Avaliação de quatro protocolos de extração de DNAs em amostras teciduais cervicais infectadas pelo papilomavírus humano

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Cavarson, Carolina Harumi
Data de Publicação: 2017
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFGD
Texto Completo: http://repositorio.ufgd.edu.br/jspui/handle/prefix/3245
Resumo: O Papilomavírus Humano (HPV) é considerado uma infecção sexualmente transmissível, sendo um fator determinante para o desenvolvimento de câncer cervical. A metodologia de prevenção do câncer de colo de útero preconizada no Sistema Único de Saúde é a análise de alterações citológicas, conhecido popularmente como Papanicolaou. Entretanto o diagnóstico molecular vem sendo indicado como uma técnica mais sensível à presença do vírus, que pode estar inativo nas células hospedeiras, não estando necessariamente causando uma infecção, contudo tendo impacto na prevenção das alterações cancerígenas. Uma das técnicas moleculares capaz de detectar o HPV é a Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) sendo necessário primeiro extrair o DNA da amostra coletada, que impacta na sensibilidade da prova diagnóstica. Com o objetivo de padronizar a metodologia de melhor desempenho em fragmentos de tecidos, neste trabalho, comparamos quatro protocolos de extração de DNA total em biópsias tecidual cervical coletadas em mulheres apresentando alterações citológicas compatíveis com a infecção pelo HPV, na cidade de Dourados- MS, Brasil. Foram testados os protocolos 1) HotSHOT; 2) Wizard® Genomic DNA Purification Kit; 3) Boom; 4) Dnaesy Blood and Tissue Qiagen. As amostras extraídas foram submetidos a mensuração por espectrofotometria em microtitulação e amplificados pela reação em cadeia pela polimerase utilizando os oligonucleotídeos iniciadores GH20/PCO4 e Mucosal HPV. Dentre os protocolos testados, o protocolo que apresentou maior taxa absorbância 260/280, de até 4nm, e se apresentou mais eficiente tanto para o controle humano como para o diagnóstico do HPV durante a amplificação foi o protocolo Dnaeasy.
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A metodologia de prevenção do câncer de colo de útero preconizada no Sistema Único de Saúde é a análise de alterações citológicas, conhecido popularmente como Papanicolaou. Entretanto o diagnóstico molecular vem sendo indicado como uma técnica mais sensível à presença do vírus, que pode estar inativo nas células hospedeiras, não estando necessariamente causando uma infecção, contudo tendo impacto na prevenção das alterações cancerígenas. Uma das técnicas moleculares capaz de detectar o HPV é a Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) sendo necessário primeiro extrair o DNA da amostra coletada, que impacta na sensibilidade da prova diagnóstica. Com o objetivo de padronizar a metodologia de melhor desempenho em fragmentos de tecidos, neste trabalho, comparamos quatro protocolos de extração de DNA total em biópsias tecidual cervical coletadas em mulheres apresentando alterações citológicas compatíveis com a infecção pelo HPV, na cidade de Dourados- MS, Brasil. Foram testados os protocolos 1) HotSHOT; 2) Wizard® Genomic DNA Purification Kit; 3) Boom; 4) Dnaesy Blood and Tissue Qiagen. As amostras extraídas foram submetidos a mensuração por espectrofotometria em microtitulação e amplificados pela reação em cadeia pela polimerase utilizando os oligonucleotídeos iniciadores GH20/PCO4 e Mucosal HPV. Dentre os protocolos testados, o protocolo que apresentou maior taxa absorbância 260/280, de até 4nm, e se apresentou mais eficiente tanto para o controle humano como para o diagnóstico do HPV durante a amplificação foi o protocolo Dnaeasy.The Human Papillomavirus (HPV) is considered a sexually transmitted infection, being a determining factor for the development of cervical cancer. The prevention methodology of cervical cancer recommended by the Brazilian Unified Health System is the analysis of cytological alterations, popularly known as Papanicolau. However, the molecular diagnosis has been indicated as a technique more sensitive to the virus presence, which may be inactive in the host cells not necessarily causing an infection, yet having an impact in the prevention of the cancerous changes. One of the molecular techniques capable of detecting HPV is the Polymerase Chain Reaction (PCR). To do so, it is necessary to first extract the DNA from the collected sample, which impacts on the sensitivity of the diagnostic test. In order to standardize the methodology for better performance in tissue fragments, we compared four protocols for total DNA extraction in cervical tissue biopsies collected in women showing cytological alterations compatible with HPV infection in the city of Dourados-MS, Brazil. The following protocols were tested: 1) HotSHOT; 2) Wizard® Genomic DNA Purification Kit; 3) Boom; 4) Dnaesy Blood and Tissue Qiagen. The extracted samples were measured by spectrophotometry and amplified by the Polymerase Chain Reaction using the primers GH20 / PCO4 and Mucosal HPV. Among the protocols tested, the protocol which presented a higher 260/280 absorbance rate, up to 4nm, and was more efficient for both human control and HPV diagnosis during amplification was the Dnaeasy.Submitted by Alison Souza (alisonsouza@ufgd.edu.br) on 2020-06-09T12:40:28Z No. of bitstreams: 1 CarolinaHarumiCavarson.pdf: 707040 bytes, checksum: 922253158ced987676531e4875c63fcd (MD5)Made available in DSpace on 2020-06-09T12:40:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 CarolinaHarumiCavarson.pdf: 707040 bytes, checksum: 922253158ced987676531e4875c63fcd (MD5) Previous issue date: 2017-04-17Fundação de Apoio ao Desenvolvimento do Ensino, Ciência e Tecnologia do Estado de Mato Grosso do Sul (FUNDECT)porUniversidade Federal da Grande DouradosUFGDBrasilFaculdade de Ciências Biológicas e AmbientaisPapillomaviridaeCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICASInfecções por PapillomavirusPatologia molecularReação em Cadeia da PolimerasePapillomavirus InfectionsPathology, MolecularPolymerase Chain ReactionAvaliação de quatro protocolos de extração de DNAs em amostras teciduais cervicais infectadas pelo papilomavírus humanoinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFGDinstname:Universidade Federal da Grande Dourados (UFGD)instacron:UFGDTEXTCarolinaHarumiCavarson.pdf.txtCarolinaHarumiCavarson.pdf.txtExtracted texttext/plain31180https://repositorio.ufgd.edu.br/jspui/bitstream/prefix/3245/3/CarolinaHarumiCavarson.pdf.txt104f11b59324d3f6eddc29400f003456MD53LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81866https://repositorio.ufgd.edu.br/jspui/bitstream/prefix/3245/2/license.txt43cd690d6a359e86c1fe3d5b7cba0c9bMD52ORIGINALCarolinaHarumiCavarson.pdfCarolinaHarumiCavarson.pdfapplication/pdf707040https://repositorio.ufgd.edu.br/jspui/bitstream/prefix/3245/1/CarolinaHarumiCavarson.pdf922253158ced987676531e4875c63fcdMD51prefix/32452023-09-14 02:27:14.238oai:https://repositorio.ufgd.edu.br/jspui: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 Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://repositorio.ufgd.edu.br/jspui/PUBhttp://repositorio.ufgd.edu.br/oai/request?verb=ListRecords&metadataPrefix=oai_dcbiblioteca.csb@ufgd.edu.br||andersonpiassarollo@ufgd.edu.bropendoar:2023-09-14T06:27:14Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFGD - Universidade Federal da Grande Dourados (UFGD)false
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