Estudo da inibição da acetilcolinesterase por docking molecular e mfcc: Aplicação no tratamento de Alzheimer.

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: MEDEIROS FILHO, Francisco Carlos de.
Data de Publicação: 2020
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCG
Texto Completo: http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/16404
Resumo: A expectativa de vida do ser humano tem aumentado e as doenças relacionadas com a idade vêm se tornando evidentes, uma delas é a doença de Alzheimer, que é uma enfermidade neurodegenerativa, progressiva, sem cura até o momento, geralmente ocorre com pessoas acima dos 65 anos, é um tipo de demência, de declínio cognitivo crescente e irreversível e com múltiplos déficits cognitivos, dos quais um, obrigatoriamente, é a perda de memória. Esses sintomas são suficientemente intensos para causar impacto nas atividades diárias de uma pessoa. Quanto às possíveis causas da doença, ainda são desconhecidas, porém, os indícios mais comuns são: o avanço da idade e os fatores genéticos. Nesse sentido, o trabalho teve como objetivo geral investigar in silico as propriedades de interação de alguns inibidores, dentre eles: Tacrina, Donepezil, Rivastigmina, Galantamina, Fisostigmina e Memantina, com a Acetilcolinesterase. Para isso, metodologicamente, foi realizado o Docking Molecular e o Método de Fracionamento Molecular com Caps Conjugados (MFCC), considerando estruturas moleculares extraídas de bancos de dados certificados (DrugBank e Protein Data Bank). Dessa forma, realizou-se os cálculos quânticos e, através desses, foi possível proceder uma análise quantitativa, por meio ab initio. Diante disso, os resultados apontaram que todos os seis fármacos apresentaram atividade inibitória frente a Acetilcolenesterase (AChE), uma energia livre de ligação de todos os complexos foram expressivamente negativos, podendo afirmar que, de forma termodinâmica, os valores de gastos energéticos foram favoráveis. Por meio de estudos in silico, ou seja, através de métodos computacionais, a interação dos fármacos com a enzima AChE obtiveram resultados significativos de problemas farmacológicos relacionados à doença neurodegenerativa em estudo. Em virtude disso, a pesquisa é relevante, pois consiste em obter as melhores conformações de menor energia por meio do docking molecular e MFCC, que foram comprovadas por conceitos teóricos, físico-químicos e termodinâmicos.
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Quanto às possíveis causas da doença, ainda são desconhecidas, porém, os indícios mais comuns são: o avanço da idade e os fatores genéticos. Nesse sentido, o trabalho teve como objetivo geral investigar in silico as propriedades de interação de alguns inibidores, dentre eles: Tacrina, Donepezil, Rivastigmina, Galantamina, Fisostigmina e Memantina, com a Acetilcolinesterase. Para isso, metodologicamente, foi realizado o Docking Molecular e o Método de Fracionamento Molecular com Caps Conjugados (MFCC), considerando estruturas moleculares extraídas de bancos de dados certificados (DrugBank e Protein Data Bank). Dessa forma, realizou-se os cálculos quânticos e, através desses, foi possível proceder uma análise quantitativa, por meio ab initio. Diante disso, os resultados apontaram que todos os seis fármacos apresentaram atividade inibitória frente a Acetilcolenesterase (AChE), uma energia livre de ligação de todos os complexos foram expressivamente negativos, podendo afirmar que, de forma termodinâmica, os valores de gastos energéticos foram favoráveis. Por meio de estudos in silico, ou seja, através de métodos computacionais, a interação dos fármacos com a enzima AChE obtiveram resultados significativos de problemas farmacológicos relacionados à doença neurodegenerativa em estudo. Em virtude disso, a pesquisa é relevante, pois consiste em obter as melhores conformações de menor energia por meio do docking molecular e MFCC, que foram comprovadas por conceitos teóricos, físico-químicos e termodinâmicos.Life Human life expectancy has increased and age-related diseases are becoming evident, one of which is Alzheimer's disease, which is a progressive, neurodegenerative disease, with no cure so far, usually occurs with people over 65 years, it is a type of dementia, of increasing and irreversible cognitive decline and with multiple cognitive deficits, of which one, necessarily, is memory loss. These symptoms are severe enough to impact a person's daily activities. As for the possible causes of the disease, they are still unknown, however, the most common signs are: advancing age and genetic factors. In this sense, the work had as general objective to investigate in silico the interaction properties of some inhibitors, among them: Tacrine, Donepezil, Rivastigmine, Galantamine, Fisostigmine and Memantine, with Acetylcholinesterase. For this, methodologically, the Molecular Docking and the Fractionation Method Molecule with Conjugated Hoods (MFCC) were performed, considering molecular structures extracted from certified databases (DrugBank and Protein Data Bank). In this way, quantum calculations were performed and, through these, it was possible to carry out a quantitative analysis, through ab initio. In view of this, the results showed that all six drugs showed inhibitory activity against Acetylcholesteresterase (AChE), a free energy of binding of all complexes, which were expressively negative, which can affirm that, in a thermodynamic way, the values of energy expenditure were