Caracterização da estrutura genética da raça Guzerá (Bos indicus) através de genotipagem em escala genômica

• Autor(a) principal: Pablo Augusto de Souza Fonseca
• Data de Publicação: 2014
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFMG
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/1843/BUOS-B46LTW
• topic: Genética; Bovinos; Guzera (Zebu) Genetica; Variação genética

A indústria leiteira brasileira passou por um aumento significativo em sua produção na última década, atingindo uma produção anual de 32,30 bilhões de litros em 2012. Este aumento é explicado em parte pelo melhoramento genético dos rebanhos leiteiros submetidos a programas de seleção genética. Cerca de 80% de todo o rebanho brasileiro é constituído de animais zebuínos ou mestiços. A raça Guzerá se destaca entre as outras raças zebuínas devido a algumas importantes características como resistência a parasitas, como carrapatos, habilidade de consumir forragem bruta e resistência à temperatura. Entretanto, as estimativas de diversidade genética da raça Guzerá estão próximas do limiar em que é observada perda de variabilidade genética ocasionado pela deriva genética e depressão endogâmica. Até o momento, os estudos que visam estimar a variabilidade genética na raça Guzerá foram baseados em dados de pedigree, microssatélites e poucos SNPs, não permitindo uma estimativa em escala genômica da diversidade genética da raça. O desenvolvimento de chips de alta-densidade para genotipagem de SNPs para bovinos viabilizou os estudos de diversidade ou de associação em escala genômica. Estes métodos, em geral, assumem que a população em estudo é uma amostra homogênea. No entanto, as populações naturais estão ligadas em redes, devido ao fluxo gênico. Isto pode resultar em falsas representações da estrutura populacional e/ou associações espúrias, caso isto não seja corretamente verificado antes das análises. Assim, estratégias para reduzir o nível de parentesco em amostras, são fundamentais para evitar associações espúrias e conclusões errôneas. O presente trabalho é composto de dois estudos. No primeiro, foi avaliado o desempenho da plataforma Illumina Bovine SNP50 para a raça Guzerá e a aplicação de uma metodologia baseada análise de estatísticas de centralidade para a reamostragem de indivíduos baseado nos valores do coeficiente de Kinship. O segundo é composto pela análise de estrutura genética populacional da raça Guzerá através de genotipagem em escala genômica. Para isso, foram avaliados indivíduos provenientes de rebanhos pertencentes ao Programa Nacional de Melhoramento da raça Guzerá. A amostra utilizada no presente estudo representa a população mais selecionada e um dos maiores repositórios genéticos da raça Guzerá no Brasil. Os resultados destes estudos indicaram uma ótima aplicabilidade do algoritmo de seleção de nós baseados em graus de rede através de estatísticas de centralidade, mostrando-se mais eficiente para a detecção de alguns parâmetros de estimativas de diversidade genética como ROH e um número maior de indivíduos na amostra final quando comparado com outra estratégia de reamostragem. Além disso, o estudo da estrutura genética populacional da raça Guzerá indicou uma forte influência dos gargalos de garrafa e aumento da endogamia, sofridos pela raça durante o processo de estabelecimento da mesma no Brasil, na atual diversidade genética da raça. Estes resultados reforçam resultados já presentes na literatura que indicam a necessidade de um monitoramento da diversidade genética da raça através de critérios de diversidade populacional para garantir o sucesso dos programas de melhoramento