazonas (UFAM)instacron:UFAM2020-10-02T05:03:35Zoai:https://tede.ufam.edu.br/handle/:tede/7951Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://200.129.163.131:8080/PUBhttp://200.129.163.131:8080/oai/requestddbc@ufam.edu.br||ddbc@ufam.edu.bropendoar:65922020-10-02T05:03:35Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM - Universidade Federal do Amazonas (UFAM)false
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