Caracterização estrutural e expressão diferencial de TLPs (Thaumatin-Like Proteins) em duas leguminosas da Caatinga sob estresses abióticos

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: ALVES, Maria Cidinaria Silva
Data de Publicação: 2021
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPE
Texto Completo: https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/44740
Resumo: A seca e a salinidade estão entre os fatores de estresse que mais impactam o crescimento e o desenvolvimento das plantas, alterando a dinâmica dos ecossistemas naturais, a diversidade genética e diminuindo a produtividade agrícola. Além disso, os danos causados por esses estresses tendem a ser acentuados devido às mudanças climáticas globais. Tal cenário destaca a importância de estudos envolvendo espécies adaptadas a tais condições, como as leguminosas Cenostigma pyramidale e Stylosanthes scabra. São espécies com grande potencial na prospecção e análise de genes relacionados à tolerância a estresses abióticos. Proteínas semelhantes às taumatinas (TLPs) estão envolvidas tanto no processo de desenvolvimento como também na resposta da planta a estresses bióticos e abióticos. No presente estudo, nós identificamos, caracterizamos estruturalmente e verificamos o perfil transcricional de genes que codificam TLPs no transcriptoma dessas espécies em resposta a dois tipos de estresse: (a) C. pyramidale sob imposição de salinidade (30 min, 2 h e 11 dias após a imposição do estresse) e (b) S scabra 6, 24, 48 h após a supressão de rega e após 6 h de reidratação, inferindo sobre a diversidade genética, características funcionais e padrões de expressão em ambas as espécies. A análise in silico permitiu a identificação de 100 TLPs, sendo 36 e 64 TLPs nos transcriptomas radiculares de C. pyramidale e S. scabra, respectivamente. As sequências candidatas (para ambas as espécies) mostraram similaridade significativa com as TLPs descritas em outras espécies. A análise de expressão via PCR quantitativa em tempo real (RT-qPCR) revelou tendências de expressão distintas para as duas espécies, bem como entre os tecidos avaliados (folha e raiz). No entanto, a superexpressão de algumas TLPs pode estar associada com a tolerância de C. pyramidale à salinidade e a tolerância de S. scabra à restrição de água. As TLPs caracterizadas e diferencialmente expressas nas espécies estudadas representam candidatos promissores para uso biotecnológico e o melhoramento de plantas, com ênfase para leguminosas. visando à obtenção de plantas mais tolerantes à seca e salinidade.
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Tal cenário destaca a importância de estudos envolvendo espécies adaptadas a tais condições, como as leguminosas Cenostigma pyramidale e Stylosanthes scabra. São espécies com grande potencial na prospecção e análise de genes relacionados à tolerância a estresses abióticos. Proteínas semelhantes às taumatinas (TLPs) estão envolvidas tanto no processo de desenvolvimento como também na resposta da planta a estresses bióticos e abióticos. No presente estudo, nós identificamos, caracterizamos estruturalmente e verificamos o perfil transcricional de genes que codificam TLPs no transcriptoma dessas espécies em resposta a dois tipos de estresse: (a) C. pyramidale sob imposição de salinidade (30 min, 2 h e 11 dias após a imposição do estresse) e (b) S scabra 6, 24, 48 h após a supressão de rega e após 6 h de reidratação, inferindo sobre a diversidade genética, características funcionais e padrões de expressão em ambas as espécies. A análise in silico permitiu a identificação de 100 TLPs, sendo 36 e 64 TLPs nos transcriptomas radiculares de C. pyramidale e S. scabra, respectivamente. As sequências candidatas (para ambas as espécies) mostraram similaridade significativa com as TLPs descritas em outras espécies. A análise de expressão via PCR quantitativa em tempo real (RT-qPCR) revelou tendências de expressão distintas para as duas espécies, bem como entre os tecidos avaliados (folha e raiz). No entanto, a superexpressão de algumas TLPs pode estar associada com a tolerância de C. pyramidale à salinidade e a tolerância de S. scabra à restrição de água. As TLPs caracterizadas e diferencialmente expressas nas espécies estudadas representam candidatos promissores para uso biotecnológico e o melhoramento de plantas, com ênfase para leguminosas. visando à obtenção de plantas mais tolerantes à seca e salinidade.CAPESDrought and salinity are among the stress factors that most impact plant growth and development, changing the dynamics of natural ecosystems, genetic diversity and decreasing agricultural productivity. Additionally, the damage caused by these stresses tends to be accentuated due to global climate change. This scenario highlights the importance of studies involving species adapted to such conditions, such as the legume Cenostigma pyramidale and Stylosanthes scabra. They are species with great potential in prospecting and analyzing genes related to tolerance to abiotic stresses. Thaumatin-like proteins (TLPs) are involved both in the development process and in the plant's response to biotic and abiotic stresses. In the present study, we identified, structurally characterized and verified the transcriptional profile of genes encoding TLPs in the transcriptome of these species in response to two types of stress: (a) C. pyramidale under salinity imposition (30 min, 2 h and 11 days after the imposition of stress) and (b) S. scabra 6, 24, 48 h after watering suppression and after 6 h of rehydration, inferring on the genetic diversity, functional characteristics and expression patterns in both species. The in silico analysis allowed the identification of 100 TLPs, being 36 and 64 TLPs in the roots transcriptomes of C. pyramidale and S. scabra, respectively. Candidate sequences (for both species) showed significant similarity to TLPs described in other species. Expression analysis via quantitative real-time PCR (RT-qPCR) revealed distinct expression trends for the two species, as well as between the tissues evaluated (leaf and root). However, overexpression of some TLPs may be associated with tolerance of C. pyramidale to salinity and tolerance of S. scabra to water restriction. The TLPs characterized and differentially expressed in the studied species represent promising candidates for biotechnological use and plant improvement, with emphasis on legumes, aiming to obtain plants that are more tolerant to drought and salinity.porUniversidade Federal de PernambucoPrograma de Pos Graduacao em Ciencias BiologicasUFPEBrasilAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/embargoedAccessGenética vegetalExpressão gênicaPlantas – Efeito da secaCaracterização estrutural e expressão diferencial de TLPs (Thaumatin-Like Proteins) em duas leguminosas da Caatinga sob estresses abióticosinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesismestradoreponame:Repositório Institucional da UFPEinstname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)instacron:UFPEORIGINALDISSERTAÇÃO Maria Cidinaria Silva Alves.pdfDISSERTAÇÃO Maria Cidinaria Silva Alves.pdfapplication/pdf7329467https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/44740/1/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Maria%20Cidinaria%20Silva%20Alves.pdf72125c961de24feb46afc2bc62f9eaaaMD51CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; 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