favorable. Through in silico studies, that is, through computational methods, the interaction of drugs with the AChE enzyme obtained significant results from pharmacological problems related to the neurodegenerative disease under study. As a result, the research is relevant, as it consists of obtaining the best conformations of lower energy through molecular docking and MFCC, which were proven by theoretical, physical-chemical and thermodynamic concepts.Submitted by Francisca Araujo (rosaguedes251@hotmail.com) on 2020-11-17T11:30:59Z No. of bitstreams: 1 FRANCISCO CARLOS DE MEDEIROS FILHO - DISSERTAÇÃO PPGNBio 2020.pdf: 6093822 bytes, checksum: b29f666623e8d12e34a0ac159e3d660f (MD5)Made available in DSpace on 2020-11-17T11:30:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 FRANCISCO CARLOS DE MEDEIROS FILHO - DISSERTAÇÃO PPGNBio 2020.pdf: 6093822 bytes, checksum: b29f666623e8d12e34a0ac159e3d660f (MD5) Previous issue date: 2020-11-10La esperanza de vida humana ha aumentado y se han hecho evidentes las enfermedades relacionadas con la edad, una de ellas es la enfermedad de Alzheimer, que es una enfermedad progresiva, neurodegenerativa, sin cura hasta el momento, por lo general se presenta en personas mayores de 65 años, es un tipo de demencia, con deterioro cognitivo creciente e irreversible y con múltiples déficits cognitivos, uno de los cuales, necesariamente, es la pérdida de memoria. Estos síntomas son lo suficientemente graves como para afectar las actividades diarias de una persona. En cuanto a las posibles causas de la enfermedad, aún se desconocen, sin embargo, los signos más comunes son: el avance de la edad y factores genéticos. En este sentido, el trabajo tuvo como objetivo investigar in silico las propiedades de interacción de algunos inhibidores, entre ellos: Tacrina, Donepezil, Rivastigmina, Galantamina, Fisostigmina y Memantina, con Acetilcolinesterasa. Para ello, metodológicamente se realizó el Molecular Docking y el Método de Fraccionamiento Molecular con Casquillos Conjugados (MFCC), considerando estructuras moleculares extraídas de bases de datos certificadas (DrugBank y Protein Data Bank). De esta manera, se realizaron los cálculos cuánticos y, a través de estos, se pudo realizar un análisis cuantitativo, ab initio. En vista de esto, los resultados mostraron que los seis fármacos mostraron actividad inhibitoria contra la Acetilcolenesterasa (AChE), una energía libre de unión de todos los complejos fueron expresivamente negativos, y se puede decir que, de manera termodinámica, los valores de energía los gastos fueron favorables. A través de estudios in silico, es decir, a través de métodos computacionales, la interacción de fármacos con la enzima AChE obtuvo resultados significativos de problemas farmacológicos relacionados con la enfermedad neurodegenerativa objeto de estudio. Como resultado, la investigación es relevante, ya que consiste en obtener las mejores conformaciones de menor energía mediante acoplamiento molecular y MFCC, las cuales han sido comprobadas mediante conceptos teóricos, físico-químicos y termodinámicos.Universidade Federal de Campina GrandePÓS-GRADUAÇÃO EM CIÊNCIAS NATURAIS E BIOTECNOLOGIAUFCGBrasilCentro de Educação e Saúde - CESGenéticaDoença do AlzheimerMétodos computacionaisInibidores da acetilcolinesteraseAlzheimer's diseaseComputational methodsAcetylcholinesterase inhibitorsEnfermedad de AlzheimerMétodos computacionalesInhibidores de la acetilcolinesterasaEstudo da inibição da acetilcolinesterase por docking molecular e mfcc: Aplicação no tratamento de Alzheimer.Study of acetylcholinesterase inhibition by molecular docking and mfcc: Application in the treatment of Alzheimer's.Estudio de inhibición de acetilcolinesterasa por acoplamiento molecular y mfcc: Aplicación en el tratamiento del Alzheimer.2020-11-102020-11-17T11:30:59Z2020-11-172020-11-17T11:30:59Zhttp://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/16404MEDEIROS FILHO, Francisco Carlos de. Estudo da inibição da acetilcolinesterase por docking molecular e mfcc: aplicação no tratamento do Azheimer. 2020. 147 fl. (Dissertação de Mestrado em Ciências Naturais e Biotecnologia), Programa de Pós-graduação em Ciências Naturais e Biotecnologia, Centro de Educação e Saúde, Universidade Federal Campina Grande - Cuité - Paraíba - Brasil, 2020.info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisporinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCGinstname:Universidade Federal de Campina Grande (UFCG)instacron:UFCGORIGINALFRANCISCO CARLOS DE MEDEIROS FILHO - DISSERTAÇÃO PPGNBio CES 2020.pdfFRANCISCO CARLOS DE MEDEIROS FILHO - DISSERTAÇÃO PPGNBio CES 2020.pdfapplication/pdf4313912http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/xmlui/bitstream/riufcg/16404/3/FRANCISCO+CARLOS+DE+MEDEIROS+FILHO+-+DISSERTA%C3%87%C3%83O+PPGNBio+CES+2020.pdfd62e2fcce89b470db9f968112e0c0bc0MD53LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/xmlui/bitstream/riufcg/16404/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52riufcg/164042022-08-04 11:39:52.539oai:localhost: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Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://bdtd.ufcg.edu.br/PUBhttp://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/oai/requestbdtd@setor.ufcg.edu.br || bdtd@setor.ufcg.edu.bropendoar:48512022-08-04T14:39:52Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCG - Universidade Federal de Campina Grande (UFCG)false
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