Caracterização genômica de Salmonella enterica sorotipo Gallinarum biovares Gallinarum e Pullorum associadas a surtos de salmonelose aviária no Brasil
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2022 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFPB |
Texto Completo: | https://repositorio.ufpb.br/jspui/handle/123456789/29746 |
Resumo: | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum biovar Gallinarum (S. Gallinarum) e biovar Pullorum (S. Pullorum) are responsible for infecting mainly young birds causing high mortality leading to serious problems in the poultry industry worldwide. The objective of this work was to report the genomic sequences of S. Gallinarum 4295/02 and S. Pullorum 20811/12 isolated from laying hens in Brazil, and to evaluate the phylogenetic relationship of these bacterial isolates, as well as the presence of potential virulence factors. For this, the genomes were sequenced on an Illumina MiSeq platform. Multilocus sequence typing (MLST), and structural features related to the prediction of virulence genes were determined by bioinformatics analyses. These genomes were grouped into 34 and 36 contigs with 52.2% and 52.1% GC and belong to sequence type 78 (ST78) and 92 (ST92), respectively. 23 Salmonella virulence genes were identified (invA, spaO, spaQ, spaR, spaS , sptP , hilC , hilA , hilD , orgA , sifA , mgtB , mgtC , misL , sipB , sopB , lpfC , spvB, pipB, ssa , ssr , sse , e ssc ) present in the Pullorum biovar, while of these only the genes (sifA, mgtB, mgtC , misL , sopB , pipB , ssa , ssr , sse, and ssc ) were distributed in the Gallinarum biovar. Phylogenetic analysis of the biovars demonstrated distinct clades between S. Gallinarum and S. Pullorum strains suggesting evolutionary events with little evolutionary divergence between the strains The results indicate the occurrence of strains belonging to the studied biovars associated with outbreaks of fowl typhoid and pullorum disease circulating for decades in Brazil. Thus, these data can contribute both to a better characterization of these biovars and to studies on the pathogenicity of Salmonella as well as assisting in future investigations in epidemiological studies. |
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Caracterização genômica de Salmonella enterica sorotipo Gallinarum biovares Gallinarum e Pullorum associadas a surtos de salmonelose aviária no Brasiltifo aviáriopulorosesequenciamento do genoma completogenes de virulênciaanálise filogenéticaCNPQ::CIENCIAS AGRARIASSalmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum biovar Gallinarum (S. Gallinarum) e biovar Pullorum (S. Pullorum) are responsible for infecting mainly young birds causing high mortality leading to serious problems in the poultry industry worldwide. The objective of this work was to report the genomic sequences of S. Gallinarum 4295/02 and S. Pullorum 20811/12 isolated from laying hens in Brazil, and to evaluate the phylogenetic relationship of these bacterial isolates, as well as the presence of potential virulence factors. For this, the genomes were sequenced on an Illumina MiSeq platform. Multilocus sequence typing (MLST), and structural features related to the prediction of virulence genes were determined by bioinformatics analyses. These genomes were grouped into 34 and 36 contigs with 52.2% and 52.1% GC and belong to sequence type 78 (ST78) and 92 (ST92), respectively. 23 Salmonella virulence genes were identified (invA, spaO, spaQ, spaR, spaS , sptP , hilC , hilA , hilD , orgA , sifA , mgtB , mgtC , misL , sipB , sopB , lpfC , spvB, pipB, ssa , ssr , sse , e ssc ) present in the Pullorum biovar, while of these only the genes (sifA, mgtB, mgtC , misL , sopB , pipB , ssa , ssr , sse, and ssc ) were distributed in the Gallinarum biovar. Phylogenetic analysis of the biovars demonstrated distinct clades between S. Gallinarum and S. Pullorum strains suggesting evolutionary events with little evolutionary divergence between the strains The results indicate the occurrence of strains belonging to the studied biovars associated with outbreaks of fowl typhoid and pullorum disease circulating for decades in Brazil. Thus, these data can contribute both to a better characterization of these biovars and to studies on the pathogenicity of Salmonella as well as assisting in future investigations in epidemiological studies.Pró-Reitoria de Pós-graduação da UFPB (PRPG/UFPB)Salmonella enterica subsp. enterica sorovar Gallinarum biovar Gallinarum (Salmonella Gallinarum) e biovar Pullorum (Salmonella Pullorum) são responsáveis por infectar principalmente aves jovens causando alta mortalidade levando a sérios problemas na avicultura mundial. O objetivo deste trabalho foi relatar as sequências genômicas de S. Gallinarum 4295/02 e S. Pullorum 20811/12 isoladas de galinhas poedeiras no Brasil, e avaliar a relação filogenética desses isolados bacterianos, bem como a presença de potenciais fatores de virulência. Para isso, os genomas foram sequenciados em plataforma Illumina MiSeq. A tipagem de sequência multilocus (MLST) e as características estruturais relacionadas à predição de genes de virulência foram determinadas por análises de bioinformática. Esses genomas foram agrupados em 34 e 36 contigs com 52,2% e 52,1% de GC e pertencem à sequência tipo 78 (ST78) e 92 (ST92), respectivamente. Foram identificados 23 genes de virulência de Salmonella (invA, spaO, spaQ , spaR, spaS , sptP , hilC , hilA , hilD , orgA , sifA, mgtB , mgtC , misL , sipB , sopB , lpfC , spvB, pipB, ssa , ssr , sse , e ssc ) presentes no biovar Pullorum, enquanto que destes apenas os genes (sifA, mgtB, mgtC , misL , sopB , pipB , ssa , ssr , sse e ssc ), foram distribuídos no biovar Gallinarum. A análise filogenética dos biovares demonstrou clados distintos entre as cepas S. Gallinarum e S. Pullorum sugerindo eventos evolutivos com pouca divergência evolutiva entre as cepas. Os resultados indicam a ocorrência de cepas pertencentes aos biovares estudados associadas a surtos de Febre Tifoide e Pulorose circulando há décadas no Brasil. Assim, esses dados podem contribuir tanto para uma melhor caracterização desses biovares quanto para estudos sobre a patogenicidade de Salmonella, bem como auxiliar em futuras investigações em estudos epidemiológicos.Universidade Federal da ParaíbaBrasilZootecniaPrograma de Pós-Graduação em Ciência AnimalUFPBOliveira, Celso José Bruno dehttp://lattes.cnpq.br/1085810832851989Leite, Elma Limahttp://lattes.cnpq.br/3583728132050401Oliveira, Francisco de Assis de2024-03-05T13:58:18Z2022-06-272024-03-05T13:58:18Z2022-02-23info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesishttps://repositorio.ufpb.br/jspui/handle/123456789/29746porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFPBinstname:Universidade Federal da Paraíba (UFPB)instacron:UFPB2024-03-06T06:07:38Zoai:repositorio.ufpb.br:123456789/29746Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://repositorio.ufpb.br/PUBhttp://tede.biblioteca.ufpb.br:8080/oai/requestdiretoria@ufpb.br|| diretoria@ufpb.bropendoar:2024-03-06T06:07:38Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFPB - Universidade Federal da Paraíba (UFPB)false |
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