Random regression models to estimate genetic parameters for milk production of Guzerat cows using orthogonal Legendre polynomials
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Data de Publicação: | 2014 |
Outros Autores: | , , , , |
Tipo de documento: | Artigo |
Idioma: | eng |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UNESP |
Texto Completo: | http://dx.doi.org/10.1590/S0100-204X2014000500007 http://hdl.handle.net/11449/114575 |
Resumo: | The objective of this work was to compare random regression models for the estimation of genetic parameters for Guzerat milk production, using orthogonal Legendre polynomials. Records (20,524) of test-day milk yield (TDMY) from 2,816 first-lactation Guzerat cows were used. TDMY grouped into 10-monthly classes were analyzed for additive genetic effect and for environmental and residual permanent effects (random effects), whereas the contemporary group, calving age (linear and quadratic effects) and mean lactation curve were analized as fixed effects. Trajectories for the additive genetic and permanent environmental effects were modeled by means of a covariance function employing orthogonal Legendre polynomials ranging from the second to the fifth order. Residual variances were considered in one, four, six, or ten variance classes. The best model had six residual variance classes. The heritability estimates for the TDMY records varied from 0.19 to 0.32. The random regression model that used a second-order Legendre polynomial for the additive genetic effect, and a fifth-order polynomial for the permanent environmental effect is adequate for comparison by the main employed criteria. The model with a second-order Legendre polynomial for the additive genetic effect, and that with a fourth-order for the permanent environmental effect could also be employed in these analyses. |
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Random regression models to estimate genetic parameters for milk production of Guzerat cows using orthogonal Legendre polynomialsModelos de regressão aleatória para estimação de parâmetros genéticos para produção de leite da raça Guzerá com uso de polinômios ortogonais de LegendreBos indicusfunções de covariânciacurva de lactaçãomodelos de dia do controleBos indicuscovariance functionslactation curvetest-day modelThe objective of this work was to compare random regression models for the estimation of genetic parameters for Guzerat milk production, using orthogonal Legendre polynomials. Records (20,524) of test-day milk yield (TDMY) from 2,816 first-lactation Guzerat cows were used. TDMY grouped into 10-monthly classes were analyzed for additive genetic effect and for environmental and residual permanent effects (random effects), whereas the contemporary group, calving age (linear and quadratic effects) and mean lactation curve were analized as fixed effects. Trajectories for the additive genetic and permanent environmental effects were modeled by means of a covariance function employing orthogonal Legendre polynomials ranging from the second to the fifth order. Residual variances were considered in one, four, six, or ten variance classes. The best model had six residual variance classes. The heritability estimates for the TDMY records varied from 0.19 to 0.32. The random regression model that used a second-order Legendre polynomial for the additive genetic effect, and a fifth-order polynomial for the permanent environmental effect is adequate for comparison by the main employed criteria. The model with a second-order Legendre polynomial for the additive genetic effect, and that with a fourth-order for the permanent environmental effect could also be employed in these analyses.O objetivo deste trabalho foi comparar modelos de regressão aleatória para a estimação de parâmetros genéticos da produção de leite de Guzerá, com uso dos polinômios ortogonais de Legendre. Foram utilizados 20.524 registros da produção de leite no dia do controle (PLDC) de 2.816 vacas da raça Guzerá em primeira lactação. Agrupadas em 10 classes mensais, as PLDC foram analisadas quanto aos efeitos genéticos aditivos, e aos de ambiente permanente e residual (efeitos aleatórios); enquanto efeitos de grupo de contemporâneos, covariável idade da vaca ao parto (efeito linear e quadrático) e a curva média de lactação foram analisados como efeitos fixos. Trajetórias quanto aos efeitos aditivos genéticos e de ambiente permanente foram modeladas por meio de uma função de covariância com uso do polinômio de Legendre de segunda à quinta ordem. As variâncias residuais foram consideradas em 1, 4, 6 ou 10 classes de variância. O melhor modelo teve seis classes de variância residual. As estimativas de herdabilidade para os registros de PLDC variaram de 0.19 a 0.32. O modelo de regressão aleatória que utilizou o polinômio de Legendre de segunda ordem, quanto ao efeito genético aditivo, e o polinômio de quinta ordem, quanto ao efeito de ambiente permanente, é o mais adequado para a comparação dos principais critérios utilizados. O modelo que utilizou o polinômio de Legendre de segunda ordem, quanto ao efeito genético aditivo, e o de quarta ordem, quanto ao efeito de ambiente permanente, pode ser utilizado nestas análises.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Embrapa Gado de LeiteUniversidade Estadual Paulista Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Departamento de ZootecniaUniversidade Estadual Paulista Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Departamento de ZootecniaEmbrapa Informação TecnológicaPesquisa Agropecuária BrasileiraEmpresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA)Universidade Estadual Paulista (Unesp)Peixoto, Maria Gabriela Campolina DinizSantos, Daniel Jordan De AbreuBorquis, Rusbel Raul AspilcuetaBruneli, Frank Ângelo TomitaPanetto, João Cláudio Do CarmoTonhati, Humberto2015-02-02T12:39:39Z2015-02-02T12:39:39Z2014-05-01info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/article372-383application/pdfhttp://dx.doi.org/10.1590/S0100-204X2014000500007Pesquisa Agropecuária Brasileira. Embrapa Informação TecnológicaPesquisa Agropecuária Brasileira, v. 49, n. 5, p. 372-383, 2014.0100-204Xhttp://hdl.handle.net/11449/11457510.1590/S0100-204X2014000500007S0100-204X2014000500372S0100-204X2014000500372.pdf7445254960858159SciELOreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPengPesquisa Agropecuária Brasileira0.546info:eu-repo/semantics/openAccess2023-10-20T06:08:22Zoai:repositorio.unesp.br:11449/114575Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestopendoar:29462023-10-20T06:08:22Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false |
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The objective of this work was to compare random regression models for the estimation of genetic parameters for Guzerat milk production, using orthogonal Legendre polynomials. Records (20,524) of test-day milk yield (TDMY) from 2,816 first-lactation Guzerat cows were used. TDMY grouped into 10-monthly classes were analyzed for additive genetic effect and for environmental and residual permanent effects (random effects), whereas the contemporary group, calving age (linear and quadratic effects) and mean lactation curve were analized as fixed effects. Trajectories for the additive genetic and permanent environmental effects were modeled by means of a covariance function employing orthogonal Legendre polynomials ranging from the second to the fifth order. Residual variances were considered in one, four, six, or ten variance classes. The best model had six residual variance classes. The heritability estimates for the TDMY records varied from 0.19 to 0.32. The random regression model that used a second-order Legendre polynomial for the additive genetic effect, and a fifth-order polynomial for the permanent environmental effect is adequate for comparison by the main employed criteria. The model with a second-order Legendre polynomial for the additive genetic effect, and that with a fourth-order for the permanent environmental effect could also be employed in these analyses. |
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