Perfil transcricional do gene HLA-E: transcritos alternativos pela retenção de sequências intrônicas

• Autor(a) principal: Silva, Isabelle Mira da
• Data de Publicação: 2023
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/11449/243870
• topic: HLA-E; Perfil transcricional; Perfil de expressão; Isoformas

O Antígeno Leucocitário Humano (HLA)-E é a molécula de HLA de classe I menos polimórfica dentre outras do mesmo grupo, na qual encontra-se geralmente ancorada à superfície das APCs e estando envolvida em processos de imunorregulação de células Natural Killer (NK) e T, por meio da interação com os receptores ativadores (CD94/NKG2C) e inibidores (CD94/NKG2A). Para além da estrutura ancorada, diversos estudos relatam a presença de isoformas solúveis em contextos inflamatórios e relacionados à progressão de quadros clínicos ligados à desordens psiquiátricas como a Esquizofrenia e Bipolaridade, contudo não descrevendo como poderiam ser originadas. Analisando a sequência nucleotídica original e as com retenção intrônica, verificamos seu impacto em regiões da sequência peptídica ligadas à síntese de isoformas solúveis. Utilizamos as sequências genômicas, exônicas e intrônicas presentes no banco de dados IPD-IMGT/HLA e EMBL-EBI/Emboss Transeq para traduzir em sequências de aminoácidos e o banco de dados GEUVADIS para comparar e inferir a frequência dessas sequências em 460 amostras de 5 populações diferentes abrangidas pela base de dados. No final, pesquisamos na literatura quais aminoácidos estariam envolvidos na interação ligante-receptor da célula NK. Ao compararmos todas as informações, descobrimos que a retenção de íntron 1 leva à produção de um códon de parada prematuro no mesmo íntron, resultando em uma proteína não funcional. A retenção de íntron 2 leva a um códon de parada prematuro no início do íntron 2, produzindo uma proteína com o domínio alfa-1. A retenção do íntron 3 leva a produção de códon de parada no mesmo íntron e a produção de uma molécula com o domínio alfa-1 e -2. A retenção de íntron 4 leva à produção de uma molécula HLA-E maior, sem região transmembrana, mas com a presença de todos os domínios externos (alfa-1 ao alfa-3). Em todos os casos de retenção intrônica, o peptídeo líder é mantido e a isoforma pode migrar para a membrana celular. No entanto, como não existe domínio transmembrana, essas isoformas podem ser liberadas como solúvel. Tendo em vista as isoformas com alfa-1 e -2 produzidas pela retenção de íntron 3 e 4, há possibilidade de interação com o NKG2A e CD94, como habitualmente, contudo o domínio alfa-1 produzido por retenção de íntron 2, pode interagir apenas com o CD94. Com isso, a possível molécula isoforma solúvel produzida por estas diferentes sequências poderiam ter mais do que um tipo de estrutura.