Caracterização de metaloproteases GP63 de Trypanosoma rangeli

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Pereira, Caibe Alves
Data de Publicação: 2019
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFSC
Texto Completo: https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/215568
Resumo: Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biociências, Florianópolis, 2019.
id UFSC_5fe48dd25ccd9f4ee4705651449e2364
oai_identifier_str oai:repositorio.ufsc.br:123456789/215568
network_acronym_str UFSC
network_name_str Repositório Institucional da UFSC
repository_id_str 2373
spelling Universidade Federal de Santa CatarinaPereira, Caibe AlvesStoco, Patrícia Hermes2020-10-21T21:18:03Z2020-10-21T21:18:03Z2019364360https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/215568Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biociências, Florianópolis, 2019.Trypanosoma rangeli é um parasito da família Trypanosomatidae, e tem como hospedeiros diferentes espécies de mamíferos e triatomíneos em comum com o Trypanosoma cruzi, agente etiológico da Doença de Chagas. Esses parasitos possuem grande semelhança gênica e proteica, o que pode dificultar o diagnóstico da Doença de Chagas e gerar resultados falso-positivos. Entre as proteínas com alta similaridade compartilhadas entre esses parasitos está a GP63, uma metaloprotease pertencente ao grupo das metzincinas encontrada predominantemente na superfície dos parasitos. A GP63 de T. rangeli pode ser classificada em três grupos, que possuem diferenças principalmente na região do sítio catalítico, sugerindo diferenças na atividade desta enzima. Para melhor entender essas diferenças o objetivo deste trabalho foi caracterizar os diferentes grupos de GP63 de T. rangeli. Para isto foi realizada uma busca dos membros de GP63 no genoma de T. rangeli, por três diferentes abordagens, encontrando-se 131 sequências completas, sendo 109 de GP63_1, 18 de GP63_2 e 4 de GP63_3. Realizando uma análise filogenética das sequências observou-se que os membros de GP63_2 são agrupados em um mesmo clado, bem como para GP63_3. De modo esperado, a análise de conservação dos resíduos de aminoácidos relacionados ao motivo mostrou que os membros da GP63_1 são mais divergentes. Foi realizada a predição da localização celular e observou-se que 30 destas provavelmente possuem endereçamento para localização na superfície do parasito. A análise do transcritoma de T. rangeli mostrou que membros de GP63 possuem transcrição diferencial, dependendo da forma evolutiva em que o parasito se encontra. Além disso, os três diferentes grupos de GP63 foram encontradas no secretoma de formas de cultura de epi e tripomastigotas de T. rangeli. Foi realizado também a modelagem tridimensional de um membro de cada grupo, observando que as diferenças no motivo podem resultar em diferenças na atividade catalítica destas proteínas. Por fim, foram realizadas clonagens em vetor de expressão e transfecção de parasitos para melhor entender a função dos diferentes grupos de GP63 de Trypanosoma rangeli.<br>Abstract : Trypanosoma rangeli is a parasite that belongs to the Trypanosomatidae family. Its hosts are different species of mammals and triatomines in common with Trypanosoma cruzi, etiological agent of Chagas Disease. These parasites share high genic and protein resemblance and it can complicate the Chagas Disease diagnostic with false-positives results. Among the high similar protein, it is the GP63, a metalloprotease that belongs to the metzincin group, found mainly in the parasites surface. The T. rangeli GP63 can be classified into three groups, which have differences mainly on the catalytic site region, suggesting different enzyme activity. In order to better understand those differences, the goal of this study was to characterize the different GP63 groups of T. rangeli. To reach this goal, it was performed a search for GP63 members on the T. rangeli genome by three different approaches, finding 131 complete sequences, in which 109 are GP63_1, 18 are GP63_2 and 4 are GP63_3. By a phylogenetic analysis of the sequences it was seen that the members of GP63_2 are grouped in the same clade, as well as the GP63_3 members. As expected, an analysis of the conserved amino acids residues related to the motif showed that the GP63_1 members are the most divergent. By the cellular localization prediction, it was observed that 30 of the proteins have a probable surface localization. The transcriptome analysis of T. rangeli showed that different GP63 have a differential transcription, regarding the evolution form of the parasite. Besides, the three groups were found on the secretome of culture epimastigotes and trypomastigotes of T. rangeli. It was done the tridimensional of one member of each group, observing that the differences on the motif can result in catalytic activity differences of these enzyme. Lastly, transfections of expression vectors cloned were done to better understand the function of the different groups of GP63 of Trypanosoma rangeli.83 p.| il., gráfs.porBiotecnologiaTrypanosoma rangeliCaracterização de metaloproteases GP63 de Trypanosoma rangeliinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisreponame:Repositório Institucional da UFSCinstname:Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)instacron:UFSCinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALPBTC0303-D.pdfPBTC0303-D.pdfapplication/pdf2500273https://repositorio.ufsc.br/bitstream/123456789/215568/-1/PBTC0303-D.pdf1ced0d0309c61d72263af9b5042a064aMD5-1123456789/2155682020-10-21 18:18:03.572oai:repositorio.ufsc.br:123456789/215568Repositório de PublicaçõesPUBhttp://150.162.242.35/oai/requestopendoar:23732020-10-21T21:18:03Repositório Institucional da UFSC - Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)false
dc.title.none.fl_str_mv Caracterização de metaloproteases GP63 de Trypanosoma rangeli
title Caracterização de metaloproteases GP63 de Trypanosoma rangeli
spellingShingle Caracterização de metaloproteases GP63 de Trypanosoma rangeli
Pereira, Caibe Alves
Biotecnologia
Trypanosoma rangeli
title_short Caracterização de metaloproteases GP63 de Trypanosoma rangeli
title_full Caracterização de metaloproteases GP63 de Trypanosoma rangeli
title_fullStr Caracterização de metaloproteases GP63 de Trypanosoma rangeli
title_full_unstemmed Caracterização de metaloproteases GP63 de Trypanosoma rangeli
title_sort Caracterização de metaloproteases GP63 de Trypanosoma rangeli
author Pereira, Caibe Alves
author_facet Pereira, Caibe Alves
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Universidade Federal de Santa Catarina
dc.contributor.author.fl_str_mv Pereira, Caibe Alves
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Stoco, Patrícia Hermes
contributor_str_mv Stoco, Patrícia Hermes
dc.subject.classification.none.fl_str_mv Biotecnologia
Trypanosoma rangeli
topic Biotecnologia
Trypanosoma rangeli
description Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biociências, Florianópolis, 2019.
publishDate 2019
dc.date.issued.fl_str_mv 2019
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2020-10-21T21:18:03Z
dc.date.available.fl_str_mv 2020-10-21T21:18:03Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/215568
dc.identifier.other.none.fl_str_mv 364360
identifier_str_mv 364360
url https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/215568
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 83 p.| il., gráfs.
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFSC
instname:Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)
instacron:UFSC
instname_str Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)
instacron_str UFSC
institution UFSC
reponame_str Repositório Institucional da UFSC
collection Repositório Institucional da UFSC
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufsc.br/bitstream/123456789/215568/-1/PBTC0303-D.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv 1ced0d0309c61d72263af9b5042a064a
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFSC - Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1766805025057669120

Registros relacionados