Hibridização reversa e sequenciamento na genotipagem do vírus da hepatite C

• Autor(a) principal: Levada, Patrícia Martinez [UNESP]
• Data de Publicação: 2010
• Outros Autores: Moraes, Camila Fernanda Verdichio de [UNESP], Corvino, Silvia Maria [UNESP], Grotto, Rejane Maria Tommasini [UNESP], Silva, Giovanni Faria [UNESP], Pardini, Maria Ines de Moura Campos [UNESP]
• Tipo de documento: Artigo
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
• Texto Completo: http://dx.doi.org/10.1590/S0037-86822010000200006; http://hdl.handle.net/11449/11530
• topic: Vírus da hepatite C; Genotipagem; Hibridização reversa; Sequenciamento direto; Hepatitis C virus; Genotyping; Reverse hybridization; Direct sequencing

INTRODUÇÃO: Os métodos de genotipagem do vírus da hepatite C têm sido muito discutidos. O objetivo deste trabalho foi comparar as metodologias de hibridização reversa e sequenciamento direto para a genotipagem do vírus da hepatite C. MÉTODOS: Noventa e uma amostras de plasma de pacientes assistidos na Faculdade de Medicina de Botucatu da Universidade Estadual Paulista foram utilizadas. A genotipagem por hibridização reversa foi realizada utilizando o kit comercial INNO-LiPA® v.1.0. O sequenciamento direto foi efetuado em sequenciador automático utilizando protocolos in house. RESULTADOS: A genotipagem por sequenciamento direto mostrou-se eficiente na resolução dos resultados inconclusivos pelo kit comercial. O kit mostrou resultados errôneos em relação à subtipagem viral. Além disso, a genotipagem por sequenciamento direto revelou um erro do kit com relação à determinação genotípica questionando a eficiência do método também para a identificação do genótipo viral. CONCLUSÕES: A genotipagem realizada por meio de sequenciamento direto permite uma maior acurácia na classificação viral quando comparada à hibridização reversa.