Genetic diversity and structure of Oenocarpus mapora germplasm conserved at eastern Amazon
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Data de Publicação: | 2015 |
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Título da fonte: | Repositório Institucional da UFPA |
Texto Completo: | http://repositorio.ufpa.br/jspui/handle/2011/7266 |
Resumo: | O estudo teve como objetivo avaliar a diversidade e a estruturação genética em germoplasma de Oenocarpus mapora conservado na Amazônia Oriental. Para isso, foram genotipados com cinco locos microssatélites 88 indivíduos pertencentes a 24 acessos conservados no Banco Ativo de Germoplasma (BAG) da Embrapa Amazônia Oriental e coletados em oito locais distintos de três estados da Amazônia brasileira. Todos os locos foram polimórficos, gerando 85 alelos e média de 17 alelos por loco. A diversidade genética total (HE) foi de 0,48. As áreas de coleta foram consideradas geneticamente distintas, com ?p = 0,354. A análise de variância molecular (AMOVA) identificou que a porção de variação genética entre as áreas foi de 36,14%, e dentro, de 63,86%. As distâncias de Nei variaram de 0,091, entre as áreas de coleta de Abaetetuba e Santo Antônio do Tauá, no Estado do Pará, a 4,18, entre as áreas de coleta de Parintins, no Amazonas e Rio Branco, no Acre. Estudo por meio de abordagem bayesiana identificou a existência de nove populações que compõem as amostras do BAG analisado, com diferentes distribuições entre as amostras. O estudo mostrou alta taxa de endogamia por área de coleta, indicando que pode haver significativas taxas de autofecundação ou cruzamento aparentado nessa espécie, sugerindo que as coletas de amostras devam ser feitas de diferentes plantas nas populações naturais. Mesmo assim, foi identificado que há considerável variação genética no germoplasma de O. mapora avaliado. |
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2017-01-10T16:44:21Z2017-01-10T16:44:21Z2015-12MOURA, Elisa Ferreira et al. Genetic diversity and structure of Oenocarpus mapora germplasm conserved at eastern Amazon. Revista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, v. 3, n. 4, p. 984-992, out./dez. 2015. Disponível em: <http://www.scielo.br/pdf/rbf/v37n4/0100-2945-rbf-37-4-984.pdf>. Acesso em: 10 jan. 2017. <http://dx.doi.org/10.1590/0100-2945-208/14>.1806-9967http://repositorio.ufpa.br/jspui/handle/2011/7266O estudo teve como objetivo avaliar a diversidade e a estruturação genética em germoplasma de Oenocarpus mapora conservado na Amazônia Oriental. Para isso, foram genotipados com cinco locos microssatélites 88 indivíduos pertencentes a 24 acessos conservados no Banco Ativo de Germoplasma (BAG) da Embrapa Amazônia Oriental e coletados em oito locais distintos de três estados da Amazônia brasileira. Todos os locos foram polimórficos, gerando 85 alelos e média de 17 alelos por loco. A diversidade genética total (HE) foi de 0,48. 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Mesmo assim, foi identificado que há considerável variação genética no germoplasma de O. mapora avaliado.The aim of this study was to evaluate the genetic diversity and structure in the germoplasm of Oenocarpus mapora conserved at Eastern Amazon. Thus, 88 individuals were genotyped with five microsatellite loci. These individuals belong to 24 accessions that were sampled in eight sample places of three Brazilian Amazon states conserved at the Active Germplasm Bank (AGB) of Embrapa Eastern Amazon. All loci were polymorphic and they generated 85 alleles with an average of 17 alleles per loci. Total genetic diversity (HE) was 0.48. Sample places were considered genetically distinct, with ?p = 0.354. The analysis of molecular variance (AMOVA) identified that the genetic portion among areas was of 36.14% and within 63.86%. The Nei distances varied from 0.091 between Abaetetuba and Santo Antônio do Tauá, both in the state of Pará (PA), to 4.18, between Parintins, AM and Rio Branco, AC. By means of Bayesian analysis, it was identified nine clusters that compose the accessions of the germplasm bank, with different distributions among individuals. The study showed high fixation rates per sample area, which indicates that there may have been significant inbreeding or crossing among parental individuals. It suggests that future samples should be made of different plants in natural populations. Even though, it was verified that there is considerable genetic variation in the germplasm of O. mapora.Submitted by Luciana Alcantara (lalcantara@ufpa.br) on 2017-01-10T16:44:02Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Artigo_GeneticDiversityStructure.pdf: 1358449 bytes, checksum: 80e352778fd952c2326e7323fb09ba3a (MD5)Approved for entry into archive by Luciana Alcantara (lalcantara@ufpa.br) on 2017-01-10T16:44:21Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Artigo_GeneticDiversityStructure.pdf: 1358449 bytes, checksum: 80e352778fd952c2326e7323fb09ba3a (MD5)Made available in DSpace on 2017-01-10T16:44:21Z (GMT). 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