Mapping quantitative trait loci in Gallus gallus using principal components

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Pinto, Luís Fernando Batista
Data de Publicação: 2010
Outros Autores: Packer, Irineu Umberto, Ledur, Mônica Corrêa, Moura, Ana Silvia Alves Meira Tavares [UNESP], Nones, Kátia, Coutinho, Luiz Lehmann
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
Texto Completo: http://dx.doi.org/10.1590/S1516-35982010001100016
http://hdl.handle.net/11449/14405
Resumo: Este estudo teve por objetivo mapear QTL (quantitative trait loci) utilizando combinações lineares de características de interesse econômico em Gallus gallus. Foram estudadas 350 aves F2 oriundas de um cruzamento inicial entre machos de uma linhagem de corte (TT) e fêmeas de uma linhagem de postura (CC). Foi conduzido mapeamento de QTL nos cromossomos Gallus gallus (GGA1, GGA3, GGA5, GGA8, GGA11 e GGA13), para 20 características de desempenho e de carcaça. Para detectar QTL foi utilizado o teste da razão de verossimilhanças entre um modelo reduzido (incluindo efeitos fixos de sexo, incubação e o efeito aleatório de valor genético infinitesimal) e um completo (incluindo todos os efeitos anteriores mais os efeitos de QTL). Ao analisar as características originais, ou seja, antes da formação das combinações lineares, foram mapeados seis QTLs significativos a 1% no genoma, quatro no GGA1 (peso vivo aos 35 dias, peso vivo aos 42 dias, gordura abdominal e peso do coração) e dois no GGA3 (peso vivo aos 35 e aos 42 dias de idade); três QTLs significativos a 5% no genoma, sendo um no GGA1 (peso da cabeça), um no GGA3 (peso das asas), e um no GGA8 (peso da moela); além de sete ligações sugestivas para diversas características. Ao mapear QTLs para os componentes principais, foram confirmados vários QTLs mapeados para as características originais, além de encontrar três QTLs e oito ligações sugestivas não mapeadas para as características originais.
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spelling Mapping quantitative trait loci in Gallus gallus using principal componentsMapeamento de locos de características quantitativas em Gallus gallus com utilização de componentes principaisfrangosgalinhagenomavariáveis canônicasbroilerscanonical variableschickensgenomeEste estudo teve por objetivo mapear QTL (quantitative trait loci) utilizando combinações lineares de características de interesse econômico em Gallus gallus. Foram estudadas 350 aves F2 oriundas de um cruzamento inicial entre machos de uma linhagem de corte (TT) e fêmeas de uma linhagem de postura (CC). Foi conduzido mapeamento de QTL nos cromossomos Gallus gallus (GGA1, GGA3, GGA5, GGA8, GGA11 e GGA13), para 20 características de desempenho e de carcaça. Para detectar QTL foi utilizado o teste da razão de verossimilhanças entre um modelo reduzido (incluindo efeitos fixos de sexo, incubação e o efeito aleatório de valor genético infinitesimal) e um completo (incluindo todos os efeitos anteriores mais os efeitos de QTL). Ao analisar as características originais, ou seja, antes da formação das combinações lineares, foram mapeados seis QTLs significativos a 1% no genoma, quatro no GGA1 (peso vivo aos 35 dias, peso vivo aos 42 dias, gordura abdominal e peso do coração) e dois no GGA3 (peso vivo aos 35 e aos 42 dias de idade); três QTLs significativos a 5% no genoma, sendo um no GGA1 (peso da cabeça), um no GGA3 (peso das asas), e um no GGA8 (peso da moela); além de sete ligações sugestivas para diversas características. Ao mapear QTLs para os componentes principais, foram confirmados vários QTLs mapeados para as características originais, além de encontrar três QTLs e oito ligações sugestivas não mapeadas para as características originais.This study aimed at mapping QTL (quantitative trait loci) using linear combinations of characteristics of economical interest in Gallus gallus. A total of 350 F2 chickens from an initial crossing among males from a broiler line (TT) with females from a layer line (CC) were used. It was conducted a QTL mapping in chromosomes of Gallus gallus (GGA1, GGA3, GGA5, GGA8, GGA11, and GGA13) for 20 performance and carcass traits. For detecting QTL, it was used the likelihood ratio test between a reduced model (including fixed effects of sex, hatch and random effect of infinitesimal genetic value) and a full model (including all the previous effects plus QTL effects). When original characterists were analyzed, that is, before the formation of linear combinations, six significant QTLs were mapped at 1% in the genome, four in the GGA1 (live weight at 35 days of age and at 42 days of age, abdominal fat and heart weight); and two on GGA3 (live weight at 35 and 42 days of age); three significant QTLs at 5% in the genome, one on GGA1 (head weight), one on GGA3 (wings weight), and one on GGA8 (gizzard weight); besides seven suggestive linkages for several traits. When QTLs were mapped for principal components, many mapped QTLs were confirmed for original traits, in addition to finding three QTLs and eight suggestive linkages not mapped for the original traits.Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA)Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)UFBA Escola de Medicina Veterinária Departamento de Produção AnimalUSP ESALQ Departamento de ZootecniaEmpresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA) Suínos e AvesUNESP FMVZ Departamento de Produção AnimalUNESP FMVZ Departamento de Produção AnimalSociedade Brasileira de ZootecniaUniversidade Federal da Bahia (UFBA)Universidade de São Paulo (USP)Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA)Universidade Estadual Paulista (Unesp)Pinto, Luís Fernando BatistaPacker, Irineu UmbertoLedur, Mônica CorrêaMoura, Ana Silvia Alves Meira Tavares [UNESP]Nones, KátiaCoutinho, Luiz Lehmann2013-09-30T18:28:22Z2014-05-20T13:41:35Z2013-09-30T18:28:22Z2014-05-20T13:41:35Z2010-11-01info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/article2434-2441application/pdfhttp://dx.doi.org/10.1590/S1516-35982010001100016Revista Brasileira de Zootecnia. Sociedade Brasileira de Zootecnia, v. 39, n. 11, p. 2434-2441, 2010.1516-3598http://hdl.handle.net/11449/1440510.1590/S1516-35982010001100016S1516-35982010001100016WOS:000285102800016S1516-35982010001100016.pdfSciELOreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPengRevista Brasileira de Zootecnia0,337info:eu-repo/semantics/openAccess2023-10-20T06:03:39Zoai:repositorio.unesp.br:11449/14405Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestopendoar:29462023-10-20T06:03:39Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
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