Análise das técnicas de microarranjos e RNAseq através da ontologia ontocancro
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2013 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do UFSM |
Texto Completo: | http://repositorio.ufsm.br/handle/1/5419 |
Resumo: | The research on molecular interactions which cause genetic diseases has been the focus of many studies in recent years. With the inclusion of informatics in biological research, there was a great advance in the discovery of new solutions and diagnostic techniques for the treatment of diseases. Cancer is one of the diseases that have caused more interest among scientists around the world, and between their variations, are those caused by genetic defects that affect the genome maintenance mechanisms (GMM), which promote the proper functioning of the organism of an individual. Halazonetis and colaborators (2008) published a study involving of the metabolic pathways GMM, which identifies the appearance of a barrier that prevents the spread of cancer, but it is broken by initiating uncontrolled reproduction of defective cells that cause the cancerous tumors. The motivation of this work is to investigate the process of activation of anticancer barrier, using quantitative methods to analysis of the expression of genes and pathways. For this reason, it was used the Ontocancro ontology as analysis tool, being made several changes in its architecture for the realization of this study. |
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2014-09-222014-09-222013-09-11NASCIMENTO, Karlise Soares. ANALYSIS OF TECHNICAL AND MICROARRAY AND RNASEQ THROUGH ONTOCANCRO ONTOLOGY. 2013. 85 f. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Santa Maria, Santa Maria, 2013.http://repositorio.ufsm.br/handle/1/5419The research on molecular interactions which cause genetic diseases has been the focus of many studies in recent years. With the inclusion of informatics in biological research, there was a great advance in the discovery of new solutions and diagnostic techniques for the treatment of diseases. Cancer is one of the diseases that have caused more interest among scientists around the world, and between their variations, are those caused by genetic defects that affect the genome maintenance mechanisms (GMM), which promote the proper functioning of the organism of an individual. Halazonetis and colaborators (2008) published a study involving of the metabolic pathways GMM, which identifies the appearance of a barrier that prevents the spread of cancer, but it is broken by initiating uncontrolled reproduction of defective cells that cause the cancerous tumors. The motivation of this work is to investigate the process of activation of anticancer barrier, using quantitative methods to analysis of the expression of genes and pathways. For this reason, it was used the Ontocancro ontology as analysis tool, being made several changes in its architecture for the realization of this study.A investigação sobre as interações moleculares, que causam doenças genéticas têm sido foco de muitos estudos nos últimos anos. Com a inclusão da informática em pesquisas biológicas, houve um grande avanço na descoberta de novas soluções e técnicas de diagnósticos para o tratamentos de doenças. O câncer é uma das doenças que mais tem causado interesse entre cientistas do mundo inteiro, e entre suas variações, estão aquelas causadas por defeitos genéticos que afetam os mecanismos de manutenção do genoma (GMM), que promovem o bom funcionamento do organismo de um indivíduo. Halazonetis e colaboradores, em 2008, publicou um estudo envolvendo as vias metabólicas GMM, que identifica o surgimento de uma barreira que evita a propagação do câncer, mas é rompida dando início a reprodução descontrolada de células defeituosas que causam os tumores cancerígenos. A motivação desta dissertação consiste em investigar o processo de ativação da barreira anticâncer, usando métodos quantitativos para análise da expressão de genes e vias. Para isso, utilizou-se a ontologia Ontocancro como ferramenta de análise, sendo efetuadas diversas alterações em sua arquitetura para a realização deste estudo.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superiorapplication/pdfporUniversidade Federal de Santa MariaPrograma de Pós-Graduação em InformáticaUFSMBRCiência da ComputaçãoOntologiaCâncerRNAseqMicroarranjosOntologyCancerRNAseqMicroarraysCNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAOAnálise das técnicas de microarranjos e RNAseq através da ontologia ontocancroAnalysis of technical and microarray and RNAseq through ontocancro ontologyinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisLibrelotto, Giovani Ruberthttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4707017Z0Saccol, Deise de Brumhttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4701597U0Silva, Luís Alvaro de Limahttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4728273Z9http://lattes.cnpq.br/6702586607871869Nascimento, Karlise Soares10030000000740030030030030080e07393-0dd8-4aec-b0d4-7bbfa5881f1eb90b158a-57ee-448d-a705-965db91af411cd8bdcfe-ef4c-4dd8-b03a-d9b36c88884b34d7f124-0151-4dbb-8392-c5c83e0dc8f1info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do UFSMinstname:Universidade Federal de Santa Maria (UFSM)instacron:UFSMORIGINALNASCIMENTO, KARLISE SOARES.pdfapplication/pdf25477601http://repositorio.ufsm.br/bitstream/1/5419/1/NASCIMENTO%2c%20KARLISE%20SOARES.pdfb707a4dda1798e1e15b0f5ef981f7d04MD51TEXTNASCIMENTO, KARLISE SOARES.pdf.txtNASCIMENTO, KARLISE SOARES.pdf.txtExtracted texttext/plain130933http://repositorio.ufsm.br/bitstream/1/5419/2/NASCIMENTO%2c%20KARLISE%20SOARES.pdf.txt30df119a829b3ca8afa515939d1f428eMD52THUMBNAILNASCIMENTO, KARLISE SOARES.pdf.jpgNASCIMENTO, KARLISE SOARES.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg5074http://repositorio.ufsm.br/bitstream/1/5419/3/NASCIMENTO%2c%20KARLISE%20SOARES.pdf.jpgb31c8723e47c82259f6df39d4a0dde04MD531/54192023-06-14 11:04:25.778oai:repositorio.ufsm.br:1/5419Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://repositorio.ufsm.br/ONGhttps://repositorio.ufsm.br/oai/requestatendimento.sib@ufsm.br||tedebc@gmail.comopendoar:2023-06-14T14:04:25Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do UFSM - Universidade Federal de Santa Maria (UFSM)false |
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