Ureases : uma análise comparativa

• Autor(a) principal: Braun, Rodrigo Ligabue
• Data de Publicação: 2008
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFRGS
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/171303
• topic: Urease; Canavalia ensiformis; Filogenia; Modelagem molecular; Ureases; Comparative molecular modeling; Phylogeny

Ureases (EC 3.5.1.5) são enzimas níquel-dependentes que catalisam a hidrólise da uréia em amônia e dióxido de carbono. São amplamente distribuídas em plantas, fungos e bactérias. Em plantas e fungos, as ureases são homopolímeros de subunidades contendo cerca de 840 resíduos de aminoácidos, formando hexâmeros ou trímeros. Em bactérias, as ureases possuem duas ou três subunidades menores, que se alinham na cadeia polipeptídica única das ureases vegetais, com as quais tem 50-60% de identidade de sequência. Para ter-se uma visão geral das relações que podem ser estabelecidas entre as ureases, buscando padrões, similaridades e diferenças que possam auxiliar na análise e predição dos resultados experimentais, foi realizada uma ampla análise das sequências de nucleotídeos e aminoácidos de ureases. Após busca, extração, interpretação e edição destas, árvores filogenéticas foram construídas. Por meio de alinhamentos de sequência múltiplos, a grande similaridade entre as sequências oriundas de plantas e fungos foi confirmada, e permitiu a análise das regiões de conservação proximas ao sitio ativo, alem da verificação da conservação de todos os resíduos de aminoácidos considerados essenciais para atividade catalítica da enzima. Diferenças foram encontradas nas regiões correspondentes ao peptídeo entomotóxico originalmente descrito para a urease de Canavalia ensiformis L. (feijao-de-porco). Como as estruturas de ureases de plantas e fungos não foram ainda determinadas, um modelo de urease de C. ensiformis foi construído por modelagem molecular comparativa, utilizando como molde uma estrutura de urease bacteriana. O modelo foi avaliado e utilizado para determinar a localização espacial do peptídeo entomotóxico e dos resíduos essenciais para a catálise.