Análise da variabilidade genômica de SARS-CoV-2 circulantes no estado de Minas Gerais

• Autor(a) principal: Ferreira, Giulia Magalhães
• Data de Publicação: 2020
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFU
• Texto Completo: https://repositorio.ufu.br/handle/123456789/30155; http://doi.org/10.14393/ufu.di.2020.661
• topic: CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA MOLECULAR E DE MICROORGANISMOS; SARS-CoV-2; COVID-19; Genomic surveillance; Minas Gerais; Genome sequence; B1 lineage; vigilância genômica; Sequenciamento genômico; Linhagem B1; Imunologia

O coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (SARS-CoV-2) foi identificado pela primeira vez em Wuhan-China, como o agente causador da doença do coronavírus 2019 (COVID-19). Desde o surgimento do primeiro caso em São Paulo, em 26 de fevereiro de 2020, mais de 3.000.000 de casos e 106.000 mortes foram notificados no Brasil. Na fase inicial da epidemia, o SARS-CoV-2 se espalhou localmente, no entanto, com o tempo, esse vírus se disseminou para outras regiões do país. Neste estudo, o sequenciamento do genoma do SARS-CoV-2 e análises filogenéticas foram realizados a partir de sequencias obtidas do processamento de 20 amostras clínicas com diagnóstico para COVID-19, provenientes de 9 cidades de MG, a fim de avaliar a caracterização genética das variantes virais circulantes no estado, de março a maio de 2020. As análises demonstraram a circulação da linhagem B.1 nos locais investigados e substituições nucleotídicas foram observadas nas regiões genômicas relacionadas a importantes estruturas virais. Além disso, as sequências geradas neste estudo agrupam filogeneticamente com isolados do estado de São Paulo, sugerindo uma rota de transmissão entre esses 2 estados. Alternativamente, grupos monofiléticos de sequências de MG e de outros estados ou país foram observados, indicando eventos de introdução independente do vírus. Esses resultados reforçam a necessidade de vigilância genômica para o entendimento da atual propagação de patógenos virais emergentes